More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1711 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1711  hypothetical protein  100 
 
 		 436 aa  883    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6072  MiaB-like tRNA modifying enzyme  54.27 
 
 		 449 aa  416  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0928741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2053  MiaB-like tRNA modifying enzyme  42.43 
 
 		 450 aa  310  5e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0962  MiaB family tRNA modification protein  42.96 
 
 		 413 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0853  MiaB-like tRNA modifying enzyme  41.39 
 
 		 416 aa  297  3e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.230835  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_835  tRNA modification enzyme, MiaB family  41.39 
 
 		 416 aa  297  3e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.258618  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3217  RNA modification enzyme, MiaB family  40.05 
 
 		 435 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000221997  hitchhiker  0.000000785503 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2241  RNA modification enzyme, MiaB family  36.21 
 
 		 454 aa  290  4e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150078  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1333  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.2 
 
 		 449 aa  288  1e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12760  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.24 
 
 		 438 aa  284  3.0000000000000004e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00265105  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0174  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.58 
 
 		 430 aa  283  6.000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0150  RNA modification protein  38.29 
 
 		 434 aa  282  7.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.839753  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0588  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40.84 
 
 		 450 aa  282  9e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2570  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.98 
 
 		 429 aa  279  6e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.005255 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2224  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.08 
 
 		 442 aa  277  3e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.490633  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1164  RNA modification enzyme, MiaB family  37.47 
 
 		 431 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1643  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.47 
 
 		 429 aa  271  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.119605  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2492  RNA modification protein  38.23 
 
 		 436 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00131013  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1770  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.81 
 
 		 435 aa  271  2e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000207484  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1211  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37 
 
 		 495 aa  271  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.496163 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1992  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.34 
 
 		 471 aa  270  5e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.130467  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4295  RNA modification enzyme, MiaB family  40.7 
 
 		 439 aa  270  5e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00281289  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1282  RNA modification enzyme, MiaB family  34.83 
 
 		 434 aa  269  5.9999999999999995e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0874  MiaB-like tRNA modifying enzyme  41.15 
 
 		 431 aa  269  8e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249518 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2937  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.3 
 
 		 439 aa  269  8e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.673839  normal  0.173134 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.47 
 
 		 434 aa  268  2e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.698002  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1857  putative MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.44 
 
 		 432 aa  266  5e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5039  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.16 
 
 		 444 aa  266  7e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1490  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.66 
 
 		 444 aa  266  8e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1331  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.95 
 
 		 417 aa  266  8e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000562047  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0611  RNA modification enzyme, MiaB family  38.1 
 
 		 437 aa  262  1e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.920211  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2433  RNA modification enzyme, MiaB family  37.08 
 
 		 451 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000747616  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3036  RNA modification protein  36.45 
 
 		 450 aa  261  2e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0366508  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1187  RNA modification enzyme, MiaB family  35.5 
 
 		 446 aa  260  3e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0386779 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.28 
 
 		 434 aa  259  6e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1017  RNA modification enzyme, MiaB family  36.02 
 
 		 449 aa  259  8e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2568  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.71 
 
 		 434 aa  258  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4391  hypothetical protein  36.56 
 
 		 450 aa  258  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.115711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4443  RNA modification enzyme, MiaB family  36.56 
 
 		 450 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1668  RNA modification protein  36.49 
 
 		 448 aa  258  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1634  RNA modification protein  36.49 
 
 		 448 aa  258  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.654078  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09066  putative Fe-S oxidoreductase  34.73 
 
 		 458 aa  257  3e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276137  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1997  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.95 
 
 		 441 aa  257  3e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2282  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.8 
 
 		 434 aa  256  4e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4209  hypothetical protein  36.56 
 
 		 450 aa  256  5e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4535  hypothetical protein  36.56 
 
 		 450 aa  256  5e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4161  RNA modification protein  36.56 
 
 		 450 aa  256  6e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.556145  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0223  hypothetical protein  32.16 
 
 		 441 aa  256  7e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.180201 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4332  RNA modification enzyme, MiaB family  36.56 
 
 		 450 aa  256  7e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16472e-48 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4047  hypothetical protein  36.56 
 
 		 450 aa  256  7e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4057  hypothetical protein  36.56 
 
 		 450 aa  256  7e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0807  RNA modification enzyme, MiaB family  36.56 
 
 		 450 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137858  decreased coverage  2.64257e-22 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1997  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.57 
 
 		 434 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4429  hypothetical protein  36.56 
 
 		 450 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111241  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2316  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.96 
 
 		 427 aa  252  7e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000240078  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0674  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.67 
 
 		 429 aa  252  7e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6578  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.48 
 
 		 425 aa  251  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.745679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1350  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.6 
 
 		 449 aa  250  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.306215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2299  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.08 
 
 		 466 aa  250  3e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.198843  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0444  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.19 
 
 		 442 aa  249  5e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0474351  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1144  hypothetical protein  35.31 
 
 		 448 aa  248  2e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1737  2-methylthioadenine synthetase  32.78 
 
 		 438 aa  247  3e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.131145 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0969  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.49 
 
 		 421 aa  244  1.9999999999999999e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0926  MiaB-like tRNA modifying enzyme  41.94 
 
 		 427 aa  242  9e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.084888  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1050  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.18 
 
 		 438 aa  242  1e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1933  hypothetical protein  41.94 
 
 		 427 aa  240  2.9999999999999997e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1860  hypothetical protein  41.94 
 
 		 427 aa  240  2.9999999999999997e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.17951  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0422  RNA modification protein  35.17 
 
 		 446 aa  239  5e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0536856  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4866  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40.57 
 
 		 449 aa  239  5.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1728  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.3 
 
 		 438 aa  238  1e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.479022  decreased coverage  0.00502843 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0522  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.58 
 
 		 420 aa  239  1e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1574  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.98 
 
 		 456 aa  237  3e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000454579  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1996  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.8 
 
 		 451 aa  237  4e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.320678  normal  0.0920131 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2352  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.16 
 
 		 443 aa  236  5.0000000000000005e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0795  RNA modification enzyme, MiaB family  39.11 
 
 		 423 aa  234  2.0000000000000002e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.134555  normal  0.773593 
 
 
-
 
NC_002950  PG2221  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.81 
 
 		 444 aa  233  6e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000670309 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1414  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.83 
 
 		 420 aa  233  7.000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0166  RNA modification protein  36.08 
 
 		 440 aa  233  7.000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.684419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1790  RNA modification enzyme, MiaB family  36.45 
 
 		 452 aa  232  9e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0115132  normal  0.0236064 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2810  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.68 
 
 		 421 aa  231  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.266811 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0214  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.44 
 
 		 420 aa  230  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0176423 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3405  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40.47 
 
 		 435 aa  228  1e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1807  RNA modification enzyme, MiaB family  31.72 
 
 		 451 aa  228  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000210311  decreased coverage  0.000315868 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0566  hypothetical protein  36.64 
 
 		 470 aa  227  3e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.59061  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0252  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40.79 
 
 		 423 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0373  putative MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.67 
 
 		 434 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215959  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2722  hypothetical protein  39.27 
 
 		 435 aa  224  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1182  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.53 
 
 		 441 aa  224  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0484271  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0626  RNA modification enzyme, MiaB family  40 
 
 		 439 aa  222  9e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.196268  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3229  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.52 
 
 		 416 aa  222  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0152656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0396  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40.23 
 
 		 420 aa  222  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.342498  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0018  MiaB family tRNA modification protein  35.04 
 
 		 427 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2594  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.29 
 
 		 425 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.858187 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0319  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.75 
 
 		 419 aa  218  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0352  RNA modification enzyme, MiaB family  35.28 
 
 		 458 aa  219  1e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.135679  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2497  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.83 
 
 		 411 aa  218  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0715823  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1294  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.66 
 
 		 409 aa  218  2e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10340  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.02 
 
 		 409 aa  217  4e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0729922  unclonable  0.00000000167703 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1749  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.35 
 
 		 451 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000349639  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0021  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  34.19 
 
 		 450 aa  216  5.9999999999999996e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0814495  normal  0.787059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>