More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_09590 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_09590  short chain enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
268 aa  536  1e-151  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0374629  normal  0.0718522 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1813  short chain enoyl-CoA hydratase  72.37 
 
 
288 aa  362  3e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  66.15 
 
 
257 aa  341  9e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0590  short chain enoyl-CoA hydratase  68.08 
 
 
262 aa  338  5e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  68.87 
 
 
257 aa  337  9.999999999999999e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  67.7 
 
 
257 aa  329  3e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2936  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  62.84 
 
 
262 aa  325  6e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.2 
 
 
257 aa  319  3e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1281  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.59 
 
 
257 aa  318  3.9999999999999996e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.78 
 
 
257 aa  310  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0254  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  63.85 
 
 
262 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168242  normal  0.0914474 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  59 
 
 
262 aa  306  3e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28460  short chain enoyl-CoA hydratase  61.87 
 
 
259 aa  301  7.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.528871  normal  0.841191 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3662  short chain enoyl-CoA hydratase  63.14 
 
 
258 aa  298  6e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.745999  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4093  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  63.04 
 
 
261 aa  295  4e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6065  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.63 
 
 
259 aa  294  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.638371  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0682  short chain enoyl-CoA hydratase  62.11 
 
 
285 aa  282  5.000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2046  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.43 
 
 
259 aa  279  4e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366637  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1071  enoyl-CoA hydratase/isomerase  62.35 
 
 
258 aa  276  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.540007 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  49.2 
 
 
257 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.64 
 
 
259 aa  216  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.81 
 
 
257 aa  217  2e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.98 
 
 
259 aa  215  5.9999999999999996e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.338476 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.02 
 
 
259 aa  214  9e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.19 
 
 
259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.64 
 
 
259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  48.19 
 
 
277 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  47.01 
 
 
260 aa  212  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.4 
 
 
259 aa  211  7.999999999999999e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  45.2 
 
 
257 aa  209  6e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.2 
 
 
259 aa  206  3e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.58 
 
 
258 aa  205  5e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  46.51 
 
 
259 aa  205  5e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.49 
 
 
258 aa  205  6e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.03 
 
 
262 aa  205  7e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.11 
 
 
253 aa  204  1e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  45.2 
 
 
257 aa  204  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1738  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.53 
 
 
259 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  46.75 
 
 
257 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  45.9 
 
 
257 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.49 
 
 
259 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  44.13 
 
 
258 aa  204  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  45.9 
 
 
257 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  45.9 
 
 
257 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  44.8 
 
 
257 aa  202  3e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  45.15 
 
 
262 aa  203  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  46.47 
 
 
260 aa  201  8e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.82 
 
 
259 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.66 
 
 
259 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.6 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  46.36 
 
 
258 aa  200  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  43.55 
 
 
257 aa  199  3e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.08 
 
 
258 aa  199  5e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44 
 
 
259 aa  198  9e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  45.37 
 
 
262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  45.06 
 
 
259 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3485  enoyl-CoA hydratase  45.56 
 
 
258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000302611  hitchhiker  0.000530427 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  43.44 
 
 
258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  44.8 
 
 
258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.62 
 
 
258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  40.73 
 
 
258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.44 
 
 
258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.63 
 
 
260 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.04 
 
 
259 aa  196  3e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  46.34 
 
 
257 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.08 
 
 
265 aa  196  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2561  enoyl-CoA hydratase  45.56 
 
 
258 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000238691  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0544  enoyl-CoA hydratase  45.56 
 
 
258 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181699  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0474  enoyl-CoA hydratase  44.8 
 
 
258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.0000000000253276  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.44 
 
 
258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0449  enoyl-CoA hydratase  44.8 
 
 
258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000595981  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0516  enoyl-CoA hydratase  45.56 
 
 
258 aa  195  6e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000195576  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.48 
 
 
256 aa  195  8.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  42.4 
 
 
257 aa  194  8.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  44.4 
 
 
258 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.31 
 
 
260 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  43.32 
 
 
258 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.82 
 
 
260 aa  194  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.21 
 
 
257 aa  194  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0716  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.28 
 
 
254 aa  194  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.439165  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.18 
 
 
255 aa  193  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  45.95 
 
 
260 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0471  enoyl-CoA hydratase  45.16 
 
 
258 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000928124  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.27 
 
 
259 aa  194  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.21 
 
 
259 aa  192  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  40.65 
 
 
260 aa  192  4e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2591  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.62 
 
 
258 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000604766  decreased coverage  0.0000000224287 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.13 
 
 
257 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.98 
 
 
260 aa  191  7e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.58 
 
 
259 aa  191  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2688  enoyl-CoA hydratase  43.95 
 
 
258 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000000387614  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.63 
 
 
260 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  40.87 
 
 
258 aa  189  5e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3631  enoyl-CoA hydratase  44.76 
 
 
258 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251765  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0597  short chain enoyl-CoA hydratase  44.76 
 
 
262 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00392493  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  45.38 
 
 
259 aa  189  5.999999999999999e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5078  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.86 
 
 
262 aa  188  8e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  42.4 
 
 
258 aa  188  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  42.34 
 
 
258 aa  188  8e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1430  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  41.87 
 
 
255 aa  187  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>