More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0085 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1259  ABC transporter ATPase  63.82 
 
 		 512 aa  650    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1049  ABC transporter, ATP-binding protein  62.13 
 
 		 513 aa  657    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000311302  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0362  ABC transporter related  58.8 
 
 		 517 aa  644    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0008233  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0136  ABC transporter, ATP-binding protein  66.8 
 
 		 518 aa  719    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.997167  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0136  ABC transporter ATPase  66.6 
 
 		 518 aa  719    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0085  ABC transporter ATPase  100 
 
 		 517 aa  1055    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1384  ABC transporter related  57.53 
 
 		 518 aa  617  1e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000721481  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3134  ABC transporter related  57.92 
 
 		 518 aa  610  1e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000407492  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1812  ABC transporter related  57.34 
 
 		 518 aa  587  1e-166  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0780  ABC transporter related  56.56 
 
 		 518 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.32097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3951  ABC transporter-related protein  50.88 
 
 		 517 aa  531  1e-150  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5225  ABC transporter related  51.07 
 
 		 517 aa  533  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5564  ABC transporter, ATP-binding protein  50.78 
 
 		 530 aa  526  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5614  ABC transporter ATP-binding protein uup  50.58 
 
 		 517 aa  525  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5556  ABC transporter, ATP-binding protein  50.39 
 
 		 517 aa  524  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5108  ABC transporter, ATP-binding protein  50.97 
 
 		 517 aa  523  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5391  ABC transporter ATP-binding protein uup  50.58 
 
 		 517 aa  524  1e-147  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.975111  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5281  ABC transporter ATP-binding protein  50.49 
 
 		 517 aa  519  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5125  ABC transporter, ATP-binding protein  50.68 
 
 		 517 aa  521  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.525386  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5524  ABC transporter, ATP-binding protein  50.68 
 
 		 517 aa  521  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5678  ABC transporter ATP-binding protein  50.49 
 
 		 517 aa  519  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0361  ABC transporter, ATP-binding protein  47.98 
 
 		 514 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.749336  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0495  ABC transporter, ATP-binding protein  47.78 
 
 		 514 aa  443  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0497  ABC transporter, ATP-binding protein  47.59 
 
 		 514 aa  442  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0358  ABC transporter, ATP-binding protein  47.21 
 
 		 514 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.908649  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0365  ABC transporter related  46.39 
 
 		 510 aa  437  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4875  ABC transporter, ATP-binding protein  47.17 
 
 		 514 aa  432  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.870616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0427  ABC transporter, ATP-binding protein  47.98 
 
 		 514 aa  422  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0370  ABC transporter ATP-binding protein  47.98 
 
 		 514 aa  422  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0384  ABC transporter ATP-binding protein  47.98 
 
 		 514 aa  422  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1433  ABC transporter ATPase  41.33 
 
 		 523 aa  397  1e-109  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1711  ABC transporter ATPase  44.02 
 
 		 515 aa  390  1e-107  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000524631 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1915  ABC transporter ATPase  40.31 
 
 		 518 aa  386  1e-106  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1814  ABC transporter related  39.19 
 
 		 513 aa  379  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0023  ABC transporter ATP-binding protein  39.65 
 
 		 515 aa  375  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.190618 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5240  ABC transporter, ATP-binding protein  39.77 
 
 		 515 aa  378  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1037  ABC transporter related  37.52 
 
 		 510 aa  356  5e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl053  multidrug ABC transporter ATP-binding component  39.57 
 
 		 512 aa  355  1e-96  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002191  glutathione-regulated potassium-efflux system ATP-binding protein  38.85 
 
 		 523 aa  353  2.9999999999999997e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.742712  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0123  ABC transporter, ATP-binding protein  38.79 
 
 		 512 aa  350  2e-95  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.608818  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  38.34 
 
 		 644 aa  340  4e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  36.05 
 
 		 641 aa  335  1e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  36.56 
 
 		 659 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4364  ABC transporter related  36.45 
 
 		 519 aa  325  2e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  34.5 
 
 		 635 aa  322  9.000000000000001e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  35.85 
 
 		 644 aa  320  3e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  34.76 
 
 		 636 aa  320  3e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  36.22 
 
 		 638 aa  320  5e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  35.8 
 
 		 662 aa  320  6e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  36.05 
 
 		 644 aa  320  6e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  36.05 
 
 		 640 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  36.19 
 
 		 658 aa  319  9e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  35.99 
 
 		 658 aa  318  1e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  35.99 
 
 		 658 aa  317  2e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  35.8 
 
 		 659 aa  318  2e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  35.99 
 
 		 658 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  35.98 
 
 		 658 aa  316  5e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  34.83 
 
 		 636 aa  312  1e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  35.19 
 
 		 643 aa  312  1e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  34.11 
 
 		 639 aa  307  3e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  33.79 
 
 		 668 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  35.47 
 
 		 581 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1658  ABC transporter, ATP-binding protein  35.74 
 
 		 644 aa  300  4e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0768628  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  36.19 
 
 		 642 aa  300  4e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  36.79 
 
 		 641 aa  300  4e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  36.19 
 
 		 642 aa  300  4e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  33.85 
 
 		 649 aa  296  4e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  33.91 
 
 		 634 aa  296  7e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  36.94 
 
 		 645 aa  295  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  33.4 
 
 		 645 aa  294  3e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  36.12 
 
 		 575 aa  294  3e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  35.01 
 
 		 560 aa  292  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  35.81 
 
 		 645 aa  291  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  34.51 
 
 		 541 aa  290  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2217  ABC transporter related  34.63 
 
 		 565 aa  290  6e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  34.59 
 
 		 544 aa  289  9e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  34.66 
 
 		 639 aa  288  1e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  34.16 
 
 		 690 aa  287  2.9999999999999996e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  34.51 
 
 		 545 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  33.14 
 
 		 634 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  33.97 
 
 		 564 aa  286  4e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  34.09 
 
 		 542 aa  286  9e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  33.52 
 
 		 543 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0719  ABC transporter related  34.68 
 
 		 540 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.363919 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  33.46 
 
 		 540 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  34.05 
 
 		 630 aa  282  1e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  33.66 
 
 		 535 aa  281  2e-74  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0840  ABC transporter related  33.53 
 
 		 540 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0949  ABC transporter related  32.94 
 
 		 540 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  36.4 
 
 		 569 aa  280  5e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  33.47 
 
 		 540 aa  280  6e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  33.27 
 
 		 549 aa  279  7e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  34.62 
 
 		 649 aa  278  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0961  ABC transporter related  33.78 
 
 		 641 aa  279  1e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5212  ABC transporter related  33.4 
 
 		 539 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  32.49 
 
 		 545 aa  278  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.42 
 
 		 645 aa  277  3e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  33.09 
 
 		 659 aa  277  3e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  34.03 
 
 		 666 aa  277  3e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  35.26 
 
 		 632 aa  278  3e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>