More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1621 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1621  flagellar hook-associated protein 3  100 
 
 		 302 aa  605  9.999999999999999e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31340  flagellar hook-associated protein 3  37.22 
 
 		 303 aa  183  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0213605 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2042  flagellar hook-associated protein 3  38.02 
 
 		 305 aa  182  7e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.75647 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0831  flagellar hook-associated protein 3  37 
 
 		 298 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.795766  normal  0.995497 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0990  flagellar hook-associated protein 3  33.22 
 
 		 298 aa  159  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2358  flagellar hook-associated protein 3  34.55 
 
 		 292 aa  159  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3001  flagellar hook-associated protein 3  34.32 
 
 		 294 aa  149  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00024747 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0770  flagellar hook-associated protein 3  34.85 
 
 		 305 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3030  flagellar hook-associated protein FlgL  30.87 
 
 		 301 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3227  flagellar hook-associated protein FlgL  30.46 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0747  flagellar hook-associated protein FlgL  29.08 
 
 		 305 aa  133  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0249  flagellar hook-associated protein FlgL  30.59 
 
 		 296 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0021  flagellar hook-associated protein 3  30.48 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0096  flagellar hook-associated protein FlgL  27.92 
 
 		 309 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17130  flagellar hook-associated protein 3  29.77 
 
 		 301 aa  125  7e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0452  flagellar hook-associated protein FlgL  29.04 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3274  flagellar hook-associated protein 3  28.99 
 
 		 299 aa  123  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3042  flagellar hook-associated protein FlgL  28.43 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.947446  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1674  flagellar hook-associated protein FlgL  28.39 
 
 		 315 aa  116  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2235  flagellar hook-associated protein 3  26.59 
 
 		 328 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208019 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3456  flagellar hook-associated protein 3  27.67 
 
 		 295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0671  flagellar hook-associated protein 3  25.72 
 
 		 305 aa  109  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0367286 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2242  flagellar hook-associated protein FlgL  27.34 
 
 		 302 aa  106  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4194  flagellar hook-associated protein 3  28.27 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3754  flagellar hook-associated protein 3  27.64 
 
 		 306 aa  97.8  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0439  flagellin-like  28.95 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3838  flagellar hook-associated protein 3  27.94 
 
 		 306 aa  97.8  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0146959 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  27.54 
 
 		 300 aa  93.6  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1650  flagellar hook-associated protein 3  24.84 
 
 		 297 aa  92.8  6e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0329  flagellar hook-associated protein 3  24.01 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4098  flagellar hook-associated protein 3  29.22 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0603  flagellar hook-associated protein 3  26.32 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.891148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0842  flagellar hook-associated protein 3  24.61 
 
 		 304 aa  85.9  8e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0865  flagellar hook-associated protein 3  24.84 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04919  flagellar hook-associated protein FlgL  25.68 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0759  flagellar hook-associated protein FlgL  25.77 
 
 		 326 aa  83.2  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.847019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2240  flagellar hook-associated protein 3  26.43 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0059  flagellar hook-associated protein 3  24.27 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  27.92 
 
 		 410 aa  79.7  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4306  flagellin domain protein  28.09 
 
 		 263 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3641  flagellin-like protein  27.39 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02918  flagellar hook-associated protein FlgL  32.19 
 
 		 404 aa  75.9  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432868  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000730  flagellar hook-associated protein FlgL  22.9 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1766  flagellar hook-associated protein 3  26.96 
 
 		 313 aa  75.5  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1516  flagellar hook-associated protein FlgL  24.67 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0666  flagellin domain protein  28.57 
 
 		 1008 aa  74.3  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1737  flagellar hook-associated protein FlgL  24.67 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2402  flagellar hook-associated protein 3  26.53 
 
 		 594 aa  73.9  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0216  flagellar hook-associated protein FlgL  26.47 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4305  flagellin domain protein  29.33 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0943523  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2914  flagellar hook-associated protein FlgL  24.17 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0077  flagellin domain protein  26.97 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3151  flagellar hook-associated protein FlgL, putative  30.88 
 
 		 504 aa  72.8  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1331  flagellar hook-associated protein FlgL  27.38 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1352  flagellar hook-associated protein FlgL  24.82 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2525  flagellar hook-associated protein 3  28.31 
 
 		 507 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1556  flagellar hook-associated protein FlgL  23.74 
 
 		 287 aa  72  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416222  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06164  flagellar hook-associated protein FlgL  31.08 
 
 		 401 aa  72  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.80798  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0078  flagellin domain protein  27.33 
 
 		 263 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01002  flagellar hook-associated protein FlgL  31.08 
 
 		 401 aa  72  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0789594  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1350  flagellar hook-associated protein FlgL  28 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0307  flagellar hook-associated protein 3  30.66 
 
 		 514 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0076  flagellin domain protein  26.51 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0065  flagellar hook-associated protein 3  21.98 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3361  flagellar hook-associated protein 3  24.14 
 
 		 309 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0075  flagellin domain protein  26.76 
 
 		 263 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.904628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2840  flagellar hook-associated protein FlgL  30.41 
 
 		 562 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.22747 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1787  flagellar hook-associated protein 3  23.34 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  30.37 
 
 		 420 aa  68.2  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0273  lateral flagellar hook associated protein 3  24.14 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.462118  normal  0.382201 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  26.39 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2038  flagellin domain protein  26.49 
 
 		 295 aa  67  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.416457 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3077  flagellar hook-associated protein FlgL  28.04 
 
 		 396 aa  67  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1759  flagellar hook-associated protein FlgL  25.25 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1945  flagellar hook-associated protein FlgL  33.14 
 
 		 530 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0770249  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1815  flagellar hook-associated protein FlgL  24.32 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3724  flagellin-like  33.86 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2308  flagellar hook-associated protein FlgL  27.27 
 
 		 401 aa  65.5  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.24261 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1705  flagellar hook-associated protein FlgL  23.15 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2035  flagellin domain protein  24.44 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.546619 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3641  flagellar hook-associated protein FlgL  22.82 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0968  flagellin domain protein  25.76 
 
 		 801 aa  63.9  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.743409  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1426  flagellar hook-associated protein FlgL  27.51 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  27.51 
 
 		 403 aa  63.5  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1375  flagellin  25.71 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000344656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1527  flagellar hook-associated protein FlgL  23 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00165478  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2952  flagellar hook-associated protein FlgL  27.51 
 
 		 403 aa  62.4  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2587  flagellar hook-associated protein FlgL  26.98 
 
 		 403 aa  62.4  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1964  flagellar hook-associated protein FlgL  26.56 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2931  flagellin-like  25.08 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.763262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1019  flagellar hook-associated protein 3  26.61 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0352  flagellar hook-associated protein 3  24.45 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0560824 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1462  flagellar hook-associated protein FlgL  24.23 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  hitchhiker  0.000000476574 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2036  flagellin domain protein  26.15 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.391359 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3744  flagellar hook-associated protein FlgL  28.97 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1331  flagellar hook-associated protein FlgL  26.46 
 
 		 403 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal  0.0994213 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2562  flagellin domain protein  23.1 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4380  flagellar hook-associated protein FlgL  27.52 
 
 		 521 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2435  flagellar hook-associated protein 3  24.73 
 
 		 438 aa  60.8  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0193  flagellin-like protein  24.34 
 
 		 870 aa  60.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>