More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1504 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  100 
 
 
419 aa  853  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2086  sulfite oxidase SoxC, putative  70.67 
 
 
431 aa  561  1e-159  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29998  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  56.62 
 
 
409 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6198  oxidoreductase molybdopterin binding  54.46 
 
 
418 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  56.45 
 
 
406 aa  419  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3664  oxidoreductase molybdopterin binding  56.45 
 
 
402 aa  419  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185653  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1238  oxidoreductase, molybdopterin binding  57.49 
 
 
418 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6594  oxidoreductase, molybdopterin binding  57.49 
 
 
418 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0853456 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7230  oxidoreductase molybdopterin binding  57.52 
 
 
406 aa  415  1e-115  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  54.23 
 
 
414 aa  410  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  53.72 
 
 
429 aa  406  1e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0151  putative sulfite oxidase  56.33 
 
 
419 aa  400  1e-110  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2166  putative sulfite oxidase, dehydrogenase subunit(SoxC)  55.8 
 
 
424 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2988  oxidoreductase, molybdopterin binding  56.32 
 
 
425 aa  390  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1093  twin-arginine translocation pathway signal  50.12 
 
 
425 aa  388  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  47.46 
 
 
428 aa  386  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  5.38057e-06 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  47.46 
 
 
428 aa  386  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  47.42 
 
 
431 aa  379  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0148  oxidoreductase molybdopterin binding  49.35 
 
 
437 aa  379  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  49.59 
 
 
437 aa  373  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  46.62 
 
 
430 aa  371  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3258  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  49.62 
 
 
449 aa  371  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3212  oxidoreductase molybdopterin binding  50.95 
 
 
423 aa  371  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1665  oxidoreductase molybdopterin binding  48.59 
 
 
449 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4957  oxidoreductase molybdopterin binding  45.73 
 
 
431 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2286  molybdopterin-binding oxidoreductase  48.33 
 
 
451 aa  364  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0386813  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1589  oxidoreductase molybdopterin binding  48.33 
 
 
445 aa  364  2e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45002  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4368  twin-arginine translocation pathway signal  45.84 
 
 
425 aa  362  1e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4252  twin-arginine translocation pathway signal  48.35 
 
 
425 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1615  oxidoreductase molybdopterin binding  46.88 
 
 
414 aa  359  5e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0801  oxidoreductase, molybdopterin binding  44.7 
 
 
451 aa  358  7e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.325021  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3676  sulfur dehydrogenase subunit SoxC  47.71 
 
 
427 aa  354  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3134  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  45.23 
 
 
448 aa  352  8e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0673188  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3041  oxidoreductase, molybdopterin binding  45.08 
 
 
414 aa  351  2e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0156  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  49.44 
 
 
453 aa  348  1e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  4.33271e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0561  sulfite dehydrogenase  45.99 
 
 
414 aa  347  2e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2735  oxidoreductase molybdopterin binding protein  50.89 
 
 
415 aa  345  1e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.313353  hitchhiker  5.68946e-05 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1518  oxidoreductase molybdopterin binding  45.43 
 
 
440 aa  344  2e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.883795  normal  0.831721 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  50.75 
 
 
405 aa  340  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0587  oxidoreductase molybdopterin binding protein  41.24 
 
 
456 aa  335  6e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.271361  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2631  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  47.12 
 
 
443 aa  335  9e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.492263  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1894  twin-arginine translocation pathway signal precursor  42.89 
 
 
427 aa  335  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4155  oxidoreductase, molybdopterin binding  46.7 
 
 
430 aa  334  2e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3784  oxidoreductase molybdopterin binding  45.87 
 
 
457 aa  330  4e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2438  putative sulfite oxidase molybdopterin subunit  45.62 
 
 
457 aa  322  9e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2060  twin-arginine translocation pathway signal  42.15 
 
 
445 aa  322  1e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  3.89133e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  42.24 
 
 
420 aa  315  9e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2802  oxidoreductase  42.67 
 
 
425 aa  290  3e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  38.71 
 
 
376 aa  175  2e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  37.11 
 
 
370 aa  169  6e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.59 
 
 
415 aa  160  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  1.98483e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.24 
 
 
400 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  34.18 
 
 
369 aa  155  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  35.4 
 
 
420 aa  150  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 
372 aa  150  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  33.86 
 
 
414 aa  149  6e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  32.59 
 
 
369 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  30.03 
 
 
409 aa  139  7e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3242  oxidoreductase molybdopterin binding  31.21 
 
 
410 aa  137  3e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.842559 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3624  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.12 
 
 
411 aa  137  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564315  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  31.33 
 
 
369 aa  133  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  30.09 
 
 
451 aa  132  9e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  31.13 
 
 
369 aa  132  1e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.63 
 
 
415 aa  131  2e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.01 
 
 
465 aa  127  4e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8530  oxidoreductase molybdopterin binding  32.78 
 
 
349 aa  127  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5008  oxidoreductase molybdopterin binding  33.99 
 
 
338 aa  127  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37938  predicted protein  30.23 
 
 
866 aa  125  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.590439  normal  0.879833 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  27.71 
 
 
453 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6939  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.28 
 
 
417 aa  122  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.38 
 
 
400 aa  121  2e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  31.86 
 
 
407 aa  121  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  31.33 
 
 
361 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2874  twin-arginine translocation pathway signal  30.25 
 
 
457 aa  120  4e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  31.02 
 
 
406 aa  120  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  29.92 
 
 
403 aa  118  2e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0981  oxidoreductase molybdopterin binding  27.89 
 
 
408 aa  117  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036164  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  30.08 
 
 
401 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  30.13 
 
 
402 aa  117  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1175  oxidoreductase molybdopterin binding  27.39 
 
 
408 aa  116  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  1.18836e-05 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  30.45 
 
 
363 aa  115  1e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  29.92 
 
 
401 aa  115  2e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  29.69 
 
 
414 aa  114  2e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  29.82 
 
 
410 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  31.85 
 
 
403 aa  114  4e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  31.53 
 
 
359 aa  114  4e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  31.85 
 
 
402 aa  114  4e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0035  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  33.7 
 
 
406 aa  113  7e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.7902  normal  0.133868 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  30.3 
 
 
405 aa  113  7e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  30.3 
 
 
405 aa  113  7e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0055  oxidoreductase molybdopterin binding  34.3 
 
 
417 aa  112  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  30.34 
 
 
412 aa  112  1e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  31.76 
 
 
402 aa  112  1e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1622  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  30.22 
 
 
446 aa  110  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.97 
 
 
501 aa  110  4e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  33.12 
 
 
407 aa  110  4e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486287  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0916  twin-arginine translocation pathway signal  28.57 
 
 
461 aa  110  4e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4081  twin-arginine translocation pathway signal  28.57 
 
 
461 aa  110  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  29.58 
 
 
407 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.5 
 
 
416 aa  108  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>