More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0097 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0097  thioredoxin  100 
 
 		 149 aa  310  3.9999999999999997e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0227  thioredoxin  51.54 
 
 		 138 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.589442  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0588  thioredoxin  47.06 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.99153  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2493  thioredoxin  48.09 
 
 		 154 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1670  thioredoxin  44.53 
 
 		 131 aa  121  4e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0711  thioredoxin  40.15 
 
 		 138 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  52.58 
 
 		 105 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  55.42 
 
 		 223 aa  107  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  37.9 
 
 		 135 aa  106  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4710  thioredoxin  45.45 
 
 		 105 aa  106  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.015363  normal  0.0508397 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  48.89 
 
 		 115 aa  106  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  52.27 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  49.5 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  45.16 
 
 		 108 aa  104  5e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  44.21 
 
 		 107 aa  104  5e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  42.99 
 
 		 238 aa  104  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  46.07 
 
 		 107 aa  103  8e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  38.83 
 
 		 114 aa  103  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  38.61 
 
 		 106 aa  102  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  48.86 
 
 		 109 aa  102  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  48.39 
 
 		 108 aa  103  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  48.31 
 
 		 105 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  48 
 
 		 105 aa  102  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  43.16 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  43.16 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  42.72 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  48.31 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  47.73 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  43.16 
 
 		 107 aa  101  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  41.75 
 
 		 109 aa  101  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  40 
 
 		 257 aa  101  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  41.18 
 
 		 108 aa  101  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  45.54 
 
 		 105 aa  101  4e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  40.78 
 
 		 109 aa  100  5e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  40.57 
 
 		 114 aa  100  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  37.62 
 
 		 110 aa  100  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  45.45 
 
 		 113 aa  100  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  40.78 
 
 		 109 aa  100  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0243  thioredoxin  41.67 
 
 		 109 aa  100  8e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122972  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0776  thioredoxin  38.4 
 
 		 138 aa  99.4  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.116689 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  40.4 
 
 		 107 aa  99.8  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  52.5 
 
 		 104 aa  99.4  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  42.22 
 
 		 105 aa  99.8  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  44.44 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  39.25 
 
 		 109 aa  99.4  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  46.43 
 
 		 259 aa  98.6  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  38.68 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  44.68 
 
 		 110 aa  99.4  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  52.5 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  44.12 
 
 		 108 aa  98.2  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  43.75 
 
 		 110 aa  97.8  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  44.19 
 
 		 107 aa  98.2  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3718  thioredoxin  44.21 
 
 		 110 aa  98.2  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120291  hitchhiker  0.00138865 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  44.32 
 
 		 259 aa  97.8  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  46.51 
 
 		 107 aa  97.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  40.4 
 
 		 107 aa  97.8  5e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  50 
 
 		 104 aa  97.4  5e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  46.51 
 
 		 107 aa  97.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  42.27 
 
 		 110 aa  97.8  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  40.4 
 
 		 107 aa  97.8  5e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  48.75 
 
 		 104 aa  97.1  7e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  43.01 
 
 		 107 aa  97.1  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  43.01 
 
 		 107 aa  97.1  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  42.86 
 
 		 107 aa  97.1  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  42.86 
 
 		 107 aa  97.1  7e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  48.75 
 
 		 104 aa  97.1  7e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  40.4 
 
 		 107 aa  97.1  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  48.75 
 
 		 104 aa  97.1  7e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  45.16 
 
 		 109 aa  97.1  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  39.39 
 
 		 107 aa  96.7  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  43.96 
 
 		 107 aa  96.7  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  39.39 
 
 		 107 aa  96.7  9e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  39.39 
 
 		 107 aa  96.7  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  47.13 
 
 		 107 aa  96.3  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  44.44 
 
 		 110 aa  96.3  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  46.32 
 
 		 106 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  46.32 
 
 		 106 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  43.96 
 
 		 107 aa  95.9  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  41.24 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  39.8 
 
 		 148 aa  95.9  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  47.67 
 
 		 106 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  43.01 
 
 		 107 aa  95.9  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  42.86 
 
 		 109 aa  95.5  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0028  thioredoxin  43.75 
 
 		 106 aa  95.5  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  45.05 
 
 		 107 aa  95.9  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  46.32 
 
 		 106 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  41.76 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  44.32 
 
 		 109 aa  94.7  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  43.48 
 
 		 108 aa  94.7  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  42.22 
 
 		 109 aa  94.4  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2861  thioredoxin 2  39.83 
 
 		 139 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350907  normal  0.503198 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2759  thioredoxin 2  39.83 
 
 		 139 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00143779  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  43.96 
 
 		 107 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0044  thioredoxin  32.54 
 
 		 139 aa  94.4  5e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2865  thioredoxin 2  39.83 
 
 		 139 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0216262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  45.88 
 
 		 107 aa  94.4  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2843  thioredoxin 2  39.83 
 
 		 139 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  39.83 
 
 		 139 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  44.21 
 
 		 123 aa  94  6e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3439  thioredoxin  43.48 
 
 		 106 aa  93.6  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>