57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0987 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0987  manganese transporter NRAMP  100 
 
 
410 aa  800    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0438146  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0028  permease (transport protein)  52.91 
 
 
395 aa  389  1e-107  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1443  putative transmembrane transport protein  49.26 
 
 
413 aa  387  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1097  metal Ion (Mn2+/Fe2+) transporter, NRAMP family  49.75 
 
 
395 aa  386  1e-106  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.156832 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2227  branched-chain amino acid transport system II carrier protein  51.03 
 
 
394 aa  360  2e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4281  putative transmembrane transport protein  51.19 
 
 
386 aa  346  3e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0711  transmembrane transport protein  45.85 
 
 
406 aa  342  1e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000119432  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3381  manganese transporter NRAMP  47.07 
 
 
408 aa  333  4e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.764333 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1695  hypothetical protein  45.32 
 
 
409 aa  326  4.0000000000000003e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1661  manganese transporter NRAMP  45.32 
 
 
409 aa  326  4.0000000000000003e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5852  hypothetical protein  44.44 
 
 
425 aa  320  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0575384  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19210  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  41 
 
 
427 aa  307  2.0000000000000002e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2199  Mn2+/Fe2- transporter, NRAMP family  43.65 
 
 
414 aa  307  3e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3559  hypothetical protein  41.52 
 
 
416 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.476897  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1167  hypothetical protein  44.47 
 
 
414 aa  302  6.000000000000001e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.367951  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0496  hypothetical protein  42.57 
 
 
410 aa  294  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5193  hypothetical protein  42.42 
 
 
412 aa  293  3e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.249883  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00410  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  40.29 
 
 
426 aa  293  5e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.455948 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0319  hypothetical protein  45.48 
 
 
411 aa  285  7e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5377  hypothetical protein  42.24 
 
 
410 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31598  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0536  hypothetical protein  43.11 
 
 
421 aa  262  6e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.131848  decreased coverage  0.00419582 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3271  manganese transporter NRAMP  38.02 
 
 
412 aa  261  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000480  hypothetical protein  37.76 
 
 
412 aa  248  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3408  natural resistance-associated macrophage protein  26.59 
 
 
397 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.913071  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3567  natural resistance-associated macrophage protein  26.98 
 
 
401 aa  70.9  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5809  putative manganese transport protein  25.23 
 
 
434 aa  59.7  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354355  normal  0.770207 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1397  manganese transport protein MntH  23.34 
 
 
429 aa  55.1  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08916  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family protein  22.83 
 
 
403 aa  55.5  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1735  manganese transport protein MntH  27.03 
 
 
456 aa  54.7  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.499918  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  25.46 
 
 
419 aa  54.3  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1441  manganese transport protein MntH  23.1 
 
 
456 aa  53.5  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.266058  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2655  manganese transporter NRAMP  24.81 
 
 
415 aa  53.5  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  21.45 
 
 
412 aa  52.4  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2040  natural resistance-associated macrophage protein  23.44 
 
 
432 aa  51.2  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000137009  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0657  natural resistance-associated macrophage protein  23.17 
 
 
415 aa  51.2  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000666945  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2230  Mn2+/Fe2+ transporter  22.47 
 
 
433 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.446003 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1064  natural resistance-associated macrophage protein  26.06 
 
 
430 aa  49.7  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.262705  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  22.92 
 
 
408 aa  49.3  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4120  manganese transport protein MntH  28 
 
 
448 aa  49.7  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.987586  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3908  natural resistance-associated macrophage protein  22.16 
 
 
423 aa  48.9  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3999  natural resistance-associated macrophage protein  20.69 
 
 
428 aa  48.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.358351 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0697  natural resistance-associated macrophage protein  23.13 
 
 
430 aa  48.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0233  Mn2+/Fe2+ transporter  22.1 
 
 
435 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1308  natural resistance-associated macrophage protein  25.36 
 
 
429 aa  47  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.133817  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2464  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  22.2 
 
 
434 aa  47  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413329  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2571  putative metal ion transport protein  23.57 
 
 
415 aa  46.6  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.662179  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0733  natural resistance-associated macrophage protein  24.08 
 
 
422 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17030  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  23.72 
 
 
429 aa  45.8  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.400291  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01595  putative manganese/divalent cation transport protein (NRAMP family)  24.23 
 
 
398 aa  45.8  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1691  natural resistance-associated macrophage protein  23.04 
 
 
428 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0796  manganese transport protein MntH  22.22 
 
 
434 aa  44.3  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00765423  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1739  natural resistance-associated macrophage protein  23.65 
 
 
418 aa  43.9  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27409  Nramp family transporter: metal ion  24.27 
 
 
489 aa  43.5  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.112546 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1157  natural resistance-associated macrophage protein  23.86 
 
 
432 aa  43.5  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1327  manganese transport protein MntH  25.52 
 
 
409 aa  43.5  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0143258  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1439  manganese transport protein MntH  25.52 
 
 
409 aa  43.5  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.766708  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2926  manganese transport protein MntH  22.76 
 
 
412 aa  43.1  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.382468  normal  0.128349 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>