68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2785 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2785  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
335 aa  670    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.81235  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0167  FAD dependent oxidoreductase  44.05 
 
 
336 aa  263  4e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.205435  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2190  FAD dependent oxidoreductase  41.93 
 
 
344 aa  239  4e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1925  hypothetical protein  37.93 
 
 
347 aa  220  3e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.315657  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1426  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  36.5 
 
 
362 aa  210  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2015  hypothetical protein  35.65 
 
 
347 aa  201  9.999999999999999e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.509344 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0435  FAD dependent oxidoreductase  29.19 
 
 
347 aa  135  9e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164811  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4204  FAD dependent oxidoreductase  28.06 
 
 
346 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.429398 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0027  FAD dependent oxidoreductase  28.71 
 
 
344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1481  FAD dependent oxidoreductase  27.62 
 
 
341 aa  89.7  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1126  amine oxidase, flavin-containing protein  27.94 
 
 
328 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  27.52 
 
 
843 aa  85.1  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1075  FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 
328 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.817137 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  27.22 
 
 
351 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0533  putative transmembrane protein  28.36 
 
 
343 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5306  hypothetical protein  27.95 
 
 
327 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61600  hypothetical protein  27.95 
 
 
327 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0728796 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  24.85 
 
 
346 aa  79.7  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 
358 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4447  hypothetical protein  28.17 
 
 
328 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4732  FAD dependent oxidoreductase  28.45 
 
 
328 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.528339 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0965  amine oxidase, flavin-containing  27.94 
 
 
328 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  27.33 
 
 
383 aa  76.6  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4982  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 
368 aa  75.5  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2285  FAD dependent oxidoreductase  26.19 
 
 
314 aa  73.9  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4414  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  29.24 
 
 
381 aa  73.6  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288059  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0886  putative transmembrane protein  27.25 
 
 
329 aa  72.4  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1229  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  26.75 
 
 
324 aa  72  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0596771  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1783  FAD dependent oxidoreductase  26.57 
 
 
367 aa  70.5  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  28.19 
 
 
332 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  25.69 
 
 
359 aa  68.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3125  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 
360 aa  68.9  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  27.22 
 
 
330 aa  67  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1983  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 
367 aa  66.6  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460512  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  27.6 
 
 
355 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 
354 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0783  FAD dependent oxidoreductase  25.7 
 
 
328 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0999  hypothetical protein  27.84 
 
 
320 aa  62.8  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.277798  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0770  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  25.39 
 
 
328 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780127  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0742  hypothetical protein  25.39 
 
 
328 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.64643  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4691  FAD dependent oxidoreductase  21.89 
 
 
323 aa  59.7  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0114981 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4048  FAD dependent oxidoreductase  26.36 
 
 
407 aa  58.9  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0468618 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41390  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 
329 aa  57  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.196664  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2992  protoporphyrinogen oxidase  31.51 
 
 
460 aa  56.2  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1475  protoporphyrinogen oxidase  28.23 
 
 
469 aa  55.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  hitchhiker  0.000274844 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0825  hypothetical protein  28.95 
 
 
316 aa  54.7  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1406  protoporphyrinogen oxidase  33.1 
 
 
459 aa  55.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.217442 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0160  hypothetical protein  28.28 
 
 
319 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443199  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1655  FAD dependent oxidoreductase  23.79 
 
 
333 aa  53.1  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5174  protoporphyrinogen oxidase  25.6 
 
 
470 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00221395  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1735  hypothetical protein  28.45 
 
 
313 aa  50.4  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0266  amine oxidase  27.12 
 
 
361 aa  49.7  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000119304  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0049  FAD dependent oxidoreductase  24.92 
 
 
313 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1335  protoporphyrinogen oxidase  25.98 
 
 
471 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073104  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3031  FAD dependent oxidoreductase  25.65 
 
 
369 aa  47.4  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1533  protoporphyrinogen oxidase  26.29 
 
 
469 aa  47  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  23.18 
 
 
361 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0073  amine oxidase  40.22 
 
 
474 aa  46.6  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1750  hypothetical protein  41.54 
 
 
313 aa  46.2  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1151  FAD dependent oxidoreductase  28.38 
 
 
338 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  38.81 
 
 
469 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  45.76 
 
 
456 aa  44.3  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4659  protoporphyrinogen oxidase  26.47 
 
 
476 aa  43.9  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000642175  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2373  phytoene desaturase  50.98 
 
 
519 aa  43.5  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145608  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2262  protoporphyrinogen oxidase  36.89 
 
 
482 aa  43.1  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183756  normal  0.0939663 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  23.19 
 
 
344 aa  43.1  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  40.74 
 
 
488 aa  43.1  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5972  amine oxidase  27.43 
 
 
349 aa  42.7  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.824241  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>