56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2374 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2374  prenyltransferase  100 
 
 		 293 aa  573  1.0000000000000001e-162  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0270715  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1361  UbiA prenyltransferase  64.87 
 
 		 296 aa  347  1e-94  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.321745 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2703  UbiA prenyltransferase  63.23 
 
 		 290 aa  326  3e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1002  UbiA prenyltransferase  59.52 
 
 		 340 aa  303  2.0000000000000002e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1898  prenyltransferase  59.72 
 
 		 299 aa  288  1e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.622194 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2047  UbiA prenyltransferase  42.81 
 
 		 287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0118  prenyltransferase  41.15 
 
 		 284 aa  163  3e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2205  prenyltransferase  39.21 
 
 		 283 aa  118  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04400  prenyltransferase  35.52 
 
 		 294 aa  105  6e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3488  prenyltransferase  35.69 
 
 		 300 aa  103  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.327283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0337  prenyltransferase  34.23 
 
 		 286 aa  100  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0802172 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13800  prenyltransferase  33.45 
 
 		 294 aa  100  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0993725  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2888  UbiA prenyltransferase  37.38 
 
 		 289 aa  97.4  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0837805 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21210  prenyltransferase  38.89 
 
 		 294 aa  86.3  6e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12800  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  35.96 
 
 		 318 aa  85.9  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0848  prenyltransferase  32.65 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0221544  normal  0.0909902 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3714  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  34.21 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.213938  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3881  tocopherol phytyltransferase  26.24 
 
 		 349 aa  57  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.630797  decreased coverage  0.00732369 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3462  UbiA prenyltransferase  27.27 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3472  tocopherol phytyltransferase  28.57 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00788485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2360  bacteriochlorophyll c synthase  26.12 
 
 		 333 aa  54.3  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.663632  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0726  tocopherol phytyltransferase  28.08 
 
 		 314 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00119936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2172  bacteriochlorophyll c synthase  26.12 
 
 		 333 aa  53.9  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0002  tocopherol phytyltransferase  24.15 
 
 		 299 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5287  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.06 
 
 		 295 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0627  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  33.33 
 
 		 303 aa  51.6  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.916979  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4820  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.06 
 
 		 295 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0428449 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0468  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.17 
 
 		 286 aa  50.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3396  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.21 
 
 		 286 aa  49.3  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.442555  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0012  tocopherol phytyltransferase  27.49 
 
 		 318 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6422  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.06 
 
 		 300 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0010  tocopherol phytyltransferase  27.49 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2061  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.37 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172201 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0160  prenyltransferase  26.11 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.579339  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5365  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.49 
 
 		 274 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0827781  normal  0.24577 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1600  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.42 
 
 		 305 aa  46.6  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0596  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.6 
 
 		 295 aa  46.2  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0368  bacteriochlorophyll c synthase  25.33 
 
 		 335 aa  45.8  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.259035  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3747  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.83 
 
 		 297 aa  45.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138219 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0179  prenyltransferase  25.51 
 
 		 294 aa  45.8  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1719  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  33.77 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.641378  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32069  predicted protein  30.95 
 
 		 319 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0209  bacteriochlorophyll c synthase  27.11 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0386  tocopherol phytyltransferase  27.65 
 
 		 300 aa  44.3  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000735368  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0156  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.38 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.594676 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2249  UbiA prenyltransferase  25.69 
 
 		 345 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6135  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.95 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3992  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  34.42 
 
 		 306 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70730  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.8 
 
 		 296 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0200  prenyltransferase  25.77 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4497  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  26.05 
 
 		 286 aa  43.1  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0633254  normal  0.801833 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5476  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  27.11 
 
 		 296 aa  43.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5365  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  25.9 
 
 		 296 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.346697 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_87025  Para-hydroxybenzoate--polyprenyltransferase, mitochondrial precursor (PHB:polyprenyltransferase)  28.9 
 
 		 285 aa  42.4  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2362  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  29.46 
 
 		 328 aa  42.4  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.620404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2330  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  27.23 
 
 		 295 aa  42.4  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.417297 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>