54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0651 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0651  hypothetical protein  100 
 
 
627 aa  1282  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19875  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1505  hypothetical protein  52.06 
 
 
633 aa  603  1e-171  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.618483  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2819  hypothetical protein  44.34 
 
 
676 aa  471  1e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.14645  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2244  hypothetical protein  39.61 
 
 
658 aa  430  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.696952  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2642  zinc-binding domain of primase-helicase family  36.12 
 
 
895 aa  293  8e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.740754  hitchhiker  6.96733e-12 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0098  hypothetical protein  37.9 
 
 
950 aa  291  3e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2008  DNA primase  38.12 
 
 
955 aa  290  7e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491105  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1073  hypothetical protein  36.67 
 
 
591 aa  288  3e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0113  hypothetical protein  36.04 
 
 
950 aa  286  8e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0309  inner membrane protein  36.04 
 
 
955 aa  286  8e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1754  inner membrane protein  36.17 
 
 
958 aa  285  1e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2366  inner membrane protein  36.17 
 
 
958 aa  285  1e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1288  inner membrane protein  37.69 
 
 
953 aa  285  1e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2484  primase 2  37.47 
 
 
953 aa  285  2e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0381  inner membrane protein  34.96 
 
 
890 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.401126 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4783  zinc-binding domain protein, primase-helicase family  34.96 
 
 
890 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3477  hypothetical protein  36.87 
 
 
631 aa  279  9e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00832403 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0070  hypothetical protein  36.75 
 
 
582 aa  275  1e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1626  hypothetical protein  34.39 
 
 
911 aa  263  7e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00166468  normal  0.0358334 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2917  hypothetical protein  35.38 
 
 
689 aa  256  1e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0301646 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7731  protein of unknown function DUF927  32.98 
 
 
841 aa  255  2e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04064  inner membrane protein  35.01 
 
 
580 aa  249  9e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0810  hypothetical protein  35.17 
 
 
930 aa  241  4e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4214  hypothetical protein  33.16 
 
 
845 aa  233  8e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363466  normal  0.433142 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2096  protein of unknown function DUF927  32.59 
 
 
1051 aa  231  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0990242  normal  0.675674 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1225  protein of unknown function DUF927  34.29 
 
 
515 aa  216  8e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0207229  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02077  hypothetical protein  29.2 
 
 
979 aa  215  2e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.777801  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4007  protein of unknown function DUF927  29.22 
 
 
899 aa  197  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3881  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  32.55 
 
 
929 aa  198  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0756  hypothetical protein  31.16 
 
 
711 aa  197  4e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3990  superfamily II helicase  31.71 
 
 
556 aa  186  1e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2368  protein of unknown function DUF927  30.28 
 
 
878 aa  184  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.124807  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0360  inner membrane protein  32.75 
 
 
443 aa  181  5e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0680  P4 alpha zinc-binding domain protein  29.42 
 
 
713 aa  180  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  decreased coverage  1.09484e-07 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0552  hypothetical protein  35.18 
 
 
574 aa  168  3e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2180  inner membrane protein  37.92 
 
 
295 aa  166  9e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.541049  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0346  superfamily II helicase  31.07 
 
 
553 aa  163  8e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.079458 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2181  hypothetical protein  40.08 
 
 
280 aa  129  2e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.437951  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0049  hypothetical protein  38.18 
 
 
383 aa  96.7  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  27.11 
 
 
970 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  27.11 
 
 
970 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3088  protein of unknown function DUF927  28.07 
 
 
709 aa  87.8  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1025  protein of unknown function DUF927  25.3 
 
 
842 aa  83.6  1e-14  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.337392  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1193  protein of unknown function DUF927  27.01 
 
 
897 aa  77.4  8e-13  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.280994 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0257  superfamily II helicase  26.56 
 
 
580 aa  75.1  3e-12  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2613  superfamily II helicase  29.08 
 
 
987 aa  69.3  2e-10  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0050  hypothetical protein  25.81 
 
 
597 aa  66.6  1e-09  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0051  hypothetical protein  25.81 
 
 
597 aa  66.6  1e-09  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2423  hypothetical protein  45.83 
 
 
134 aa  65.9  2e-09  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.419372  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2984  superfamily II helicase  26 
 
 
624 aa  65.1  4e-09  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.421436  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2496  hypothetical protein  25.21 
 
 
597 aa  62.8  2e-08  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0065  hypothetical protein  32.98 
 
 
298 aa  48.5  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2483  hypothetical protein  32.98 
 
 
298 aa  48.5  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2724  hypothetical protein  30.65 
 
 
127 aa  47.4  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.5774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>