43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3520 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3520  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  648    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1230  hypothetical protein  65.19 
 
 
337 aa  400  9.999999999999999e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000527304 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1980  hypothetical protein  40.77 
 
 
341 aa  215  9e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.335213  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1298  hypothetical protein  41.9 
 
 
342 aa  205  9e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1101  hypothetical protein  35.05 
 
 
347 aa  134  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0490804  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2537  hypothetical protein  29.24 
 
 
341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2298  hypothetical protein  27.83 
 
 
344 aa  96.7  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1692  hypothetical protein  24.77 
 
 
385 aa  72.4  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4446  hypothetical protein  28.07 
 
 
330 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000651496  hitchhiker  0.0000161544 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1018  hypothetical protein  21.47 
 
 
338 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0053  hypothetical protein  26.21 
 
 
340 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1008  hypothetical protein  27.87 
 
 
330 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00036444  hitchhiker  0.0000000000115467 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1368  hypothetical protein  26.16 
 
 
330 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4355  hypothetical protein  26.16 
 
 
330 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00100984  normal  0.0179088 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4434  hypothetical protein  28.52 
 
 
332 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0770  hypothetical protein  24.08 
 
 
340 aa  54.3  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2505  hypothetical protein  40 
 
 
862 aa  53.5  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.937281  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1148  hypothetical protein  24.49 
 
 
340 aa  53.1  0.000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0706  hypothetical protein  34.83 
 
 
811 aa  52.8  0.000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.778922 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  22.13 
 
 
340 aa  52.4  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36260  hypothetical protein  51.79 
 
 
872 aa  51.2  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1977  hypothetical protein  39.36 
 
 
853 aa  51.6  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1560  hypothetical protein  44.74 
 
 
792 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.596723  normal  0.0176466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8950  integral membrane protein-like protein  41.67 
 
 
793 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2430  hypothetical protein  51.92 
 
 
843 aa  50.4  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000163867  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0580  hypothetical protein  28.75 
 
 
329 aa  48.9  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.236014  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56050  hypothetical protein  25.84 
 
 
333 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3430  hypothetical protein  39.51 
 
 
783 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.011046  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0828  hypothetical protein  32.41 
 
 
339 aa  47.4  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175071  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0597  hypothetical protein  30.3 
 
 
392 aa  46.6  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.729747  hitchhiker  0.00000000000000683959 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3323  hypothetical protein  44.23 
 
 
801 aa  46.6  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.991041  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4881  hypothetical protein  26.59 
 
 
333 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1732  hypothetical protein  29 
 
 
281 aa  46.6  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157937  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1805  hypothetical protein  24.88 
 
 
332 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17180  conserved hypothetical protein TIGR00374  22.55 
 
 
342 aa  44.3  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5628  integral membrane protein-like protein  38.04 
 
 
442 aa  44.3  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.110231  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3265  hypothetical protein  39.51 
 
 
859 aa  43.9  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2300  hypothetical protein  27.57 
 
 
322 aa  43.9  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0170913  hitchhiker  0.00842153 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4018  membrane protein  28.88 
 
 
333 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.581162 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4123  hypothetical protein  28.45 
 
 
333 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.574237  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0389  integral membrane protein  23.69 
 
 
345 aa  43.1  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4243  hypothetical protein  29.02 
 
 
290 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3500  hypothetical protein  30.08 
 
 
346 aa  42.7  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>