More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0255 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  100 
 
 		 290 aa  566  1e-160  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.962827  hitchhiker  0.00110837 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0228  Cof-like hydrolase  45.25 
 
 		 272 aa  208  9e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0126  Cof-like hydrolase  48.3 
 
 		 285 aa  203  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0111  Cof-like hydrolase  44.11 
 
 		 272 aa  201  9e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0144  phosphatase YbhA  46.56 
 
 		 265 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00960  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  44.91 
 
 		 282 aa  189  5.999999999999999e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0074  HAD-superfamily hydrolase  43.82 
 
 		 269 aa  186  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.542278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  44.44 
 
 		 278 aa  182  7e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.384246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0293  Cof-like hydrolase  45.42 
 
 		 268 aa  179  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07610  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  44.57 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0517229 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0121  Cof-like hydrolase  42.07 
 
 		 273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1954  Cof-like hydrolase  44.49 
 
 		 274 aa  172  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5023  Cof protein  42.8 
 
 		 271 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0177  HAD family hydrolase  44.92 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0958993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5111  Cof-like hydrolase  42.8 
 
 		 271 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5404  Cof-like hydrolase  42.8 
 
 		 271 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.365978 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2103  Cof-like hydrolase  44.57 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.519808 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1155  Cof-like hydrolase  39.85 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269988  normal  0.0161592 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0280  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  42.05 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4318  Cof protein  45.38 
 
 		 264 aa  161  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.873657 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0158  Cof-like hydrolase  40.37 
 
 		 277 aa  160  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5654  Cof-like hydrolase  39.85 
 
 		 267 aa  158  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166656 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4106  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  39.55 
 
 		 272 aa  143  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.607815  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0560  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  36.4 
 
 		 265 aa  140  3e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0505  Cof-like hydrolase  42.31 
 
 		 303 aa  136  4e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.930441  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13847  hypothetical protein  38.43 
 
 		 273 aa  135  8e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.320421 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0277  Cof-like hydrolase  38.29 
 
 		 259 aa  135  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2937  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  42.37 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0182848  hitchhiker  0.000402295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5588  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase type 3  40.07 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16228  normal  0.729842 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0193  Cof-like hydrolase  37.41 
 
 		 277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0279  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  37.09 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.333001  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0615  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.21 
 
 		 276 aa  117  3e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  36.7 
 
 		 266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452319  hitchhiker  0.00105022 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6169  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  34.91 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3183  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  35.82 
 
 		 265 aa  103  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0375981 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4525  Cof-like hydrolase  34.44 
 
 		 273 aa  99.8  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.992091 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3241  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.96 
 
 		 274 aa  99.8  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5035  HAD family hydrolase  33.21 
 
 		 273 aa  99  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0141  Cof-like hydrolase  34.7 
 
 		 284 aa  99  9e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0380  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  35.85 
 
 		 295 aa  98.2  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.890791 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  31.09 
 
 		 268 aa  97.1  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01700  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  35.61 
 
 		 275 aa  94.4  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.616457 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  25.72 
 
 		 274 aa  93.2  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0216  Cof-like hydrolase  27.96 
 
 		 265 aa  92.4  7e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0217  Cof-like hydrolase  25.27 
 
 		 269 aa  92  9e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0299  Cof-like hydrolase  33.33 
 
 		 259 aa  91.7  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3524  Cof-like hydrolase  31.34 
 
 		 271 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.756821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5573  hypothetical protein  30.43 
 
 		 259 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  26.87 
 
 		 273 aa  90.1  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  28.36 
 
 		 268 aa  90.1  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01160  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.46 
 
 		 269 aa  90.1  4e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  23.91 
 
 		 269 aa  90.1  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0883  Cof-like hydrolase  25.28 
 
 		 269 aa  89.7  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0607  Cof-like hydrolase  30.71 
 
 		 271 aa  89.4  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000496024  normal  0.512599 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1746  Cof-like hydrolase  25.76 
 
 		 262 aa  89  9e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4121  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.37 
 
 		 269 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6168  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  31.25 
 
 		 268 aa  87.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  25.63 
 
 		 279 aa  87.4  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1388  Cof-like hydrolase  25.99 
 
 		 267 aa  87.4  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.323635  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1075  Cof-like hydrolase  26.01 
 
 		 269 aa  87.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1285  HAD superfamily hydrolase  26.37 
 
 		 269 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1087  HAD superfamily hydrolase  26.37 
 
 		 269 aa  87.4  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1069  hydrolase  26.37 
 
 		 269 aa  87.4  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1064  hydrolase  25.64 
 
 		 269 aa  87  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1325  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.37 
 
 		 269 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1174  HAD superfamily hydrolase  26.37 
 
 		 269 aa  87.4  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.37 
 
 		 269 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1422  phosphotransferase  28.36 
 
 		 273 aa  87.4  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0719  Cof-like hydrolase  25.71 
 
 		 268 aa  86.7  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0900  Cof-like hydrolase  25.84 
 
 		 270 aa  86.7  4e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.183998  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3960  putative sugar phosphatase  30.08 
 
 		 266 aa  86.7  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0460666  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1298  HAD superfamily hydrolase  26.35 
 
 		 286 aa  86.7  4e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000863241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3699  Cof-like hydrolase  31.42 
 
 		 265 aa  86.7  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2934  phosphotransferase  28 
 
 		 273 aa  86.7  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0175  HAD family hydrolase  32.75 
 
 		 282 aa  86.3  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646059  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3056  Cof-like hydrolase  26.77 
 
 		 268 aa  86.3  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4150  putative sugar phosphatase  30.29 
 
 		 266 aa  85.5  8e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000304841  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  27.78 
 
 		 267 aa  85.9  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002120  hydrolase (HAD superfamily)  26.3 
 
 		 274 aa  85.5  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  28.89 
 
 		 272 aa  85.5  9e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1545  Cof-like hydrolase  28.67 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1220  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.01 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0949  Cof-like hydrolase  25.38 
 
 		 258 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000135628  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0870  HAD superfamily hydrolase  26.52 
 
 		 281 aa  85.1  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000525914  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0561  HAD superfamily hydrolase  23.47 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0197  putative sugar phosphatase  29.41 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.226044  normal  0.0522792 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2847  phosphotransferase  28 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  25.65 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  22.78 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0646  HAD superfamily hydrolase  24.91 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1400  HAD superfamily hydrolase  27.84 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000750549  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2434  Cof protein  31.88 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0324  Cof-like hydrolase  24.64 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000119179  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0726  HAD superfamily hydrolase  27.57 
 
 		 274 aa  82  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2079  HAD superfamily hydrolase  23.77 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00139142  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3945  Cof-like hydrolase  26.8 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.411023 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3056  phosphotransferase  26.12 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64186  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01730  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.21 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  25.46 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  25.83 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>