More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1711 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1711  ABC transporter ATPase  100 
 
 		 515 aa  1051    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000524631 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1814  ABC transporter related  50.68 
 
 		 513 aa  551  1e-155  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1433  ABC transporter ATPase  51.16 
 
 		 523 aa  541  1e-153  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5240  ABC transporter, ATP-binding protein  49.51 
 
 		 515 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0023  ABC transporter ATP-binding protein  49.61 
 
 		 515 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.190618 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1915  ABC transporter ATPase  51.3 
 
 		 518 aa  526  1e-148  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4364  ABC transporter related  46.68 
 
 		 519 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1037  ABC transporter related  44.34 
 
 		 510 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0136  ABC transporter, ATP-binding protein  44.73 
 
 		 518 aa  442  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.997167  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0136  ABC transporter ATPase  43.85 
 
 		 518 aa  443  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1049  ABC transporter, ATP-binding protein  43.55 
 
 		 513 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000311302  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1384  ABC transporter related  45.14 
 
 		 518 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000721481  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002191  glutathione-regulated potassium-efflux system ATP-binding protein  43.03 
 
 		 523 aa  436  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.742712  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1259  ABC transporter ATPase  43.73 
 
 		 512 aa  434  1e-120  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0780  ABC transporter related  44.55 
 
 		 518 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.32097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3951  ABC transporter-related protein  42.91 
 
 		 517 aa  431  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5108  ABC transporter, ATP-binding protein  43.35 
 
 		 517 aa  425  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1812  ABC transporter related  44.55 
 
 		 518 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5281  ABC transporter ATP-binding protein  43.16 
 
 		 517 aa  423  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5125  ABC transporter, ATP-binding protein  43.35 
 
 		 517 aa  424  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.525386  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3134  ABC transporter related  44.08 
 
 		 518 aa  424  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000407492  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5678  ABC transporter ATP-binding protein  43.16 
 
 		 517 aa  423  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5225  ABC transporter related  42.33 
 
 		 517 aa  424  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5556  ABC transporter, ATP-binding protein  42.91 
 
 		 517 aa  422  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5614  ABC transporter ATP-binding protein uup  42.75 
 
 		 517 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0497  ABC transporter, ATP-binding protein  43.99 
 
 		 514 aa  423  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5524  ABC transporter, ATP-binding protein  43.35 
 
 		 517 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0495  ABC transporter, ATP-binding protein  43.8 
 
 		 514 aa  420  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5564  ABC transporter, ATP-binding protein  42.55 
 
 		 530 aa  421  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0361  ABC transporter, ATP-binding protein  43.6 
 
 		 514 aa  418  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.749336  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0358  ABC transporter, ATP-binding protein  44.1 
 
 		 514 aa  422  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.908649  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0365  ABC transporter related  44.55 
 
 		 510 aa  419  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5391  ABC transporter ATP-binding protein uup  42.75 
 
 		 517 aa  421  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.975111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4875  ABC transporter, ATP-binding protein  44.38 
 
 		 514 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.870616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0085  ABC transporter ATPase  44.02 
 
 		 517 aa  412  1e-114  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0362  ABC transporter related  41.44 
 
 		 517 aa  411  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0008233  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0370  ABC transporter ATP-binding protein  43.41 
 
 		 514 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0384  ABC transporter ATP-binding protein  43.41 
 
 		 514 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0427  ABC transporter, ATP-binding protein  43.41 
 
 		 514 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0123  ABC transporter, ATP-binding protein  39.18 
 
 		 512 aa  367  1e-100  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.608818  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl053  multidrug ABC transporter ATP-binding component  40.19 
 
 		 512 aa  360  3e-98  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  34.94 
 
 		 634 aa  321  1.9999999999999998e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  35.25 
 
 		 659 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  35.69 
 
 		 644 aa  312  1e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  33.66 
 
 		 645 aa  311  2.9999999999999997e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  34.85 
 
 		 658 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  34.79 
 
 		 635 aa  306  8.000000000000001e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  34.52 
 
 		 644 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  34.46 
 
 		 662 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  34.52 
 
 		 640 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  34.65 
 
 		 658 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  34.32 
 
 		 644 aa  301  1e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  34.46 
 
 		 658 aa  301  1e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  34.46 
 
 		 658 aa  301  2e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  34.46 
 
 		 658 aa  301  2e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  33.07 
 
 		 643 aa  301  2e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  34.46 
 
 		 659 aa  300  3e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  35.19 
 
 		 666 aa  300  4e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  33.86 
 
 		 636 aa  298  1e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  35.31 
 
 		 638 aa  295  1e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  34.38 
 
 		 641 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  33.08 
 
 		 634 aa  295  2e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  33.59 
 
 		 581 aa  293  6e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  33.59 
 
 		 575 aa  291  2e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2727  ABC transporter related  33.85 
 
 		 649 aa  290  4e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.26231  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  32.8 
 
 		 639 aa  288  1e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  32.82 
 
 		 564 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  35.05 
 
 		 630 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2217  ABC transporter related  33.07 
 
 		 565 aa  286  7e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0949  ABC transporter related  34.13 
 
 		 540 aa  286  9e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.92 
 
 		 645 aa  285  2.0000000000000002e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  33.13 
 
 		 545 aa  284  3.0000000000000004e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  32.16 
 
 		 639 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1721  ABC transporter, ATP-binding protein  36.78 
 
 		 643 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269264  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1449  ABC transporter  36.78 
 
 		 643 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.174197  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  32.02 
 
 		 560 aa  283  7.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  32.07 
 
 		 540 aa  282  9e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  33.6 
 
 		 636 aa  282  1e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1658  ABC transporter, ATP-binding protein  32.63 
 
 		 644 aa  281  2e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0768628  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  33.01 
 
 		 642 aa  281  2e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  33.01 
 
 		 642 aa  281  2e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  32.59 
 
 		 540 aa  281  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  32.95 
 
 		 549 aa  281  3e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  32.15 
 
 		 541 aa  280  5e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  34.71 
 
 		 630 aa  278  1e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  32.07 
 
 		 540 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0373  ABC transporter related  33.27 
 
 		 657 aa  277  3e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1642  ABC transporter related  33.79 
 
 		 632 aa  277  3e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2198  ABC transporter ATP-binding protein  33.93 
 
 		 529 aa  277  3e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0113236  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  31.98 
 
 		 540 aa  277  4e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  31.98 
 
 		 540 aa  277  4e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0741  ABC transporter related  32.02 
 
 		 545 aa  277  4e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0595182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  33.52 
 
 		 544 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5212  ABC transporter related  32.74 
 
 		 539 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0840  ABC transporter related  33.2 
 
 		 540 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  34.64 
 
 		 640 aa  275  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  31.97 
 
 		 690 aa  274  4.0000000000000004e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  33.46 
 
 		 542 aa  273  5.000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  31.68 
 
 		 540 aa  273  7e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49454  ABC(ATP-binding) family transporter  31.49 
 
 		 649 aa  273  7e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00209815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>