226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0535 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0535  LamB/YcsF family protein  100 
 
 		 256 aa  501  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.884685  normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0083  LamB/YcsF family protein  63.75 
 
 		 304 aa  280  1e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  56.64 
 
 		 256 aa  275  5e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  55.95 
 
 		 254 aa  274  9e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  57.6 
 
 		 252 aa  269  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  59.27 
 
 		 251 aa  268  5e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  58 
 
 		 255 aa  264  8.999999999999999e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  55.12 
 
 		 254 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0870  LamB/YcsF family protein  57.66 
 
 		 255 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19260  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  60.89 
 
 		 255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  53.78 
 
 		 252 aa  251  6e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0320  LamB/YcsF family protein  57.71 
 
 		 257 aa  251  7e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4727  LamB/YcsF family protein  55.6 
 
 		 254 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.812327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4813  LamB/YcsF family protein  55.6 
 
 		 254 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5112  LamB/YcsF family protein  55.6 
 
 		 254 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0608  LamB/YcsF family protein  54.84 
 
 		 253 aa  245  6e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329744  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3558  LamB/YcsF family protein  56.75 
 
 		 255 aa  241  7.999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455471  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5327  LamB/YcsF family protein  52.21 
 
 		 254 aa  236  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0975  LamB/YcsF family protein  53.66 
 
 		 250 aa  233  3e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0323656  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2198  LamB/YcsF family protein  54 
 
 		 250 aa  231  8.000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1970  LamB/YcsF family protein  50.4 
 
 		 254 aa  231  9e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149579  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  47.79 
 
 		 254 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  47.01 
 
 		 257 aa  229  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0093  LamB/YcsF family protein  51.79 
 
 		 252 aa  229  4e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6351  LamB/YcsF family protein  53.41 
 
 		 254 aa  228  5e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2973  LamB/YcsF family protein  52.42 
 
 		 301 aa  228  7e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0191185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  46.8 
 
 		 255 aa  227  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0099  LamB/YcsF family protein  52.78 
 
 		 254 aa  226  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0180068 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2770  LamB/YcsF family protein  53.15 
 
 		 299 aa  225  5.0000000000000005e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00407074  hitchhiker  0.0000126458 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2622  LamB/YcsF family protein  48.63 
 
 		 255 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0541  LamB/YcsF family protein  54.03 
 
 		 249 aa  225  6e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2401  LamB/YcsF family protein  52.55 
 
 		 258 aa  224  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  47.6 
 
 		 255 aa  223  2e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1451  LamB/YcsF family protein  52.59 
 
 		 252 aa  223  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2834  LamB/YcsF family protein  48.59 
 
 		 254 aa  221  6e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0313  LamB/YcsF family protein  50.4 
 
 		 249 aa  220  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2634  LamB/YcsF family protein  48.19 
 
 		 254 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.412357  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  46.37 
 
 		 258 aa  218  8.999999999999998e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3743  LamB/YcsF family protein  46.53 
 
 		 250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819674  normal  0.479135 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00400  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  48.61 
 
 		 252 aa  215  5.9999999999999996e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.736442 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09670  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  51.39 
 
 		 253 aa  214  8e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.33099 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  41.04 
 
 		 257 aa  214  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2802  LamB/YcsF family protein  46.22 
 
 		 273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.785043 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  47.13 
 
 		 253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7092  hypothetical protein  52.02 
 
 		 251 aa  212  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0193  LamB/YcsF family protein  46.53 
 
 		 250 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0374  LamB/YcsF family protein  46.22 
 
 		 274 aa  212  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5927  LamB/YcsF family protein  50.8 
 
 		 252 aa  212  4.9999999999999996e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286455  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1594  LamB/YcsF family protein  42.11 
 
 		 256 aa  211  5.999999999999999e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2226  LamB/YcsF family protein  42.97 
 
 		 254 aa  211  7e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1103  LamB/YcsF family protein  48.21 
 
 		 255 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2905  LamB/YcsF family protein  46.5 
 
 		 250 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.493812 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1257  LamB/YcsF family protein  45.12 
 
 		 245 aa  209  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.187621  normal  0.809316 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3309  LamB/YcsF family protein  45.31 
 
 		 254 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.716241  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0592  LamB/YcsF family protein  47.2 
 
 		 264 aa  208  5e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413581  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2978  LamB/YcsF family protein  45.31 
 
 		 254 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2113  LamB/YcsF family protein  45.31 
 
 		 254 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3370  LamB/YcsF family protein  45.31 
 
 		 254 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1169  LamB/YcsF family protein  45.12 
 
 		 245 aa  208  6e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000136688  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3591  LamB/YcsF family protein  45.12 
 
 		 245 aa  208  6e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01950  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  43.09 
 
 		 255 aa  208  6e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.581711 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1117  LamB/YcsF family protein  45.12 
 
 		 245 aa  208  6e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000433292  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3140  LamB/YcsF family protein  46.22 
 
 		 258 aa  208  6e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0447  LamB/YcsF family protein  45.31 
 
 		 262 aa  208  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0264  LamB/YcsF family protein  45.31 
 
 		 254 aa  207  9e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0974794  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3034  LamB/YcsF family protein  48.16 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.689834 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0251  LamB/YcsF family protein  45.31 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0228  LamB/YcsF family protein  45.71 
 
 		 254 aa  206  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2272  LamB/YcsF family protein  46.34 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  38.55 
 
 		 255 aa  204  8e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  38.55 
 
 		 255 aa  204  8e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0027  LamB/YcsF family protein  44.31 
 
 		 247 aa  204  1e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.529091  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2950  LamB/YcsF family protein  46.53 
 
 		 254 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.815554 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3084  LamB/YcsF family protein  46.53 
 
 		 254 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  39.43 
 
 		 255 aa  202  3e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6386  LamB/YcsF family protein  46.34 
 
 		 254 aa  202  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.631285  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2936  LamB/YcsF family protein  42.91 
 
 		 251 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3426  LamB/YcsF family protein  43.82 
 
 		 256 aa  201  7e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.864417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  38.15 
 
 		 255 aa  201  9e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2425  LamB/YcsF family protein  46.53 
 
 		 274 aa  201  9e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16977  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3039  LamB/YcsF family protein  46.53 
 
 		 274 aa  201  9e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0465  LamB/YcsF family protein  45.02 
 
 		 261 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3058  LamB/YcsF family protein  46.12 
 
 		 254 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0249954 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0096  LamB/YcsF family protein  47.58 
 
 		 249 aa  198  7e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000523388 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1228  LamB/YcsF family protein  41.87 
 
 		 245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5021  LamB/YcsF family protein  46.4 
 
 		 260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  39.2 
 
 		 253 aa  196  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0173  LamB/YcsF family protein  42.34 
 
 		 254 aa  196  3e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  40 
 
 		 253 aa  196  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1216  LamB/YcsF family protein  41.37 
 
 		 245 aa  196  3e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653039  normal  0.072436 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2026  LamB/YcsF family protein  42.97 
 
 		 256 aa  196  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0388826 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  39.2 
 
 		 253 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1138  LamB/YcsF family protein  42.45 
 
 		 245 aa  195  5.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1972  LamB/YcsF family protein  43.15 
 
 		 256 aa  195  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2043  LamB/YcsF family protein  42 
 
 		 256 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4561  LamB/YcsF family protein  46.22 
 
 		 260 aa  195  6e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  0.157453 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4365  LamB/YcsF family protein  43.5 
 
 		 246 aa  195  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0089  LamB/YcsF family protein  43.5 
 
 		 246 aa  194  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0380957  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0005  hypothetical protein  41.7 
 
 		 270 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.76896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1098  LamB/YcsF family protein  41.13 
 
 		 253 aa  194  1e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.248626  normal  0.159804 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>