More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0546 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0546  major facilitator superfamily permease  100 
 
 		 448 aa  875    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000674821  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1299  major facilitator transporter  43.01 
 
 		 479 aa  355  1e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0192  major facilitator superfamily permease  49.25 
 
 		 456 aa  346  5e-94  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0877  major facilitator superfamily permease  33.97 
 
 		 496 aa  217  2.9999999999999998e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.192576  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1519  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.55 
 
 		 502 aa  213  3.9999999999999995e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0659  permease of the major facilitator superfamily  33.67 
 
 		 683 aa  209  8e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0725  major facilitator superfamily permease  31.57 
 
 		 490 aa  209  1e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.29773 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.25 
 
 		 561 aa  203  6e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0683901  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2488  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.1 
 
 		 479 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2440  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.1 
 
 		 479 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3251  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.94 
 
 		 492 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2014  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.25 
 
 		 513 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.06 
 
 		 491 aa  194  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3232  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.26 
 
 		 513 aa  193  5e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.01 
 
 		 658 aa  192  9e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2937  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.84 
 
 		 492 aa  192  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3230  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.7 
 
 		 492 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3240  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.2 
 
 		 492 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.45 
 
 		 492 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218586  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2982  multidrug resistance protein B  31.7 
 
 		 492 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2922  multidrug resistance protein B  31.45 
 
 		 492 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.45 
 
 		 492 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0356226  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2909  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.93 
 
 		 635 aa  186  7e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000610887  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1833  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.44 
 
 		 564 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0281974  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3194  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.83 
 
 		 484 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.794509  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1003  lincomycin resistance protein LmrB  32.3 
 
 		 480 aa  183  6e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.2001  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0268  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.02 
 
 		 500 aa  182  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0312698  decreased coverage  0.00157172 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0734  lincomycin resistance protein  32.3 
 
 		 480 aa  182  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.498733  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30030  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.68 
 
 		 487 aa  182  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00171806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1863  major facilitator superfamily permease  30.32 
 
 		 465 aa  181  2e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0147099  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1880  major facilitator superfamily permease  31.74 
 
 		 503 aa  181  2.9999999999999997e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2448  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.47 
 
 		 570 aa  180  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0959  permease, general substrate transporter  32.02 
 
 		 482 aa  180  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0281229  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2739  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.77 
 
 		 482 aa  179  7e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000169232  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2340  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.66 
 
 		 472 aa  178  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0971  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.77 
 
 		 482 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1038  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.77 
 
 		 482 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4399  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.66 
 
 		 597 aa  179  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00696651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1116  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.94 
 
 		 482 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000271146 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.37 
 
 		 579 aa  179  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.11 
 
 		 490 aa  177  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0845  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.31 
 
 		 489 aa  177  5e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.222515  normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0949  permease, general substrate transporter  31.94 
 
 		 482 aa  176  8e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000025972  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22510  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.85 
 
 		 494 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.319093  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02600  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.35 
 
 		 505 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4692  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.91 
 
 		 599 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000143582  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4699  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.67 
 
 		 599 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4676  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.91 
 
 		 599 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00195609  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1707  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.96 
 
 		 499 aa  173  5e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00395265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4299  multidrug resistance protein B  29.91 
 
 		 599 aa  173  5e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.649426  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05820  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.03 
 
 		 510 aa  173  5e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.835158  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0561  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.67 
 
 		 599 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000151463  hitchhiker  0.00000000000000678179 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4464  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.67 
 
 		 599 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.737474  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4310  multidrug resistance protein B  29.67 
 
 		 599 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2422  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.75 
 
 		 643 aa  172  6.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.845412  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4812  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.67 
 
 		 599 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.127812  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2376  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.75 
 
 		 643 aa  172  6.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4683  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.67 
 
 		 599 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.74665e-44 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0354  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-2 (14 Spanner) (DHA2) family protein  29.13 
 
 		 542 aa  172  1e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0845  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.19 
 
 		 491 aa  170  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06270  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.17 
 
 		 490 aa  170  6e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08630  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.09 
 
 		 509 aa  169  8e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.315329 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1459  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.15 
 
 		 483 aa  168  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.257317  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0988  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.44 
 
 		 491 aa  168  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1318  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.64 
 
 		 465 aa  168  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1028  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.94 
 
 		 491 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10576e-22 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14700  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31 
 
 		 491 aa  167  4e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0438074  normal  0.116411 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0888  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.94 
 
 		 486 aa  167  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.94 
 
 		 486 aa  167  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1766  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.51 
 
 		 479 aa  166  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.239731  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1115  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.19 
 
 		 491 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4325  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.69 
 
 		 491 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1468  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.35 
 
 		 491 aa  165  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.986472  normal  0.151461 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0161  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.29 
 
 		 494 aa  164  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0998  putative permease  29.13 
 
 		 548 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2667  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.96 
 
 		 485 aa  163  5.0000000000000005e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0905281  normal  0.424193 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2198  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.74 
 
 		 481 aa  162  9e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0460557  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2236  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.74 
 
 		 481 aa  162  9e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.126562  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2489  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.37 
 
 		 657 aa  162  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1383  major facilitator superfamily permease  30.24 
 
 		 519 aa  161  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.601618  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5520  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.28 
 
 		 502 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2424  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.97 
 
 		 496 aa  159  9e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.153591 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1378  major facilitator superfamily permease  29.49 
 
 		 512 aa  152  1e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0602023  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.48 
 
 		 500 aa  152  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000893352  hitchhiker  0.00471574 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.02 
 
 		 620 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.892029  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.44 
 
 		 492 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008528  OEOE_1853  major facilitator superfamily permease  29.79 
 
 		 471 aa  148  2.0000000000000003e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013170  Ccur_11090  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.8 
 
 		 640 aa  144  3e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000431734  normal  1 
 
 
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NC_008530  LGAS_1423  major facilitator superfamily permease  29.17 
 
 		 464 aa  143  7e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.904673  hitchhiker  0.0000661431 
 
 
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NC_007005  Psyr_2586  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.77 
 
 		 468 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.941296  hitchhiker  0.00272882 
 
 
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NC_012912  Dd1591_2675  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.98 
 
 		 482 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_3254  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.42 
 
 		 531 aa  139  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.78 
 
 		 534 aa  138  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
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NC_013204  Elen_2756  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.74 
 
 		 471 aa  133  6e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010333  Caul_5403  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.16 
 
 		 537 aa  133  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013203  Apar_0425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.87 
 
 		 485 aa  130  4.0000000000000003e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008148  Rxyl_1058  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 471 aa  130  7.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.111803  n/a   
 
 
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NC_004116  SAG1088  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.14 
 
 		 446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009513  Lreu_0280  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 466 aa  128  3e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040332  n/a   
 
 
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NC_008528  OEOE_0290  major facilitator superfamily permease  26.2 
 
 		 463 aa  127  4.0000000000000003e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.146864  n/a   
 
 
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