158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0357 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0357  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  345  2e-94  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  35.16 
 
 
182 aa  110  1e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  9.40294e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0726  biotin synthase  40.79 
 
 
179 aa  106  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  1.4315e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  28.81 
 
 
184 aa  95.5  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  2.66759e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  34.55 
 
 
197 aa  92.4  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1597  hypothetical protein  38.85 
 
 
177 aa  91.7  6e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839094  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  35.98 
 
 
184 aa  89.4  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  35.95 
 
 
192 aa  89.4  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  35.88 
 
 
167 aa  89  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  1.11141e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  36.46 
 
 
179 aa  87.8  8e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02210  hypothetical protein  33.7 
 
 
194 aa  82.4  4e-15  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  34.21 
 
 
195 aa  82  4e-15  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0659  BioY protein  38.16 
 
 
171 aa  82  4e-15  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.728186  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  39.16 
 
 
178 aa  81.6  6e-15  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  52.17 
 
 
182 aa  81.6  6e-15  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0610  BioY protein  37.89 
 
 
174 aa  80.9  1e-14  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  7.75885e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  36.76 
 
 
207 aa  80.5  1e-14  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  36.13 
 
 
189 aa  79  3e-14  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  40.16 
 
 
199 aa  79.3  3e-14  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  35.58 
 
 
187 aa  79  4e-14  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  36.03 
 
 
205 aa  77.8  7e-14  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  32.96 
 
 
189 aa  77.8  7e-14  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_004310  BR1719  BioY family protein  32.39 
 
 
191 aa  76.6  2e-13  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  39.35 
 
 
169 aa  76.3  2e-13  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1662  BioY family protein  32.39 
 
 
191 aa  76.6  2e-13  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  30.52 
 
 
206 aa  75.1  5e-13  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  34.13 
 
 
189 aa  75.1  5e-13  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  33.95 
 
 
197 aa  75.1  5e-13  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4329  BioY protein  34.91 
 
 
212 aa  74.7  6e-13  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.373185 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0398  BioY family protein  35.83 
 
 
179 aa  73.2  2e-12  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  9.49175e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3011  BioY protein  30.17 
 
 
187 aa  72.8  2e-12  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131178  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  34.62 
 
 
169 aa  73.2  2e-12  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  34.62 
 
 
169 aa  73.2  2e-12  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  33.55 
 
 
182 aa  72.4  3e-12  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.2911e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3688  BioY protein  33.53 
 
 
190 aa  72  4e-12  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.983357  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2889  BioY protein  31.18 
 
 
197 aa  72.4  4e-12  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  38.75 
 
 
169 aa  71.6  5e-12  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  32.91 
 
 
203 aa  71.6  5e-12  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  34.52 
 
 
224 aa  71.6  5e-12  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  30.9 
 
 
184 aa  72  5e-12  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0463  BioY family protein  34.83 
 
 
179 aa  70.9  9e-12  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0230  BioY protein  31.79 
 
 
204 aa  70.9  1e-11  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.949273  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1496  hypothetical protein  29.53 
 
 
165 aa  69.7  2e-11  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.41192 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1198  BioY protein  28.42 
 
 
191 aa  69.7  2e-11  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  26.83 
 
 
187 aa  68.6  5e-11  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  31.09 
 
 
191 aa  68.2  6e-11  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  1.66456e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0638  BioY family protein  33.71 
 
 
196 aa  68.2  7e-11  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.532905  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  45.19 
 
 
231 aa  67.4  1e-10  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1788  BioY protein  37.68 
 
 
169 aa  67  1e-10  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1206  bioY family protein  30.05 
 
 
175 aa  66.6  2e-10  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  33.33 
 
 
182 aa  67  2e-10  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  3.03529e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  30.9 
 
 
191 aa  65.9  3e-10  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  30.9 
 
 
191 aa  65.9  3e-10  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  7.0307e-10  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  31.43 
 
 
210 aa  65.5  4e-10  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2330  BioY protein  31.74 
 
 
196 aa  65.5  4e-10  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1855  BioY protein  47.14 
 
 
216 aa  65.1  5e-10  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2901  BioY protein  41.49 
 
 
208 aa  64.7  6e-10  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  3.26686e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0132  hypothetical protein  34.39 
 
 
176 aa  64.7  7e-10  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0233  BioY protein  28.57 
 
 
197 aa  63.9  1e-09  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0901  BioY protein  35.07 
 
 
208 aa  64.3  1e-09  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2954  BioY family protein  51.47 
 
 
180 aa  63.9  1e-09  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.716157  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1953  hypothetical protein  30.85 
 
 
189 aa  63.5  1e-09  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.327178  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  37 
 
 
205 aa  63.9  1e-09  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02230  hypothetical protein  33.89 
 
 
188 aa  63.2  2e-09  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3464  BioY protein  31.51 
 
 
205 aa  63.2  2e-09  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3349  BioY protein  29.61 
 
 
207 aa  63.5  2e-09  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1123  BioY protein  37.14 
 
 
197 aa  62.8  3e-09  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.432616  normal  0.483731 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1681  BioY protein  48.68 
 
 
225 aa  62.4  4e-09  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0575  BioY protein  34.46 
 
 
185 aa  62  4e-09  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3228  BioY protein  32 
 
 
201 aa  62  4e-09  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1515  bioY family protein  37.31 
 
 
184 aa  62  4e-09  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00248245  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  36.03 
 
 
182 aa  61.6  7e-09  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1864  BioY family protein  31.33 
 
 
182 aa  61.2  8e-09  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8405  BioY family protein  37.5 
 
 
189 aa  60.8  9e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21840  hypothetical protein  30.73 
 
 
212 aa  60.8  1e-08  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3444  BioY protein  37.41 
 
 
181 aa  60.8  1e-08  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3020  BioY protein  34.13 
 
 
201 aa  60.5  1e-08  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0516  hypothetical protein  29.78 
 
 
180 aa  59.7  2e-08  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0355774  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4638  BioY protein  35.94 
 
 
203 aa  60.1  2e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0169  BioY protein  32.48 
 
 
187 aa  59.3  3e-08  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  9.89963e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2445  BioY protein  37.12 
 
 
198 aa  59.3  3e-08  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  2.83482e-06  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3005  BioY protein  32.48 
 
 
200 aa  58.9  4e-08  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.312874  normal  0.884214 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0568  BioY protein  42.55 
 
 
193 aa  58.9  4e-08  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.936427  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1924  BioY family protein  33.57 
 
 
145 aa  58.9  4e-08  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0996  BioY protein  30.38 
 
 
191 aa  58.5  5e-08  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  34.48 
 
 
187 aa  58.2  6e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0571  BioY protein  42.55 
 
 
193 aa  58.5  6e-08  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0506  BioY family protein  30.06 
 
 
199 aa  58.2  7e-08  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.529292  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0509  BioY family protein  30.06 
 
 
199 aa  58.2  7e-08  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0539  BioY protein  41.49 
 
 
193 aa  58.2  7e-08  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.252714  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  30.66 
 
 
199 aa  57.8  8e-08  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01740  hypothetical protein  38.41 
 
 
204 aa  57  1e-07  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.770223 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1200  BioY family protein  41.25 
 
 
216 aa  57  1e-07  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.3254e-06 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4131  BioY protein  33.52 
 
 
189 aa  57  1e-07  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3745  BioY protein  32.16 
 
 
190 aa  57.4  1e-07  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  4.21582e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0144  BioY protein  35.15 
 
 
200 aa  57.4  1e-07  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21370  hypothetical protein  31.79 
 
 
205 aa  56.6  2e-07  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.283174  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5281  BioY protein  28.77 
 
 
202 aa  56.6  2e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.170405  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5660  BioY protein  28.77 
 
 
202 aa  56.6  2e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3737  bioY family protein  31.77 
 
 
191 aa  57  2e-07  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.776545  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>