85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3743 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3743  hypothetical protein  100 
 
 
98 aa  206  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3229  hypothetical protein  40 
 
 
95 aa  71.6  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6641  protein of unknown function DUF1330  32.29 
 
 
95 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2285  hypothetical protein  33.68 
 
 
96 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0613201  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2076  hypothetical protein  35.79 
 
 
95 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3403  hypothetical protein  32.65 
 
 
106 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2552  hypothetical protein  36.78 
 
 
98 aa  63.5  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.349195 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5237  hypothetical protein  32.65 
 
 
133 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1325  hypothetical protein  31.58 
 
 
96 aa  61.2  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1054  hypothetical protein  30.53 
 
 
96 aa  61.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3454  hypothetical protein  31.63 
 
 
106 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.516869  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4644  protein of unknown function DUF1330  30.61 
 
 
106 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0263146  normal  0.598238 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4067  hypothetical protein  31.63 
 
 
106 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2715  hypothetical protein  31.63 
 
 
106 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0913  protein of unknown function DUF1330  34.44 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5163  hypothetical protein  32.65 
 
 
106 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.934572 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4723  hypothetical protein  33.33 
 
 
102 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3183  hypothetical protein  30 
 
 
96 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.614337  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3445  protein of unknown function DUF1330  30.53 
 
 
96 aa  57.4  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0724  hypothetical protein  38.75 
 
 
129 aa  57  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1090  hypothetical protein  27.37 
 
 
97 aa  57  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1504  hypothetical protein  33.67 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5107  hypothetical protein  31.11 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.496431 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6612  hypothetical protein  30.21 
 
 
104 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1844  hypothetical protein  32.98 
 
 
101 aa  55.1  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2337  protein of unknown function DUF1330  34.38 
 
 
100 aa  55.1  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4055  hypothetical protein  34.52 
 
 
112 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5042  hypothetical protein  32.14 
 
 
88 aa  53.9  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.662041  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3978  glucose inhibited division protein  30.53 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.174401 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0345  hypothetical protein  30.68 
 
 
96 aa  52  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0272597  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0971  protein of unknown function DUF1330  30.53 
 
 
96 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127294  normal  0.0142522 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1067  protein of unknown function DUF1330  30.53 
 
 
96 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108805  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2309  hypothetical protein  33.33 
 
 
99 aa  51.6  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0785  hypothetical protein  29.47 
 
 
95 aa  51.2  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560924  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0105  hypothetical protein  33.67 
 
 
110 aa  51.2  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.771179 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4211  protein of unknown function DUF1330  36.73 
 
 
95 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0668  protein of unknown function DUF1330  34.34 
 
 
95 aa  50.8  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0495537  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4047  hypothetical protein  33.72 
 
 
108 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4630  protein of unknown function DUF1330  32.65 
 
 
109 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0176  protein of unknown function DUF1330  31.71 
 
 
112 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5218  hypothetical protein  32.63 
 
 
94 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2093  hypothetical protein  29.47 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302469  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1194  hypothetical protein  30.77 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707621  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0092  protein of unknown function DUF1330  27.37 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1957  hypothetical protein  30.53 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0569002  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2045  hypothetical protein  29.89 
 
 
95 aa  48.9  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0164673  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2129  hypothetical protein  29.89 
 
 
95 aa  48.9  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140278  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2403  hypothetical protein  31.25 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.79558  normal  0.741886 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1042  hypothetical protein  29.17 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.797208  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1452  hypothetical protein  32.29 
 
 
96 aa  47.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1336  hypothetical protein  31.58 
 
 
96 aa  47.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000449884 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1655  protein of unknown function DUF1330  27.37 
 
 
96 aa  47.8  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2191  protein of unknown function DUF1330  28.72 
 
 
110 aa  47.4  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1128  hypothetical protein  28.42 
 
 
96 aa  47.8  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2669  hypothetical protein  31.25 
 
 
96 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0199077  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0722  protein of unknown function DUF1330  31.03 
 
 
102 aa  47.4  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0008  hypothetical protein  27.59 
 
 
94 aa  47  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00922624  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3118  protein of unknown function DUF1330  30.12 
 
 
157 aa  47  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6409  protein of unknown function DUF1330  27.78 
 
 
97 aa  47  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0458  hypothetical protein  30.59 
 
 
105 aa  46.6  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.42868  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4583  hypothetical protein  32 
 
 
115 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.165656 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0310  hypothetical protein  28.24 
 
 
97 aa  45.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.105649  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5022  protein of unknown function DUF1330  27.96 
 
 
112 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0320092  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1673  hypothetical protein  34.15 
 
 
92 aa  45.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5793  hypothetical protein  29.47 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0684  hypothetical protein  26.44 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6158  hypothetical protein  29.47 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3354  hypothetical protein  31.94 
 
 
73 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.10898  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0196  hypothetical protein  28.74 
 
 
100 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6638  hypothetical protein  29.47 
 
 
95 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3445  hypothetical protein  29.47 
 
 
110 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3703  hypothetical protein  27.78 
 
 
96 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.12428 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4587  protein of unknown function DUF1330  28.74 
 
 
95 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1901  hypothetical protein  28.42 
 
 
106 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00121592  normal  0.870164 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3539  hypothetical protein  29.89 
 
 
95 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3239  hypothetical protein  29.47 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371902  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7348  hypothetical protein  29.47 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310793  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1110  hypothetical protein  32.18 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1498  hypothetical protein  36.59 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.123314  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1359  hypothetical protein  29.89 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102563  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0939  hypothetical protein  29.41 
 
 
91 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1937  hypothetical protein  27.59 
 
 
97 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0325431 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0334  hypothetical protein  26.74 
 
 
100 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.255499  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4324  protein of unknown function DUF1330  26.44 
 
 
95 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03931  hypothetical protein  35.37 
 
 
113 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.719494  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>