266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0030 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0030  hypothetical protein  100 
 
 		 448 aa  901    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.434852 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0022  hypothetical protein  58.28 
 
 		 408 aa  475  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.45707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1379  hypothetical protein  60.32 
 
 		 426 aa  457  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0015  hypothetical protein  58.14 
 
 		 414 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3207  hypothetical protein  57.31 
 
 		 407 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3660  protein of unknown function DUF323  60.45 
 
 		 418 aa  439  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0022  hypothetical protein  58.74 
 
 		 408 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0964  hypothetical protein  58.82 
 
 		 451 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0040  hypothetical protein  58.51 
 
 		 408 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.793849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2288  hypothetical protein  58.82 
 
 		 411 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0048  hypothetical protein  58.51 
 
 		 408 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0023  hypothetical protein  57.85 
 
 		 404 aa  436  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1050  hypothetical protein  58.59 
 
 		 451 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1713  domain of unknown function  56.94 
 
 		 411 aa  418  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1440  hypothetical protein  54.06 
 
 		 429 aa  413  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2836  hypothetical protein  52.48 
 
 		 423 aa  414  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2198  hypothetical protein  53.79 
 
 		 430 aa  414  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.687094 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2423  hypothetical protein  55.21 
 
 		 425 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0647935 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2029  hypothetical protein  50.59 
 
 		 437 aa  410  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0997  hypothetical protein  51.41 
 
 		 430 aa  411  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0142804  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1838  hypothetical protein  54.23 
 
 		 426 aa  411  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118633  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1789  hypothetical protein  55.08 
 
 		 434 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0782  hypothetical protein  53.18 
 
 		 422 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421239  normal  0.287079 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3999  protein of unknown function DUF323  54.97 
 
 		 423 aa  402  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0859186 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3265  hypothetical protein  53.35 
 
 		 437 aa  405  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.618561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1598  hypothetical protein  52.4 
 
 		 419 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.785472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1759  hypothetical protein  51.92 
 
 		 459 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1589  hypothetical protein  53.46 
 
 		 429 aa  404  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0217234  normal  0.353044 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3705  hypothetical protein  52.66 
 
 		 418 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1640  hypothetical protein  52.12 
 
 		 433 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.923068  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1461  protein of unknown function DUF323  54.44 
 
 		 434 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2927  hypothetical protein  52.31 
 
 		 437 aa  396  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3413  protein of unknown function DUF323  51.15 
 
 		 420 aa  395  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1311  hypothetical protein  50.11 
 
 		 415 aa  392  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3542  protein of unknown function DUF323  51.16 
 
 		 420 aa  394  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3218  hypothetical protein  51.39 
 
 		 420 aa  392  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1640  hypothetical protein  50.57 
 
 		 418 aa  394  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3087  hypothetical protein  53.77 
 
 		 423 aa  391  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0785  hypothetical protein  54 
 
 		 428 aa  389  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.449509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4037  hypothetical protein  50.7 
 
 		 427 aa  390  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1420  protein of unknown function DUF323  53.49 
 
 		 434 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.350616 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1795  protein of unknown function DUF323  51.45 
 
 		 417 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3535  hypothetical protein  50.59 
 
 		 438 aa  383  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19140  hypothetical protein  49.66 
 
 		 425 aa  382  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.500437  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5394  hypothetical protein  49.07 
 
 		 417 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0356  protein of unknown function DUF323  52.76 
 
 		 418 aa  381  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.199231  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4834  hypothetical protein  51.85 
 
 		 430 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3075  hypothetical protein  49.55 
 
 		 415 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.467191  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1924  hypothetical protein  50 
 
 		 441 aa  375  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0611  protein of unknown function DUF323  49.77 
 
 		 425 aa  378  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3802  hypothetical protein  49.77 
 
 		 415 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.302646 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2253  hypothetical protein  49.78 
 
 		 419 aa  375  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201022  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01891  hypothetical protein  50.23 
 
 		 393 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4563  hypothetical protein  48.95 
 
 		 432 aa  371  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51165  normal  0.286886 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3090  hypothetical protein  49.89 
 
 		 470 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0115  hypothetical protein  49.17 
 
 		 386 aa  367  1e-100  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.280848  normal  0.0377747 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3926  hypothetical protein  49.31 
 
 		 415 aa  365  1e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2287  hypothetical protein  51.28 
 
 		 453 aa  362  6e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0155018 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2434  hypothetical protein  49.41 
 
 		 425 aa  361  1e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3038  protein of unknown function DUF323  47.94 
 
 		 429 aa  361  2e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2450  protein of unknown function DUF323  52.96 
 
 		 433 aa  360  2e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00600286  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1587  protein of unknown function DUF323  51.79 
 
 		 453 aa  360  3e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  48.18 
 
 		 723 aa  360  4e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03588  hypothetical protein  49.65 
 
 		 412 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.802275  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1281  hypothetical protein  47.88 
 
 		 428 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2546  protein of unknown function DUF323  53.2 
 
 		 433 aa  346  6e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1407  hypothetical protein  53.37 
 
 		 433 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0159  hypothetical protein  45.97 
 
 		 383 aa  340  4e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6118  protein of unknown function DUF323  48.29 
 
 		 455 aa  338  9.999999999999999e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1251  protein of unknown function DUF323  44.42 
 
 		 385 aa  338  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499599  normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6100  protein of unknown function DUF323  45.22 
 
 		 398 aa  338  9.999999999999999e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3833  hypothetical protein  44.52 
 
 		 395 aa  337  1.9999999999999998e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.219039  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1661  hypothetical protein  43.19 
 
 		 412 aa  334  2e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4964  protein of unknown function DUF323  43.4 
 
 		 383 aa  330  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.24016  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1511  hypothetical protein  41.69 
 
 		 432 aa  325  8.000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.92317  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2445  hypothetical protein  41.84 
 
 		 427 aa  324  3e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4446  protein of unknown function DUF323  42.96 
 
 		 388 aa  311  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0334841  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13318  hypothetical protein  38.44 
 
 		 386 aa  304  3.0000000000000004e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.746611  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  34.83 
 
 		 436 aa  283  6.000000000000001e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  33.48 
 
 		 437 aa  182  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  35.75 
 
 		 439 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  33.26 
 
 		 444 aa  169  6e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  32.96 
 
 		 444 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  33.56 
 
 		 433 aa  163  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4881  hypothetical protein  33.62 
 
 		 436 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.546495  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5249  hypothetical protein  33.62 
 
 		 436 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4970  hypothetical protein  33.62 
 
 		 436 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  31.83 
 
 		 446 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  33.33 
 
 		 437 aa  153  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  30.79 
 
 		 442 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  30.23 
 
 		 412 aa  149  7e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0564  hypothetical protein  30.51 
 
 		 424 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2207  hypothetical protein  33.81 
 
 		 374 aa  147  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221962  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  31.01 
 
 		 468 aa  147  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  31.98 
 
 		 442 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  31.37 
 
 		 447 aa  145  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  32.05 
 
 		 446 aa  142  9e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  29.89 
 
 		 766 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  36.96 
 
 		 506 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  28.05 
 
 		 417 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>