46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0303 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0303  putative lipoprotein  100 
 
 
170 aa  349  9e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0008  spore coat protein  36.24 
 
 
154 aa  80.5  9e-15  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2056  putative lipoprotein  31.72 
 
 
175 aa  80.9  9e-15  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.017923  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0009  Spore coat U domain protein  36.24 
 
 
154 aa  80.5  9e-15  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.164066  hitchhiker  0.00841458 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0341  putative lipoprotein  38.89 
 
 
122 aa  77  1e-13  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.615172  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0777  spore coat U domain-containing protein  33.33 
 
 
156 aa  72  4e-12  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0537  spore coat U domain-containing protein  31.39 
 
 
153 aa  62.4  3e-09  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.547245  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5756  secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  38.46 
 
 
333 aa  61.6  5e-09  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2692  signal peptide protein  42 
 
 
169 aa  58.9  3e-08  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3742  Spore coat U domain protein  34.09 
 
 
124 aa  58.5  4e-08  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03044  lipoprotein signal peptide  40.2 
 
 
325 aa  57.8  7e-08  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0900773  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3667  Spore coat U domain protein  33.33 
 
 
160 aa  57.4  9e-08  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.60302  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1267  Spore coat U domain protein  39.81 
 
 
318 aa  56.2  2e-07  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0483759  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0306  spore coat protein, late developmental, putative  30.87 
 
 
181 aa  56.2  2e-07  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.86749  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3601  spore coat U  32.58 
 
 
160 aa  56.6  2e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.666843  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4394  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  41.75 
 
 
320 aa  54.3  8e-07  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0868  putative lipoprotein  31.65 
 
 
372 aa  53.9  1e-06  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236755  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1072  putative lipoprotein  36.54 
 
 
345 aa  53.5  1e-06  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1224  putative lipoprotein  36.54 
 
 
336 aa  53.9  1e-06  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1066  putative lipoprotein  36.54 
 
 
336 aa  53.9  1e-06  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2338  spore coat U domain-containing protein  36.89 
 
 
331 aa  52.8  2e-06  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.156142 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2472  spore coat U domain-containing protein  36.89 
 
 
331 aa  52.8  2e-06  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169797  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2696  signal peptide protein  31.37 
 
 
167 aa  53.1  2e-06  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2995  putative lipoprotein  35.58 
 
 
336 aa  51.6  5e-06  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0724  putative lipoprotein  35.58 
 
 
329 aa  51.6  5e-06  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0341007  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2290  hypothetical protein  35.58 
 
 
336 aa  51.6  5e-06  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1604  putative lipoprotein  35.58 
 
 
336 aa  51.6  5e-06  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1777  spore coat U domain-containing protein  34.74 
 
 
176 aa  51.6  6e-06  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0475012  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1666  hypothetical protein  34.74 
 
 
163 aa  51.2  7e-06  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2668  hypothetical protein  34.74 
 
 
163 aa  51.2  7e-06  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.641514  normal  0.0539014 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3668  Spore coat U domain protein  36.84 
 
 
164 aa  47.8  6e-05  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3602  spore coat U  39.58 
 
 
165 aa  47.8  7e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2112  spore coat U domain-containing protein  35.81 
 
 
179 aa  47.8  8e-05  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2695  signal peptide protein  26.43 
 
 
167 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.35651 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3743  Spore coat U domain protein  35.79 
 
 
164 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2817  Spore coat U domain protein  34.17 
 
 
178 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5299  hypothetical protein  30.15 
 
 
182 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01135  spore Coat Protein U domain family  39 
 
 
344 aa  44.7  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0663503  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61520  hypothetical protein  30.15 
 
 
180 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.201355 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1272  Spore coat U domain protein  37.14 
 
 
175 aa  44.3  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_003296  RS03041  signal peptide protein  34.38 
 
 
173 aa  43.9  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667718  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3673  spore coat U  24.84 
 
 
177 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01138  protein U  30.63 
 
 
156 aa  42.4  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0616572  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0538  spore coat U domain-containing protein  27.54 
 
 
153 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269476  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1448  Spore coat U domain protein  36.17 
 
 
178 aa  42  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1920  Spore coat U domain protein  28.46 
 
 
342 aa  40.8  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>