More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1037 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1037  ABC transporter related  100 
 
 		 510 aa  1038    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5240  ABC transporter, ATP-binding protein  53.73 
 
 		 515 aa  581  1e-164  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0023  ABC transporter ATP-binding protein  52.76 
 
 		 515 aa  571  1e-161  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.190618 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1814  ABC transporter related  43.53 
 
 		 513 aa  482  1e-135  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1433  ABC transporter ATPase  43.95 
 
 		 523 aa  461  9.999999999999999e-129  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1915  ABC transporter ATPase  41.96 
 
 		 518 aa  458  1e-127  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4364  ABC transporter related  42.72 
 
 		 519 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1711  ABC transporter ATPase  44.34 
 
 		 515 aa  433  1e-120  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000524631 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002191  glutathione-regulated potassium-efflux system ATP-binding protein  40.86 
 
 		 523 aa  431  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.742712  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1049  ABC transporter, ATP-binding protein  39.73 
 
 		 513 aa  409  1e-113  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000311302  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3951  ABC transporter-related protein  42.27 
 
 		 517 aa  410  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1259  ABC transporter ATPase  40.32 
 
 		 512 aa  410  1e-113  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5225  ABC transporter related  41.49 
 
 		 517 aa  405  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5281  ABC transporter ATP-binding protein  41.72 
 
 		 517 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5108  ABC transporter, ATP-binding protein  41.52 
 
 		 517 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5125  ABC transporter, ATP-binding protein  41.72 
 
 		 517 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.525386  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5391  ABC transporter ATP-binding protein uup  41.72 
 
 		 517 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.975111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5678  ABC transporter ATP-binding protein  41.72 
 
 		 517 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5524  ABC transporter, ATP-binding protein  41.72 
 
 		 517 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5564  ABC transporter, ATP-binding protein  41.49 
 
 		 530 aa  397  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5556  ABC transporter, ATP-binding protein  41.49 
 
 		 517 aa  397  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0136  ABC transporter, ATP-binding protein  38.78 
 
 		 518 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.997167  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0136  ABC transporter ATPase  38.58 
 
 		 518 aa  396  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5614  ABC transporter ATP-binding protein uup  41.49 
 
 		 517 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1384  ABC transporter related  40.08 
 
 		 518 aa  393  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000721481  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3134  ABC transporter related  40.9 
 
 		 518 aa  392  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000407492  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0495  ABC transporter, ATP-binding protein  41.93 
 
 		 514 aa  388  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1812  ABC transporter related  41.93 
 
 		 518 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0497  ABC transporter, ATP-binding protein  41.14 
 
 		 514 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0361  ABC transporter, ATP-binding protein  41.54 
 
 		 514 aa  384  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.749336  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0358  ABC transporter, ATP-binding protein  41.26 
 
 		 514 aa  384  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.908649  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0365  ABC transporter related  41.68 
 
 		 510 aa  384  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0362  ABC transporter related  37.7 
 
 		 517 aa  383  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0008233  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4875  ABC transporter, ATP-binding protein  42.44 
 
 		 514 aa  376  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.870616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0780  ABC transporter related  40.48 
 
 		 518 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.32097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0085  ABC transporter ATPase  37.52 
 
 		 517 aa  363  4e-99  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0370  ABC transporter ATP-binding protein  41.34 
 
 		 514 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0384  ABC transporter ATP-binding protein  41.34 
 
 		 514 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0427  ABC transporter, ATP-binding protein  41.34 
 
 		 514 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  34.71 
 
 		 643 aa  338  1.9999999999999998e-91  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0123  ABC transporter, ATP-binding protein  36.81 
 
 		 512 aa  335  2e-90  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.608818  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl053  multidrug ABC transporter ATP-binding component  37.2 
 
 		 512 aa  329  8e-89  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  34.76 
 
 		 645 aa  322  9.999999999999999e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  35.71 
 
 		 638 aa  319  7e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  35.85 
 
 		 659 aa  317  3e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  36.1 
 
 		 640 aa  316  6e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  35.91 
 
 		 644 aa  316  7e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  35.85 
 
 		 662 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  36.05 
 
 		 658 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  36.05 
 
 		 658 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  36.05 
 
 		 658 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  36.05 
 
 		 658 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  35.45 
 
 		 634 aa  315  1.9999999999999998e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  35.38 
 
 		 644 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  35.33 
 
 		 644 aa  311  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  35 
 
 		 641 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  35.47 
 
 		 659 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  36.17 
 
 		 642 aa  310  4e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  36.82 
 
 		 630 aa  310  4e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  36.17 
 
 		 642 aa  310  4e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  34.5 
 
 		 636 aa  310  5e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  35.27 
 
 		 658 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1658  ABC transporter, ATP-binding protein  35.2 
 
 		 644 aa  308  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0768628  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  33.53 
 
 		 639 aa  306  6e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1642  ABC transporter related  35.45 
 
 		 632 aa  306  8.000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  34.05 
 
 		 636 aa  303  5.000000000000001e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  33.72 
 
 		 634 aa  301  2e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2727  ABC transporter related  33.01 
 
 		 649 aa  300  5e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.26231  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  33.98 
 
 		 639 aa  299  1e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  33.07 
 
 		 635 aa  295  9e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.98 
 
 		 645 aa  293  4e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  34.38 
 
 		 637 aa  286  7e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1449  ABC transporter  34.36 
 
 		 643 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.174197  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  32.08 
 
 		 659 aa  285  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01021  ABC transporter, ATP binding component  33.85 
 
 		 541 aa  285  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.663375  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01041  ABC transporter, ATP binding component  33.85 
 
 		 541 aa  284  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.15596  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  33.01 
 
 		 540 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1721  ABC transporter, ATP-binding protein  33.98 
 
 		 643 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269264  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  33.72 
 
 		 575 aa  283  5.000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  31.91 
 
 		 540 aa  283  6.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  32.38 
 
 		 542 aa  283  6.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  33.14 
 
 		 564 aa  282  9e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0373  ABC transporter related  34.44 
 
 		 657 aa  282  1e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  32.37 
 
 		 543 aa  281  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  32.82 
 
 		 540 aa  281  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0719  ABC transporter related  30.95 
 
 		 540 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.363919 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  32.75 
 
 		 581 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  34.31 
 
 		 567 aa  280  5e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  32.62 
 
 		 666 aa  279  8e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  31.98 
 
 		 560 aa  278  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  30.6 
 
 		 540 aa  277  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  31.27 
 
 		 544 aa  277  4e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  31.53 
 
 		 540 aa  277  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4007  ABC transporter related protein  34.48 
 
 		 641 aa  277  4e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  31.72 
 
 		 541 aa  276  5e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2217  ABC transporter related  31.72 
 
 		 565 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2156  ABC transporter, ATP-binding protein  32.81 
 
 		 532 aa  274  2.0000000000000002e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  33.08 
 
 		 536 aa  275  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0168  ABC transporter ATP-binding protein  32.81 
 
 		 532 aa  275  2.0000000000000002e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.508364  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  31.19 
 
 		 649 aa  274  3e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>