More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2656 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2656  cytochrome c, class I  100 
 
 
213 aa  442  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.964453  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3327  cytochrome c, class I  40.2 
 
 
206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000098516 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0064  putative cytochrome C precursor  36.79 
 
 
222 aa  128  7.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215607  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0594  cytochrome c class I  31.28 
 
 
218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0615  cytochrome c, class I  31.67 
 
 
218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  38.66 
 
 
196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  34.23 
 
 
219 aa  111  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  37.36 
 
 
223 aa  106  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  33.15 
 
 
200 aa  104  8e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0618  cytochrome c, class I  37.44 
 
 
212 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  35.96 
 
 
207 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  35.47 
 
 
207 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0913  cytochrome c, class I  35.11 
 
 
212 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.826925  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  35.47 
 
 
207 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  33.33 
 
 
217 aa  102  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  35.37 
 
 
225 aa  102  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0984  cytochrome c, class I  36.99 
 
 
242 aa  102  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.336073  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  33.91 
 
 
217 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  36.56 
 
 
207 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  36.56 
 
 
207 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  36.56 
 
 
207 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0810  putative cytochrome c4 precursor  40.12 
 
 
198 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0281  cytochrome c class I  35.26 
 
 
217 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  36.05 
 
 
220 aa  100  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  36.56 
 
 
207 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0359  cytochrome c class I  35.26 
 
 
217 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4839  cytochrome c, class I  35.71 
 
 
212 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.173442  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2727  cytochrome c, class I  35.26 
 
 
217 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0380  cytochrome c, class I  35.26 
 
 
217 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3479  cytochrome c, class I  35.26 
 
 
217 aa  99.4  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1131  cytochrome c class I  36.59 
 
 
222 aa  99  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  34.66 
 
 
201 aa  99  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  36.17 
 
 
207 aa  97.8  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0308  cytochrome c class I  34.68 
 
 
217 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618372  normal  0.165447 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0299  cytochrome c, class I  34.68 
 
 
217 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  33.51 
 
 
207 aa  97.4  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  33.72 
 
 
265 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2599  cytochrome c family protein  33.72 
 
 
215 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3772  cytochrome c family protein  33.72 
 
 
206 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0383758  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  33.73 
 
 
205 aa  97.1  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3510  cytochrome c family protein  33.72 
 
 
206 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  35.16 
 
 
205 aa  96.7  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3191  cytochrome c, class I  36.71 
 
 
219 aa  97.1  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  31.25 
 
 
217 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3137  cytochrome c family protein  33.72 
 
 
265 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3714  cytochrome c family protein  33.72 
 
 
206 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0394  cytochrome c class I  34.94 
 
 
209 aa  96.3  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  30.22 
 
 
207 aa  96.3  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  32.93 
 
 
208 aa  96.3  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  33.88 
 
 
229 aa  96.3  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  34.3 
 
 
265 aa  95.9  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0085  cytochrome c553-like protein  33.33 
 
 
246 aa  95.5  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5681  cytochrome c class I  33.72 
 
 
226 aa  95.5  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.670247  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3284  cytochrome c, class I  32.88 
 
 
219 aa  95.1  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5589  cytochrome c class I  35.71 
 
 
255 aa  94.7  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.6296 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5803  cytochrome c class I  35.29 
 
 
179 aa  94  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  0.316784 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3745  cytochrome C  33.72 
 
 
545 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110713  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  34.73 
 
 
209 aa  94.4  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  33.33 
 
 
207 aa  94  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0312  putative cytochrome c4 precursor  37.87 
 
 
193 aa  94  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717329 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2894  cytochrome c, class I  29.41 
 
 
226 aa  93.2  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  35.05 
 
 
220 aa  92.4  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  33.15 
 
 
205 aa  92  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  33.15 
 
 
205 aa  92  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  35.12 
 
 
206 aa  92  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  33.15 
 
 
205 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4451  cytochrome c class I  37.5 
 
 
168 aa  91.3  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.676804  normal  0.145709 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5418  cytochrome c, class I  36.31 
 
 
200 aa  91.3  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  32.56 
 
 
318 aa  90.9  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  34.48 
 
 
211 aa  90.5  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  33.52 
 
 
206 aa  90.9  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  34.01 
 
 
207 aa  90.1  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2739  cytochrome c, class I  32.42 
 
 
218 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437808  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  32.31 
 
 
206 aa  89.7  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0082  cytochrome c class I  32.34 
 
 
238 aa  89.7  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000520703 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4453  cytochrome c class I  38.36 
 
 
226 aa  89.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12029  normal  0.150095 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  35.16 
 
 
206 aa  89.7  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  31.43 
 
 
221 aa  89.7  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3265  cytochrome c class I  36.14 
 
 
219 aa  89.4  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838246  normal  0.141063 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  31.21 
 
 
202 aa  89.4  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  29.91 
 
 
205 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0287  cytochrome c, class I  31.87 
 
 
222 aa  88.6  7e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02000  Cytochrome c4  33.71 
 
 
210 aa  88.2  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0261  cytochrome C, c4  31.87 
 
 
222 aa  88.2  8e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  32.04 
 
 
206 aa  88.2  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2918  cytochrome c class I  35.54 
 
 
219 aa  88.2  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059713 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1889  cytochrome c, class I  32.96 
 
 
221 aa  88.2  8e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  31.76 
 
 
191 aa  88.2  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  32.11 
 
 
205 aa  87.8  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2741  cytochrome c, class I  36.31 
 
 
218 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0698392  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  30.65 
 
 
205 aa  86.7  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72460  cytochrome c4 precursor  33.93 
 
 
201 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462993  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0432  cytochrome c  30.91 
 
 
205 aa  85.9  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660944  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6289  cytochrome c4 precursor  33.93 
 
 
196 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35390  pyoverdine biosynthesis protein PvcD  35.67 
 
 
215 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.15131  normal  0.0513213 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2984  pyoverdine biosynthesis protein PvcD  32.43 
 
 
218 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  31.72 
 
 
223 aa  85.1  8e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2987  oxidoreductase cytochrome C-type signal peptide protein  35.54 
 
 
219 aa  84.7  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0687  cytochrome c class I  34.71 
 
 
225 aa  84.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  31.55 
 
 
205 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>