More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1870 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  78.07 
 
 		 425 aa  691    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 423 aa  872    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  81.56 
 
 		 425 aa  716    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  62.82 
 
 		 424 aa  555  1e-157  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1621  seryl-tRNA synthetase  62.38 
 
 		 436 aa  557  1e-157  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00511187  normal  0.0677576 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  60.43 
 
 		 435 aa  550  1e-155  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000017376  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  62.35 
 
 		 424 aa  546  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  61.88 
 
 		 424 aa  542  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0182  seryl-tRNA synthetase  63.08 
 
 		 435 aa  541  1e-153  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.38997  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  61.65 
 
 		 424 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  61.41 
 
 		 424 aa  536  1e-151  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  61.41 
 
 		 424 aa  535  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  61.41 
 
 		 424 aa  535  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  61.18 
 
 		 424 aa  535  1e-151  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  61.41 
 
 		 424 aa  535  1e-151  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  61.41 
 
 		 424 aa  535  1e-151  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  61.41 
 
 		 424 aa  535  1e-151  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  61.18 
 
 		 424 aa  534  1e-150  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  61.18 
 
 		 424 aa  533  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  61.79 
 
 		 424 aa  523  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  60.38 
 
 		 423 aa  522  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  61.32 
 
 		 422 aa  523  1e-147  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  59.43 
 
 		 422 aa  518  1e-146  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  60.47 
 
 		 424 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0440  seryl-tRNA synthetase  60.37 
 
 		 439 aa  517  1.0000000000000001e-145  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  59.53 
 
 		 427 aa  513  1e-144  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  60.61 
 
 		 423 aa  509  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  59.06 
 
 		 422 aa  506  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  57.55 
 
 		 422 aa  502  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  58.25 
 
 		 422 aa  503  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  57.31 
 
 		 422 aa  499  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  59.29 
 
 		 423 aa  499  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  57.55 
 
 		 427 aa  495  1e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  57.86 
 
 		 428 aa  494  9.999999999999999e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  57.08 
 
 		 423 aa  493  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  55.66 
 
 		 420 aa  489  1e-137  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  58.49 
 
 		 423 aa  488  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  56.74 
 
 		 423 aa  489  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  56.6 
 
 		 424 aa  485  1e-136  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  58.23 
 
 		 422 aa  485  1e-136  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  56.94 
 
 		 421 aa  486  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  55.21 
 
 		 432 aa  486  1e-136  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  56.13 
 
 		 425 aa  483  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  55.9 
 
 		 427 aa  483  1e-135  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03450  seryl-tRNA synthetase  56.57 
 
 		 427 aa  482  1e-135  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  55.24 
 
 		 428 aa  479  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1799  seryl-tRNA synthetase  56.78 
 
 		 428 aa  479  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0591455  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  56.13 
 
 		 425 aa  480  1e-134  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  55.24 
 
 		 428 aa  479  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  54.95 
 
 		 425 aa  476  1e-133  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0014  seryl-tRNA synthetase  56.43 
 
 		 425 aa  475  1e-133  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0839  seryl-tRNA synthetase  56.31 
 
 		 433 aa  477  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  55.04 
 
 		 427 aa  476  1e-133  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  56.57 
 
 		 428 aa  472  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28180  seryl-tRNA synthetase  55.16 
 
 		 426 aa  471  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.044076  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2991  seryl-tRNA synthetase  55.99 
 
 		 429 aa  474  1e-132  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2131  seryl-tRNA synthetase  56.31 
 
 		 428 aa  474  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131347  normal  0.0177706 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  54.72 
 
 		 426 aa  473  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2419  seryl-tRNA synthetase  56.07 
 
 		 433 aa  474  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  55.06 
 
 		 423 aa  471  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3435  seryl-tRNA synthetase  56.34 
 
 		 431 aa  472  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2020  seryl-tRNA synthetase  56.78 
 
 		 428 aa  473  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000521115  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  56.19 
 
 		 425 aa  474  1e-132  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0851  seryl-tRNA synthetase  55.61 
 
 		 433 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0642  seryl-tRNA synthetase  55.63 
 
 		 432 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4082  seryl-tRNA synthetase  55.37 
 
 		 433 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.159254  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  55.4 
 
 		 427 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  56.1 
 
 		 431 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0940  seryl-tRNA synthetase  55.14 
 
 		 433 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.874713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0500  seryl-tRNA synthetase  55.14 
 
 		 433 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0912435  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  56.71 
 
 		 423 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26270  seryl-tRNA synthetase  55.04 
 
 		 428 aa  470  1.0000000000000001e-131  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0979  seryl-tRNA synthetase  55.14 
 
 		 433 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3038  seryl-tRNA synthetase  55.14 
 
 		 433 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2118  seryl-tRNA synthetase  55.14 
 
 		 433 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.510487  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2195  seryl-tRNA synthetase  57.24 
 
 		 428 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000518192  normal  0.265088 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3072  seryl-tRNA synthetase  55.14 
 
 		 433 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0946131  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2319  seryl-tRNA synthetase  57.01 
 
 		 428 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000145216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2626  seryl-tRNA synthetase  55.14 
 
 		 433 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18292  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2986  seryl-tRNA synthetase  55.14 
 
 		 433 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.340897  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2384  seryl-tRNA synthetase  54.93 
 
 		 426 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617953 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2160  seryl-tRNA synthetase  57.01 
 
 		 428 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0336189  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1986  seryl-tRNA synthetase  55.14 
 
 		 433 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1565  seryl-tRNA synthetase  55.14 
 
 		 433 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.382494  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3853  seryl-tRNA synthetase  52.36 
 
 		 435 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2211  seryl-tRNA synthetase  57.01 
 
 		 428 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000908788  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1129  seryl-tRNA synthetase  54.19 
 
 		 432 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0794  seryl-tRNA synthetase  55.14 
 
 		 433 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1073  seryl-tRNA synthetase  53.6 
 
 		 430 aa  467  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441533 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2337  seryl-tRNA synthetase  54.23 
 
 		 438 aa  462  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.252974 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1768  seryl-tRNA synthetase  54.78 
 
 		 430 aa  462  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.865452  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2594  seryl-tRNA synthetase  54.91 
 
 		 434 aa  464  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365068  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  53.11 
 
 		 423 aa  463  1e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3582  seryl-tRNA synthetase  54.23 
 
 		 426 aa  464  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0780205  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1747  seryl-tRNA synthetase  56.31 
 
 		 428 aa  464  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.387448  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0695  seryl-tRNA synthetase  54.88 
 
 		 435 aa  464  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2229  seryl-tRNA synthetase  56.31 
 
 		 428 aa  462  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0252643  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  54.82 
 
 		 427 aa  462  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2310  seryl-tRNA synthetase  56.78 
 
 		 428 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3243  seryl-tRNA synthetase  54.48 
 
 		 452 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.581766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>