More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0011 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0011  50S ribosomal protein L14P  100 
 
 
132 aa  260  4.999999999999999e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000740699  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0100  50S ribosomal protein L14P  83.33 
 
 
132 aa  229  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.280775  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1718  50S ribosomal protein L14P  72.73 
 
 
132 aa  200  4e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000365895  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0091  50S ribosomal protein L14P  62.12 
 
 
132 aa  184  3e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.474455 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0542  50S ribosomal protein L14P  62.12 
 
 
132 aa  176  7e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.699463  normal  0.487826 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0452  50S ribosomal protein L14P  59.09 
 
 
132 aa  175  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0250914  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2243  50S ribosomal protein L14P  59.09 
 
 
132 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000537709  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0574  50S ribosomal protein L14P  58.33 
 
 
132 aa  167  5e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.646818  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1394  50S ribosomal protein L14P  61.07 
 
 
132 aa  166  1e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2228  50S ribosomal protein L14P  58.33 
 
 
132 aa  165  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2439  50S ribosomal protein L14P  59.85 
 
 
132 aa  164  2.9999999999999998e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0220  50S ribosomal protein L14P  57.58 
 
 
132 aa  164  4e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0654  50S ribosomal protein L14P  59.54 
 
 
132 aa  163  8e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0000102668  decreased coverage  0.0000588406 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1264  50S ribosomal protein L14P  58.78 
 
 
132 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000712671  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0169  50S ribosomal protein L14P  58.78 
 
 
132 aa  161  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000775271  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1838  50S ribosomal protein L14P  56.82 
 
 
132 aa  161  3e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.890831 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0720  50S ribosomal protein L14P  58.02 
 
 
132 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00745275  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2302  50S ribosomal protein L14P  55.3 
 
 
132 aa  158  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1511  50S ribosomal protein L14P  56.82 
 
 
135 aa  152  1e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  7.30331e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1768  50S ribosomal protein L14P  52.31 
 
 
138 aa  141  3e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0101  50S ribosomal protein L14P  50 
 
 
138 aa  134  3.0000000000000003e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000731136  unclonable  0.000000456679 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0483  50S ribosomal protein L14P  49.57 
 
 
141 aa  134  5e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.186815  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0800  50S ribosomal protein L14b/L23e  48.84 
 
 
140 aa  133  6.0000000000000005e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.276412 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04494  hypothetical protein similar to AGL288Wp (Broad)  50 
 
 
140 aa  131  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0435617 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1330  50S ribosomal protein L14P  53.85 
 
 
144 aa  124  5e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.293938  normal  0.208543 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50259  predicted protein  46.92 
 
 
143 aa  124  5e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.254576  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03100  60s ribosomal protein l23, putative  46.92 
 
 
138 aa  122  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0513  50S ribosomal protein L14P  53.85 
 
 
144 aa  120  6e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0581321 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1596  50S ribosomal protein L14P  52.99 
 
 
144 aa  120  9e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89371  predicted protein  43.08 
 
 
137 aa  119  9.999999999999999e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1784  50S ribosomal protein L14P  52.14 
 
 
144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18267  Ribosomal protein L23, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  43.08 
 
 
140 aa  118  3e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0410361  normal  0.0407841 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1682  50S ribosomal protein L14P  51.28 
 
 
144 aa  116  9e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.810973  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01270  ribosomal protein L14  39.2 
 
 
122 aa  81.6  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.630309  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0777  50S ribosomal protein L14  45.45 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0816328  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0780  ribosomal protein L14  41.88 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1174  ribosomal protein L14  42.98 
 
 
122 aa  80.9  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00146372  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1350  ribosomal protein L14  39.17 
 
 
122 aa  79  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1175  50S ribosomal protein L14  42.5 
 
 
122 aa  78.2  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.095268  normal  0.185829 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3457  50S ribosomal protein L14  45.3 
 
 
122 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000989644  decreased coverage  0.00422034 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2749  50S ribosomal protein L14  45.3 
 
 
122 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000157249  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2323  ribosomal protein L14  45.95 
 
 
122 aa  77.8  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000119223  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0358  50S ribosomal protein L14  45.3 
 
 
122 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000852888  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0337  50S ribosomal protein L14  45.3 
 
 
122 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000775128  normal  0.0104163 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05770  ribosomal protein L14  39.2 
 
 
122 aa  77.4  0.00000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4016  50S ribosomal protein L14  42.5 
 
 
122 aa  77  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0331608  hitchhiker  0.0000209267 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09900  LSU ribosomal protein L14P  44.14 
 
 
122 aa  77  0.00000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0142429  hitchhiker  0.00000177092 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0236  50S ribosomal protein L14  42.24 
 
 
122 aa  76.6  0.00000000000009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6039  50S ribosomal protein L14  42.15 
 
 
122 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0289  50S ribosomal protein L14  44.44 
 
 
122 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111281  hitchhiker  0.00000195891 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4924  ribosomal protein L14  39.81 
 
 
122 aa  76.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00747276  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0277  50S ribosomal protein L14  44.44 
 
 
122 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000632835  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0286  50S ribosomal protein L14  44.44 
 
 
122 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000002438  normal  0.0225309 
 
 
-
 
NC_002936  DET0484  50S ribosomal protein L14  39.17 
 
 
122 aa  75.9  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196893  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0259  ribosomal protein L14  44.44 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00518224  hitchhiker  0.00445283 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3794  50S ribosomal protein L14  44.44 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3159  50S ribosomal protein L14  44.44 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000901692  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl133  50S ribosomal protein L14  40.16 
 
 
122 aa  75.9  0.0000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2622  50S ribosomal protein L14  44.44 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.328806  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3766  50S ribosomal protein L14  44.44 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000108255  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3488  50S ribosomal protein L14  44.44 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00137445  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0963  50S ribosomal protein L14  41.03 
 
 
122 aa  75.9  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217231  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3058  50S ribosomal protein L14  44.44 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000279075  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0461  50S ribosomal protein L14  39.17 
 
 
122 aa  75.9  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117525  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1934  50S ribosomal protein L14  44.44 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000033095  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3736  50S ribosomal protein L14  44.44 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000183624  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_427  ribosomal protein L14  39.17 
 
 
122 aa  75.9  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1565  50S ribosomal protein L14  38.4 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1128  50S ribosomal protein L14  43.24 
 
 
122 aa  75.1  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0430219  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0068  50S ribosomal protein L14  44.34 
 
 
122 aa  75.1  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.390446  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3014  50S ribosomal protein L14  40 
 
 
122 aa  75.1  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0637161  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2678  50S ribosomal protein L14P  43.97 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0686  50S ribosomal protein L14  38.52 
 
 
122 aa  74.7  0.0000000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1302  50S ribosomal protein L14  40.83 
 
 
122 aa  74.7  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1384  50S ribosomal protein L14  40.83 
 
 
122 aa  74.7  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000822769  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0387  50S ribosomal protein L14  40.17 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1514  50S ribosomal protein L14  42.61 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.364182  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2145  50S ribosomal protein L14P  42.06 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0311872  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1157  50S ribosomal protein L14  39.32 
 
 
122 aa  73.9  0.0000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000242417  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0718  50S ribosomal protein L14  41.88 
 
 
122 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248999  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2829  50S ribosomal protein L14  44.44 
 
 
122 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000599827  normal  0.375026 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3328  ribosomal protein L14  41.88 
 
 
122 aa  73.6  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000964027  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2897  ribosomal protein L14  43.1 
 
 
122 aa  73.6  0.0000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0316  50S ribosomal protein L14  38.84 
 
 
122 aa  73.6  0.0000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00174277 
 
 
-
 
NC_002620  TC0805  50S ribosomal protein L14  39.67 
 
 
122 aa  72.8  0.000000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.000675235  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3009  50S ribosomal protein L14  42.15 
 
 
122 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000263087  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0117  50S ribosomal protein L14  39.67 
 
 
122 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2940  50S ribosomal protein L14  42.15 
 
 
122 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00000158675  hitchhiker  0.00000386502 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4311  ribosomal protein L14  38.02 
 
 
122 aa  72.8  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.212373  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3287  50S ribosomal protein L14  42.15 
 
 
122 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.00000000157529  decreased coverage  0.000000579661 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04080  LSU ribosomal protein L14P  40.5 
 
 
122 aa  73.2  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1302  50S ribosomal protein L14  38.02 
 
 
122 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.704063  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0592  50S ribosomal protein L14  40.5 
 
 
122 aa  73.6  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0941  ribosomal protein L14  39.67 
 
 
122 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0897119  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0296  ribosomal protein L14  37.6 
 
 
122 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000987094  normal  0.0625902 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2450  50S ribosomal protein L14  40 
 
 
122 aa  72.4  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.313551 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0408  ribosomal protein L14  36.67 
 
 
122 aa  72.4  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.900032  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4305  50S ribosomal protein L14  40.5 
 
 
122 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.59616  normal  0.0114507 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3634  50S ribosomal protein L14  43.97 
 
 
122 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000265489  decreased coverage  0.00000000000145163 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0225  50S ribosomal protein L14  37.9 
 
 
122 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000052608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>