More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0554 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  100 
 
 		 476 aa  932    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  62.63 
 
 		 482 aa  573  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  62.63 
 
 		 482 aa  573  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1150  amino acid permease-associated region  59.7 
 
 		 476 aa  567  1e-160  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287534  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0388  amino acid transporter  64.58 
 
 		 483 aa  567  1e-160  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000257428  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  61.67 
 
 		 483 aa  553  1e-156  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0097  amino acid transporter  57.33 
 
 		 465 aa  525  1e-148  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000513472  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0198  amino acid permease-associated region  57.74 
 
 		 490 aa  500  1e-140  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000143228  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  45.16 
 
 		 462 aa  391  1e-107  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1808  amino acid transporter  47.76 
 
 		 465 aa  386  1e-106  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000076298  hitchhiker  0.0000000000409798 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1640  amino acid permease-associated region  47.01 
 
 		 463 aa  387  1e-106  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000819091  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  42.24 
 
 		 466 aa  350  2e-95  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  42.61 
 
 		 490 aa  324  2e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  39.74 
 
 		 467 aa  318  2e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  39.74 
 
 		 467 aa  318  2e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  39.52 
 
 		 467 aa  316  6e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  39.52 
 
 		 467 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  39.52 
 
 		 467 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  39.3 
 
 		 467 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  39.3 
 
 		 467 aa  311  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  39.3 
 
 		 467 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  39.47 
 
 		 467 aa  307  3e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  39.3 
 
 		 467 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  37 
 
 		 489 aa  299  7e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  37.72 
 
 		 460 aa  299  9e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  38.48 
 
 		 500 aa  298  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  39.17 
 
 		 471 aa  294  3e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  39.17 
 
 		 471 aa  294  3e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  36.98 
 
 		 471 aa  293  6e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  36.98 
 
 		 471 aa  293  6e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  36.98 
 
 		 471 aa  293  6e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  39.17 
 
 		 471 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  37.99 
 
 		 476 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  39.16 
 
 		 471 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  35.89 
 
 		 471 aa  289  6e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1623  amino acid transporter  41.5 
 
 		 427 aa  289  7e-77  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133426  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  38.73 
 
 		 471 aa  288  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  36.32 
 
 		 471 aa  288  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  37.2 
 
 		 471 aa  288  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  35.89 
 
 		 471 aa  288  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  36.54 
 
 		 471 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  36.98 
 
 		 471 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  36.62 
 
 		 506 aa  285  1.0000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  36.54 
 
 		 471 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  36.32 
 
 		 471 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  36.79 
 
 		 549 aa  283  6.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  36.13 
 
 		 466 aa  281  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4115  amino acid permease-associated region  35.01 
 
 		 516 aa  281  3e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  35.67 
 
 		 471 aa  280  3e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  35.67 
 
 		 471 aa  280  3e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  35.67 
 
 		 471 aa  280  3e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  35.89 
 
 		 471 aa  280  3e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  36.76 
 
 		 471 aa  280  3e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  35.67 
 
 		 471 aa  280  3e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  35.67 
 
 		 471 aa  280  3e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  35.67 
 
 		 471 aa  280  4e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  35.67 
 
 		 471 aa  279  7e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  35.22 
 
 		 496 aa  278  2e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  35.95 
 
 		 486 aa  277  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  34.85 
 
 		 483 aa  276  4e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2749  amino acid permease-associated region  38.18 
 
 		 481 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.633141 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1191  amino acid permease-associated region  35.53 
 
 		 499 aa  274  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  35.84 
 
 		 486 aa  273  6e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  35.84 
 
 		 486 aa  273  6e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  34.21 
 
 		 512 aa  272  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  37.96 
 
 		 495 aa  272  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  37.58 
 
 		 492 aa  271  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4174  amino acid permease-associated region  35.91 
 
 		 478 aa  271  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  0.28467 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  35.92 
 
 		 566 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  37.11 
 
 		 518 aa  270  4e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  35.98 
 
 		 520 aa  269  7e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  36.04 
 
 		 476 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  36.09 
 
 		 467 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4722  amino acid permease-associated region  35.73 
 
 		 503 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  37.82 
 
 		 491 aa  267  2.9999999999999995e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  33.83 
 
 		 496 aa  266  5e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  33.83 
 
 		 496 aa  266  5e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  37.91 
 
 		 466 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  38.02 
 
 		 466 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1930  amino acid permease-associated region  36.33 
 
 		 489 aa  265  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  36.9 
 
 		 481 aa  265  1e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  35.75 
 
 		 463 aa  265  2e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  36.34 
 
 		 494 aa  265  2e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  37.8 
 
 		 468 aa  265  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4031  amino acid permease-associated region  38.31 
 
 		 475 aa  264  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.300075 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1009  amino acid permease-associated region  36.76 
 
 		 506 aa  265  2e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.146582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  34.55 
 
 		 515 aa  263  4.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  35.53 
 
 		 463 aa  263  6.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  37.58 
 
 		 468 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  37.58 
 
 		 468 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  37.58 
 
 		 468 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  37.89 
 
 		 466 aa  263  8e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  33.54 
 
 		 495 aa  260  4e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  35.85 
 
 		 464 aa  259  9e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2013  amino acid permease-associated region  36.5 
 
 		 501 aa  258  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6322  amino acid permease-associated region  34.01 
 
 		 503 aa  258  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393049  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  36.34 
 
 		 476 aa  257  3e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  34.82 
 
 		 504 aa  256  4e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  35.68 
 
 		 469 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  35.98 
 
 		 488 aa  255  1.0000000000000001e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>