More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1007 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1007  ribosome recycling factor  100 
 
 		 185 aa  367  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1183  ribosome recycling factor  82.16 
 
 		 185 aa  311  2.9999999999999996e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23580  ribosome recycling factor  73.51 
 
 		 185 aa  282  2.0000000000000002e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.275445 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11220  ribosome recycling factor  72.22 
 
 		 186 aa  278  2e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0977787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1418  ribosome recycling factor  72.97 
 
 		 185 aa  277  5e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.441102 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2504  ribosome recycling factor  74.05 
 
 		 185 aa  271  3e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.470707 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1387  ribosome recycling factor  69.73 
 
 		 185 aa  268  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000002033 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1487  ribosome recycling factor  72.97 
 
 		 185 aa  266  2e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.632003 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0997  ribosome recycling factor  67.57 
 
 		 185 aa  261  4.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.168842  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1233  ribosome recycling factor  68.65 
 
 		 185 aa  260  8e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.408531  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1325  ribosome recycling factor  67.57 
 
 		 185 aa  259  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1370  ribosome recycling factor  66.49 
 
 		 185 aa  258  4e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.102814  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0679  ribosome recycling factor  66.49 
 
 		 185 aa  255  3e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.445733  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1866  ribosome recycling factor  63.78 
 
 		 185 aa  251  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2201  ribosome recycling factor  63.78 
 
 		 185 aa  250  8.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09920  ribosome recycling factor  65.41 
 
 		 185 aa  250  8.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  64.32 
 
 		 185 aa  249  2e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1532  ribosome recycling factor  62.7 
 
 		 185 aa  248  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0437112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1164  ribosome recycling factor  63.78 
 
 		 185 aa  246  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.221517 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10150  ribosome recycling factor  65.95 
 
 		 188 aa  245  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.775897  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3579  ribosome recycling factor  63.78 
 
 		 185 aa  245  3e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5908  ribosome recycling factor  62.16 
 
 		 185 aa  244  4e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.107758  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3240  ribosome recycling factor  62.16 
 
 		 185 aa  241  6e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3110  ribosome recycling factor  59.46 
 
 		 185 aa  233  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000193761  hitchhiker  0.00426294 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06770  ribosome recycling factor  60 
 
 		 185 aa  233  1.0000000000000001e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000531316  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2004  ribosome recycling factor  60.54 
 
 		 185 aa  231  6e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1985  ribosome recycling factor  60.54 
 
 		 185 aa  231  6e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2050  ribosome recycling factor  60.54 
 
 		 185 aa  231  6e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.774761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2221  ribosome recycling factor  60 
 
 		 185 aa  230  9e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0750591  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3988  ribosome recycling factor  58.92 
 
 		 185 aa  229  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12896  ribosome recycling factor  60.54 
 
 		 185 aa  229  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.460587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0806  ribosome recycling factor  58.01 
 
 		 184 aa  229  2e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4123  ribosome recycling factor  58.38 
 
 		 185 aa  229  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2111  ribosome recycling factor  60.54 
 
 		 185 aa  228  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1674  ribosome recycling factor  56.22 
 
 		 185 aa  228  3e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3407  ribosome recycling factor  63.78 
 
 		 185 aa  224  7e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0276302  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0241  ribosome recycling factor  57.3 
 
 		 185 aa  222  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0407  ribosome recycling factor  56.18 
 
 		 183 aa  217  7.999999999999999e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00332415  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 186 aa  201  7e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  52.43 
 
 		 185 aa  198  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 186 aa  191  6e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0629  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 187 aa  190  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.418172 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 184 aa  190  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 186 aa  189  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  48.59 
 
 		 184 aa  189  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0065  ribosome recycling factor  48.33 
 
 		 182 aa  188  2.9999999999999997e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  48.63 
 
 		 184 aa  187  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  187  8e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  48.09 
 
 		 186 aa  187  9e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1401  ribosome recycling factor  51.08 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100309  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  50 
 
 		 184 aa  185  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  48.59 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1319  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 184 aa  185  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362878  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1345  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 184 aa  185  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00867514  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  184  7e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  184  7e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0445  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00199228  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  50.29 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  47.73 
 
 		 183 aa  182  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1448  ribosome recycling factor  46.7 
 
 		 186 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0629  ribosome recycling factor  48.42 
 
 		 190 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.701086  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 184 aa  182  3e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5326  ribosome recycling factor  46.59 
 
 		 186 aa  182  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105729  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1685  ribosome recycling factor  46.89 
 
 		 186 aa  182  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.188884 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2030  ribosome recycling factor  47.16 
 
 		 186 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0510  ribosome recycling factor  46.15 
 
 		 186 aa  181  5.0000000000000004e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0317856  normal  0.376064 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0986  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 185 aa  181  5.0000000000000004e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00114143  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2452  ribosome recycling factor  46.33 
 
 		 186 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26871  hitchhiker  0.00149746 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3258  ribosome recycling factor  46.02 
 
 		 186 aa  181  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.797404  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2490  ribosome recycling factor  46.02 
 
 		 186 aa  181  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1552  ribosome recycling factor  46.02 
 
 		 186 aa  181  6e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2580  ribosome recycling factor  46.02 
 
 		 186 aa  181  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  51.15 
 
 		 174 aa  181  6e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1325  ribosome recycling factor  46.02 
 
 		 186 aa  181  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0289556  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2434  ribosome recycling factor  46.02 
 
 		 186 aa  181  6e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0313731  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2053  ribosome recycling factor  46.02 
 
 		 186 aa  181  6e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  46.41 
 
 		 184 aa  181  7e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1494  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  181  7e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  45.36 
 
 		 184 aa  180  9.000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10920  ribosome recycling factor  45.9 
 
 		 186 aa  180  1e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0728725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  45.76 
 
 		 186 aa  179  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>