53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0152 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0152  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  100 
 
 		 552 aa  1147    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000539992  hitchhiker  9.52984e-19 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3853  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  44.98 
 
 		 555 aa  503  1e-141  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1444  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  46.92 
 
 		 543 aa  499  1e-140  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1237  hypothetical protein  47.9 
 
 		 540 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0386  hypothetical protein  46.78 
 
 		 241 aa  219  1e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000264481  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1510  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  24.6 
 
 		 503 aa  81.6  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4871  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  26.3 
 
 		 504 aa  75.9  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1563  phosphoenolpyruvate carboxykinase  23.08 
 
 		 521 aa  73.6  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3507  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  23.61 
 
 		 503 aa  66.6  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.570315  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2236  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.54 
 
 		 504 aa  64.3  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.182123 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0403  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.22 
 
 		 532 aa  49.7  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.551445  normal  0.0144592 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3253  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25 
 
 		 536 aa  49.7  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1509  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.06 
 
 		 525 aa  50.1  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.435783  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2908  phosphoenolpyruvate carboxykinase  23.45 
 
 		 534 aa  48.5  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.775777  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6930  phosphoenolpyruvate carboxykinase  29.5 
 
 		 533 aa  48.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.518849  normal  0.421988 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0246  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.79 
 
 		 539 aa  47.4  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03255  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.49 
 
 		 540 aa  46.6  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3782  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.49 
 
 		 540 aa  46.6  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4709  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.49 
 
 		 540 aa  47  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0310  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.49 
 
 		 540 aa  46.6  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.06284 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03590  phosphoenolpyruvate carboxykinase, putative  22.92 
 
 		 551 aa  47  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.550693  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03207  hypothetical protein  25.49 
 
 		 540 aa  46.6  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3877  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.49 
 
 		 540 aa  46.6  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3600  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.49 
 
 		 540 aa  46.6  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0055  hypothetical protein  25 
 
 		 572 aa  47  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.650665  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1886  phosphoenolpyruvate carboxykinase  20.99 
 
 		 551 aa  47  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4595  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.71 
 
 		 536 aa  47  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.730066  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0310  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  25.49 
 
 		 540 aa  46.6  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3896  phosphoenolpyruvate carboxykinase  23.97 
 
 		 539 aa  45.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0326  phosphoenolpyruvate carboxykinase  25.07 
 
 		 539 aa  46.2  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3773  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.16 
 
 		 539 aa  45.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3869  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.16 
 
 		 539 aa  45.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3701  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.16 
 
 		 539 aa  45.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3807  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.16 
 
 		 539 aa  45.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0939  phosphoenolpyruvate carboxykinase  23.18 
 
 		 524 aa  45.1  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3682  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.44 
 
 		 540 aa  45.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.529703 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3698  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.16 
 
 		 539 aa  45.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.685993 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1628  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.15 
 
 		 538 aa  45.4  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0313  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.17 
 
 		 532 aa  44.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_55018  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.32 
 
 		 612 aa  44.7  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1680  phosphoenolpyruvate carboxykinase  26.17 
 
 		 532 aa  44.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1196  phosphoenolpyruvate carboxykinase  22.91 
 
 		 524 aa  45.1  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.862776  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2852  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.84 
 
 		 532 aa  44.7  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1010  phosphoenolpyruvate carboxykinase  23.97 
 
 		 524 aa  44.7  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.504538  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4073  phosphoenolpyruvate carboxykinase  23.97 
 
 		 539 aa  44.7  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0606  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  34.02 
 
 		 525 aa  44.3  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1486  phosphoenolpyruvate carboxykinase  23.9 
 
 		 524 aa  43.9  0.008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0140  phosphoenolpyruvate carboxykinase  23.05 
 
 		 513 aa  43.9  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.808364  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0369  phosphoenolpyruvate carboxykinase  23.82 
 
 		 538 aa  43.5  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0965  phosphoenolpyruvate carboxykinase  23.55 
 
 		 525 aa  43.5  0.01  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0335264  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0213  phosphoenolpyruvate carboxykinase  24.77 
 
 		 532 aa  43.5  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2928  phosphoenolpyruvate carboxykinase  23.91 
 
 		 541 aa  43.5  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.356663  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03951  phosphoenolpyruvate carboxykinase  21.14 
 
 		 520 aa  43.5  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.949404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>