More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0335 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0335  hypothetical protein  100 
 
 
289 aa  554  1e-157  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.414942 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2796  hypothetical protein  62.85 
 
 
293 aa  331  9e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3287  protein of unknown function DUF6 transmembrane  63.64 
 
 
288 aa  329  4e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504842  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1390  DMT family permease  62.15 
 
 
293 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.526899  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0056  hypothetical protein  62.15 
 
 
293 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0122515  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2802  hypothetical protein  61.94 
 
 
305 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.930073 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  52.76 
 
 
306 aa  282  6.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  38.83 
 
 
309 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  33.82 
 
 
312 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.58 
 
 
294 aa  112  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  29.45 
 
 
312 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  31.43 
 
 
304 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.48 
 
 
312 aa  102  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0878  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.62 
 
 
306 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.754226  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1240  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.05 
 
 
290 aa  99.8  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.69 
 
 
317 aa  90.5  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1011  hypothetical protein  30.55 
 
 
298 aa  87.8  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0158427  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1789  hypothetical protein  26.36 
 
 
301 aa  84  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223486  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4196  hypothetical protein  29.03 
 
 
293 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1777  EamA family protein  25.97 
 
 
301 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00180942  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3424  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.36 
 
 
301 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000803671 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1756  drug/metabolite exporter family protein  25.97 
 
 
301 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1951  transporter, EamA family  25.97 
 
 
301 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000452263 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1915  eama family protein  25.97 
 
 
301 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191779  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1734  drug/metabolite exporter family protein  25.97 
 
 
301 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000184981  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2020  transporter, EamA family  25.4 
 
 
283 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000240822  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1919  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.97 
 
 
301 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1999  EamA family protein  25.97 
 
 
301 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.099067  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.17 
 
 
312 aa  80.1  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4574  hypothetical protein  29.43 
 
 
296 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252933  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  30.11 
 
 
303 aa  78.2  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1785  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.77 
 
 
294 aa  78.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5624  hypothetical protein  28.47 
 
 
296 aa  77.4  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353351  normal  0.158728 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.11 
 
 
313 aa  76.6  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.04 
 
 
289 aa  76.3  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  28.67 
 
 
335 aa  76.6  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2505  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.29 
 
 
307 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.017863  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2229  hypothetical protein  30.29 
 
 
307 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.547025 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.21 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.32 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1183  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.91 
 
 
309 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1406  hypothetical protein  32.17 
 
 
324 aa  74.7  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.520748  normal  0.479385 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  27.85 
 
 
311 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06857  hypothetical protein  23.71 
 
 
305 aa  73.6  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  25.19 
 
 
316 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4483  hypothetical protein  29.43 
 
 
305 aa  73.6  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  25.27 
 
 
296 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  25.27 
 
 
296 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3202  integral membrane protein  25.27 
 
 
296 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  25.27 
 
 
296 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2920  hypothetical protein  26.81 
 
 
338 aa  72.8  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0643  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 
290 aa  72.4  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  25.19 
 
 
395 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3163  integral membrane protein  25.27 
 
 
296 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.08673  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0367  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.86 
 
 
293 aa  72  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4510  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 
296 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444897  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  27.31 
 
 
318 aa  71.6  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  25.09 
 
 
299 aa  70.1  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  27.17 
 
 
294 aa  70.1  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2766  hypothetical protein  24.45 
 
 
289 aa  70.1  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.393161  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  23.13 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2549  EamA family protein  23.59 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2736  eama family protein  23.59 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1615  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.04 
 
 
291 aa  69.7  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2311  hypothetical protein  27.06 
 
 
303 aa  69.7  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000443541  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2544  transporter, EamA family  23.24 
 
 
305 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000168841 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.82 
 
 
313 aa  69.3  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  25.59 
 
 
300 aa  69.3  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.03 
 
 
348 aa  69.3  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0726  hypothetical protein  24.73 
 
 
298 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2748  transporter, EamA family  22.92 
 
 
305 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0709  hypothetical protein  24.73 
 
 
298 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1729  hypothetical protein  23.73 
 
 
301 aa  68.9  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.520137  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.14 
 
 
324 aa  68.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0346  hypothetical protein  28.33 
 
 
302 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  27.53 
 
 
311 aa  68.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.76 
 
 
304 aa  68.9  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1406  hypothetical protein  24.81 
 
 
414 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104528  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2926  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.78 
 
 
305 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2410  hypothetical protein  24.3 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2744  transporter, EamA family  23.24 
 
 
305 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55496e-17 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1607  hypothetical protein  29.17 
 
 
307 aa  67  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00020661  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1468  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.92 
 
 
303 aa  67  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0799  hypothetical protein  25.58 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2825  hypothetical protein  26.13 
 
 
301 aa  67  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0965979  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4348  hypothetical protein  32.67 
 
 
302 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.663003  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  28.57 
 
 
296 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3922  hypothetical protein  26.34 
 
 
296 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1003  hypothetical protein  26.35 
 
 
285 aa  66.2  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  25.27 
 
 
324 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0346  hypothetical protein  25.58 
 
 
296 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548669  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0830  hypothetical protein  25.58 
 
 
296 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100508  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  26.98 
 
 
298 aa  65.5  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  26.45 
 
 
300 aa  65.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1940  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.37 
 
 
305 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0530229  hitchhiker  0.00250027 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2505  drug/metabolite exporter family protein  22.61 
 
 
305 aa  65.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000162037  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  23.34 
 
 
303 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10380  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  24.11 
 
 
316 aa  64.3  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142725  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4132  hypothetical protein  26.01 
 
 
289 aa  64.7  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.507718  hitchhiker  0.00000080806 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  28.19 
 
 
310 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>