More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0541 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 423 aa  875    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  60.76 
 
 		 424 aa  519  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  59.2 
 
 		 424 aa  512  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  56.74 
 
 		 423 aa  504  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  58.13 
 
 		 422 aa  502  1e-141  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  56.8 
 
 		 424 aa  497  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  57.04 
 
 		 423 aa  495  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  56.32 
 
 		 424 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  56.32 
 
 		 424 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  56.32 
 
 		 424 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  56.32 
 
 		 424 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  56.32 
 
 		 424 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  56.91 
 
 		 427 aa  493  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  56.32 
 
 		 424 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  58.61 
 
 		 424 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  58.17 
 
 		 420 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  56.09 
 
 		 424 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  56.56 
 
 		 424 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  57.07 
 
 		 425 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  58.25 
 
 		 422 aa  491  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  56.32 
 
 		 424 aa  491  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  56.32 
 
 		 424 aa  491  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  58.16 
 
 		 423 aa  488  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  56.5 
 
 		 427 aa  487  1e-136  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  56.16 
 
 		 423 aa  481  1e-135  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  56.6 
 
 		 425 aa  482  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  57.21 
 
 		 422 aa  481  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  54.95 
 
 		 422 aa  478  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  53.16 
 
 		 427 aa  478  1e-134  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  55.85 
 
 		 424 aa  478  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  56.83 
 
 		 423 aa  479  1e-134  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  55.64 
 
 		 421 aa  481  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  56.47 
 
 		 427 aa  480  1e-134  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  55.66 
 
 		 422 aa  476  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  56.84 
 
 		 423 aa  476  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  56.24 
 
 		 423 aa  476  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  53.05 
 
 		 425 aa  472  1e-132  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  55.19 
 
 		 422 aa  473  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  54.95 
 
 		 422 aa  473  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  55.08 
 
 		 427 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  56.83 
 
 		 417 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  55.19 
 
 		 424 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  54.5 
 
 		 425 aa  468  1.0000000000000001e-131  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  54.44 
 
 		 425 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  55.69 
 
 		 422 aa  465  9.999999999999999e-131  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  51.65 
 
 		 426 aa  464  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  55.29 
 
 		 432 aa  463  1e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  53.11 
 
 		 423 aa  463  1e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  54.42 
 
 		 427 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  53.32 
 
 		 425 aa  457  1e-127  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  55.13 
 
 		 425 aa  454  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26270  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 428 aa  454  1.0000000000000001e-126  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  53.54 
 
 		 426 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0014  seryl-tRNA synthetase  54.89 
 
 		 425 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  52.63 
 
 		 426 aa  448  1e-125  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3466  seryl-tRNA synthetase  51.66 
 
 		 424 aa  444  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  53.54 
 
 		 423 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1494  seryl-tRNA synthetase  50.83 
 
 		 424 aa  438  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.457179 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1073  seryl-tRNA synthetase  50.94 
 
 		 430 aa  439  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441533 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2991  seryl-tRNA synthetase  48.74 
 
 		 429 aa  435  1e-121  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1621  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 436 aa  436  1e-121  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00511187  normal  0.0677576 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0550  seryl-tRNA synthetase  50.72 
 
 		 421 aa  432  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0012144  hitchhiker  0.0000582933 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2307  seryl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 424 aa  432  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0380  seryl-tRNA synthetase  50.72 
 
 		 421 aa  432  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  49.53 
 
 		 435 aa  429  1e-119  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000017376  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  48.18 
 
 		 427 aa  430  1e-119  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 		 428 aa  426  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  50.24 
 
 		 425 aa  425  1e-118  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 424 aa  426  1e-118  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1828  seryl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 430 aa  425  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03450  seryl-tRNA synthetase  49.42 
 
 		 427 aa  425  1e-118  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2729  seryl-tRNA synthetase  50.94 
 
 		 426 aa  424  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  50.48 
 
 		 421 aa  424  1e-117  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1426  seryl-tRNA synthetase  48.59 
 
 		 426 aa  424  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0522014  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0577  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 		 413 aa  420  1e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4645  seryl-tRNA synthetase  52.11 
 
 		 424 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000263094  normal  0.52654 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 428 aa  420  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 428 aa  420  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1724  seryl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 426 aa  415  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0550  seryl-tRNA synthetase  48.8 
 
 		 413 aa  413  1e-114  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 		 425 aa  413  1e-114  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  48.13 
 
 		 431 aa  413  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1565  seryl-tRNA synthetase  48.02 
 
 		 433 aa  412  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.382494  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2986  seryl-tRNA synthetase  48.6 
 
 		 433 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.340897  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2419  seryl-tRNA synthetase  48.6 
 
 		 433 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1765  seryl-tRNA synthetase  50.47 
 
 		 431 aa  414  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3186  seryl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 427 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3435  seryl-tRNA synthetase  47.9 
 
 		 431 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2932  seryl-tRNA synthetase  50.47 
 
 		 427 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0182  seryl-tRNA synthetase  50.81 
 
 		 435 aa  412  1e-114  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.38997  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0794  seryl-tRNA synthetase  48.36 
 
 		 433 aa  411  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0642  seryl-tRNA synthetase  48.39 
 
 		 432 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2594  seryl-tRNA synthetase  46.33 
 
 		 434 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365068  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0454  seryl-tRNA synthetase  48.21 
 
 		 423 aa  410  1e-113  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.730155  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0851  seryl-tRNA synthetase  47.9 
 
 		 433 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2626  seryl-tRNA synthetase  48.36 
 
 		 433 aa  411  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18292  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2731  seryl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 423 aa  409  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104172 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0839  seryl-tRNA synthetase  47.9 
 
 		 433 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0440  seryl-tRNA synthetase  49.43 
 
 		 439 aa  408  1e-113  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0979  seryl-tRNA synthetase  47.66 
 
 		 433 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>