More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3088 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  100 
 
 		 374 aa  733    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  60.54 
 
 		 367 aa  433  1e-120  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  57.68 
 
 		 372 aa  412  1e-114  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2304  aminotransferase class V  60.54 
 
 		 379 aa  384  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00866664  normal  0.420378 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  30.29 
 
 		 376 aa  172  5.999999999999999e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  33.84 
 
 		 394 aa  171  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0185  aminotransferase, class V  32.72 
 
 		 392 aa  170  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.91 
 
 		 412 aa  170  3e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  31.38 
 
 		 395 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0805  aminotransferase class V  30.85 
 
 		 395 aa  166  8e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  30.03 
 
 		 404 aa  165  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  30.89 
 
 		 368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  31.55 
 
 		 392 aa  158  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2765  aminotransferase class V  33.78 
 
 		 379 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  31.88 
 
 		 415 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  31.55 
 
 		 394 aa  155  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  29.23 
 
 		 393 aa  154  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  30.61 
 
 		 401 aa  155  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2309  aminotransferase, class V  42.09 
 
 		 287 aa  153  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.422271  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.33 
 
 		 425 aa  151  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  32.54 
 
 		 379 aa  151  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  29.82 
 
 		 387 aa  149  7e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5082  aminotransferase class V  35.42 
 
 		 402 aa  148  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000086974  normal  0.0923906 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.55 
 
 		 421 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  32.73 
 
 		 378 aa  146  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  29.35 
 
 		 406 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  29.35 
 
 		 406 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.35 
 
 		 406 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.79 
 
 		 413 aa  144  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  29.35 
 
 		 406 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  33.33 
 
 		 878 aa  144  3e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.79 
 
 		 413 aa  144  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.3 
 
 		 406 aa  143  6e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  29.38 
 
 		 406 aa  142  9e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  29.38 
 
 		 406 aa  142  9e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  29.38 
 
 		 406 aa  142  9e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.89 
 
 		 428 aa  142  9e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  29.1 
 
 		 406 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.98 
 
 		 433 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  29.38 
 
 		 406 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  29.1 
 
 		 406 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  31.33 
 
 		 434 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1586  putative L-cysteine/cystine lyase  28.35 
 
 		 400 aa  140  3.9999999999999997e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.61 
 
 		 412 aa  140  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.14 
 
 		 406 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.83 
 
 		 414 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4777  aminotransferase, class V  31.94 
 
 		 391 aa  140  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  31.67 
 
 		 414 aa  139  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.15 
 
 		 406 aa  139  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0604  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.2 
 
 		 409 aa  139  7e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.542169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.98 
 
 		 414 aa  139  7e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  29.85 
 
 		 393 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1840  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.79 
 
 		 414 aa  139  8.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00877809  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.71 
 
 		 415 aa  139  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0410  putative L-cysteine/cystine lyase  26.51 
 
 		 391 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.33409  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  30.36 
 
 		 880 aa  138  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.71 
 
 		 885 aa  138  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  30 
 
 		 404 aa  138  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0791  putative L-cysteine/cystine lyase  29.29 
 
 		 388 aa  137  3.0000000000000003e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51384  normal  0.0724988 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  31.47 
 
 		 429 aa  137  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  30.77 
 
 		 387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  32.06 
 
 		 393 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.49 
 
 		 409 aa  137  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11492  cysteine desulfurase csd  32.09 
 
 		 417 aa  136  5e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0542664  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  31.49 
 
 		 896 aa  136  5e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.32 
 
 		 414 aa  136  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.94 
 
 		 417 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  26.98 
 
 		 381 aa  135  8e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.77 
 
 		 435 aa  135  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  28.46 
 
 		 413 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.17 
 
 		 414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0431  putative selenocysteine lyase  32.12 
 
 		 406 aa  133  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00781  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  29.73 
 
 		 419 aa  133  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.674845 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2088  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.12 
 
 		 406 aa  132  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04651  putative L-cysteine/cystine lyase  25.65 
 
 		 391 aa  132  9e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.283231  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  30.27 
 
 		 404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5397  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.6 
 
 		 414 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1293  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.35 
 
 		 441 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000571182 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2736  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.7 
 
 		 415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04761  putative L-cysteine/cystine lyase  26.11 
 
 		 391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.59 
 
 		 644 aa  131  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04341  putative L-cysteine/cystine lyase  25.13 
 
 		 390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.12464  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.67 
 
 		 408 aa  131  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1584  aminotransferase class V  32.8 
 
 		 363 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.504943 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2091  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.1 
 
 		 419 aa  130  4.0000000000000003e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000201738 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.33 
 
 		 415 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5290  aminotransferase class V  36.16 
 
 		 380 aa  130  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00731204  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  30.15 
 
 		 380 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  28.8 
 
 		 393 aa  130  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1745  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  32.94 
 
 		 406 aa  129  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000031207  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.09 
 
 		 415 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  30.27 
 
 		 430 aa  129  8.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04651  putative L-cysteine/cystine lyase  26.88 
 
 		 400 aa  129  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  32.15 
 
 		 424 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1748  putative L-cysteine/cystine lyase  27.07 
 
 		 400 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.701457  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  32.53 
 
 		 381 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.95 
 
 		 678 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.22 
 
 		 406 aa  128  1.0000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.23 
 
 		 418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.93 
 
 		 410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>