More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3434 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3434  heat shock protein GrpE  100 
 
 		 209 aa  425  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398988  normal  0.0620931 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  50.94 
 
 		 191 aa  161  6e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  39.01 
 
 		 200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  42.45 
 
 		 213 aa  115  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  36.61 
 
 		 181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  34.36 
 
 		 204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  42.14 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  35.36 
 
 		 194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0564  GrpE protein  33.66 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0648  GrpE protein  37.59 
 
 		 188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1206  GrpE protein  38.04 
 
 		 180 aa  108  7.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.390676  hitchhiker  0.00686163 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  37.68 
 
 		 210 aa  108  8.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  41.04 
 
 		 208 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  36.03 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  32.28 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  32.18 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  40.24 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  35.53 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  33.54 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  39.29 
 
 		 199 aa  106  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  31.82 
 
 		 217 aa  105  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  36 
 
 		 210 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  37.58 
 
 		 192 aa  105  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  41.98 
 
 		 195 aa  105  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  38.52 
 
 		 243 aa  105  7e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  37.88 
 
 		 192 aa  104  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0129  GrpE protein  38.61 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.628751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  40.3 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  34.83 
 
 		 181 aa  102  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  37.12 
 
 		 192 aa  101  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  28.83 
 
 		 221 aa  101  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  35.51 
 
 		 188 aa  101  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  37.12 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  33.8 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  33.1 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  33.1 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  37.4 
 
 		 225 aa  99  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  40.58 
 
 		 225 aa  99  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1062  GrpE protein  36.17 
 
 		 169 aa  99  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0506342  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0944  hypothetical protein  37.16 
 
 		 201 aa  99  5e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.104305  normal  0.177983 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  36.36 
 
 		 188 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  36.36 
 
 		 188 aa  98.6  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  36.36 
 
 		 188 aa  98.6  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  36.36 
 
 		 188 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  36.36 
 
 		 188 aa  98.6  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  36.36 
 
 		 188 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  36.36 
 
 		 188 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  32.22 
 
 		 187 aa  98.6  6e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  35.77 
 
 		 204 aa  98.6  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  36.36 
 
 		 188 aa  98.6  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  33.14 
 
 		 181 aa  98.2  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3208  GrpE protein  33.67 
 
 		 204 aa  98.2  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718226  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  34.01 
 
 		 282 aa  97.4  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2877  heat shock protein GrpE  35.07 
 
 		 196 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2897  heat shock protein GrpE  35.07 
 
 		 196 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2895  heat shock protein GrpE  35.07 
 
 		 196 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2828  heat shock protein GrpE  35.07 
 
 		 241 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000182531  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3010  heat shock protein GrpE  35.07 
 
 		 250 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  36.3 
 
 		 198 aa  96.3  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  30.27 
 
 		 204 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 186 aa  95.9  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2172  GrpE protein  36.17 
 
 		 224 aa  95.9  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.316744  normal  0.405788 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0016  GrpE protein  38.06 
 
 		 174 aa  95.9  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0339785  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  30.61 
 
 		 200 aa  95.5  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  31.35 
 
 		 194 aa  95.5  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  33.16 
 
 		 190 aa  95.5  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  31.35 
 
 		 210 aa  95.1  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  34.56 
 
 		 198 aa  94.4  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  31.33 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  30.11 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2766  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 196 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000506874  normal  0.0900785 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0529  co-chaperone GrpE  35.51 
 
 		 187 aa  93.2  2e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.914773  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  36.54 
 
 		 172 aa  93.6  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  40 
 
 		 178 aa  93.6  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0764  GrpE protein  35.34 
 
 		 187 aa  94  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  31.06 
 
 		 260 aa  92.8  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02502  heat shock protein  32.79 
 
 		 197 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000506013  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1061  Ribulose-phosphate 3-epimerase  32.79 
 
 		 197 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000037652  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02466  hypothetical protein  32.79 
 
 		 197 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000587917  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2898  heat shock protein GrpE  32.79 
 
 		 196 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000538048  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0415  GrpE protein  29.76 
 
 		 202 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3853  heat shock protein GrpE  32.79 
 
 		 197 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000510847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3002  heat shock protein GrpE  32.79 
 
 		 197 aa  92.4  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.86694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1070  heat shock protein GrpE  32.79 
 
 		 197 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  0.0707842 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  37.68 
 
 		 242 aa  92.4  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  33.33 
 
 		 189 aa  92.4  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2772  heat shock protein GrpE  32.79 
 
 		 197 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.080719999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2350  GrpE protein  30.6 
 
 		 185 aa  92  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0621  GrpE protein  41.55 
 
 		 189 aa  91.7  7e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000112666  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  31.85 
 
 		 217 aa  91.7  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  27.38 
 
 		 202 aa  91.3  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  34.17 
 
 		 246 aa  91.3  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  33.14 
 
 		 173 aa  90.9  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00570  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  34.53 
 
 		 179 aa  90.5  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  27.38 
 
 		 202 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  32.65 
 
 		 225 aa  90.1  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  35.9 
 
 		 172 aa  90.5  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  30.98 
 
 		 209 aa  90.1  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3071  GrpE protein  31.47 
 
 		 238 aa  90.1  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.215635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  33.17 
 
 		 231 aa  89.4  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>