More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2962 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0933  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  89.03 
 
 
556 aa  1026    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0218972  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1123  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  72.34 
 
 
582 aa  810    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1471  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  70.27 
 
 
585 aa  826    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.390324  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2962  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  100 
 
 
556 aa  1133    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2516  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  70.99 
 
 
572 aa  828    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.191896 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3299  FAD dependent oxidoreductase  44.88 
 
 
559 aa  416  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2844  FAD dependent oxidoreductase  43.85 
 
 
533 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676215  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4111  FAD dependent oxidoreductase  45.14 
 
 
556 aa  392  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0402229 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1021  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  41.5 
 
 
552 aa  391  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2622  FAD dependent oxidoreductase  40.89 
 
 
514 aa  386  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0001851  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0071  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  42.96 
 
 
556 aa  382  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1521  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  42.1 
 
 
535 aa  378  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0946096  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0686  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  41.7 
 
 
547 aa  372  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0227  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  41.51 
 
 
551 aa  375  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0200  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  42.99 
 
 
547 aa  369  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.207234  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3991  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  41.51 
 
 
551 aa  372  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.172557  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0397  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  41.51 
 
 
560 aa  372  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0200  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  41.91 
 
 
547 aa  361  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0341607 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2572  FAD dependent oxidoreductase  48.06 
 
 
407 aa  360  3e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.22049 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4148  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  41.23 
 
 
556 aa  360  3e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00376439  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0248  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  42.66 
 
 
552 aa  358  9.999999999999999e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0402203  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3957  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  41.23 
 
 
556 aa  358  9.999999999999999e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2805  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  41.02 
 
 
542 aa  357  2.9999999999999997e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.701913 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2393  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  41.02 
 
 
542 aa  354  2e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2512  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  41.25 
 
 
542 aa  352  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2524  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  41.25 
 
 
542 aa  352  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1410  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  41.02 
 
 
542 aa  352  1e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.656406 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02167  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase (anaerobic), large subunit, FAD/NAD(P)-binding  41.02 
 
 
542 aa  351  2e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1418  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  41.02 
 
 
542 aa  351  2e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.556923  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2623  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  41.02 
 
 
542 aa  351  2e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2382  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  41.02 
 
 
542 aa  351  2e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2469  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  41.25 
 
 
542 aa  351  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.357992 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2539  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  41.02 
 
 
542 aa  351  2e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2628  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  41.25 
 
 
542 aa  351  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.710716  normal  0.455755 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3378  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  41.02 
 
 
542 aa  351  2e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2420  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  41.25 
 
 
542 aa  351  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02126  hypothetical protein  41.02 
 
 
542 aa  351  2e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0512  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  38.72 
 
 
562 aa  347  4e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000682192  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3499  FAD dependent oxidoreductase  38.1 
 
 
522 aa  335  1e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.426927 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1438  FAD dependent oxidoreductase  39.67 
 
 
539 aa  335  1e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.198287  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2102  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  40.07 
 
 
512 aa  324  2e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.150536 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1228  FAD dependent oxidoreductase  37.38 
 
 
516 aa  318  1e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.677137  normal  0.683893 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3076  FAD dependent oxidoreductase  47.7 
 
 
408 aa  318  2e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5204  FAD dependent oxidoreductase  47.28 
 
 
424 aa  316  6e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0332  FAD dependent oxidoreductase  37.26 
 
 
445 aa  295  1e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0583  FAD dependent oxidoreductase  41.38 
 
 
389 aa  278  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.6721  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1177  FAD dependent oxidoreductase  38.78 
 
 
435 aa  263  8e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.624502 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1127  FAD dependent oxidoreductase  39.52 
 
 
384 aa  259  1e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.46832  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0880  FAD dependent oxidoreductase  36.56 
 
 
486 aa  256  1.0000000000000001e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1126  FAD dependent oxidoreductase  39.95 
 
 
392 aa  249  7e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1799  FAD dependent oxidoreductase  35.03 
 
 
432 aa  225  2e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000000252779  normal  0.373628 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1336  FAD dependent oxidoreductase  33.03 
 
 
545 aa  220  5e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2532  FAD dependent oxidoreductase  32.51 
 
 
545 aa  203  8e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.941625  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1419  FAD dependent oxidoreductase  32.51 
 
 
545 aa  199  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1317  FAD dependent oxidoreductase  32.13 
 
 
545 aa  196  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0471  FAD dependent oxidoreductase  31.79 
 
 
547 aa  154  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  33.26 
 
 
556 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  31.11 
 
 
539 aa  145  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  31.15 
 
 
543 aa  134  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  28.01 
 
 
496 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  29.92 
 
 
562 aa  130  8.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2018  FAD dependent oxidoreductase  27 
 
 
581 aa  129  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.523268 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  32 
 
 
537 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2156  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.52 
 
 
517 aa  126  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2412  FAD dependent oxidoreductase  30.49 
 
 
552 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3955  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  27.96 
 
 
495 aa  124  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.36 
 
 
591 aa  122  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  29.87 
 
 
548 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1198  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.1 
 
 
551 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  28.22 
 
 
542 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  27.41 
 
 
574 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  30.25 
 
 
537 aa  121  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1021  FAD dependent oxidoreductase  26.82 
 
 
500 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3397  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.3 
 
 
557 aa  120  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505029  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  29.28 
 
 
582 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3269  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.46 
 
 
500 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0079  FAD dependent oxidoreductase  27.61 
 
 
545 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656011  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1277  FAD dependent oxidoreductase  30.07 
 
 
579 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0865  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  27.62 
 
 
502 aa  118  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1250  FAD dependent oxidoreductase  29.84 
 
 
579 aa  118  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1267  FAD dependent oxidoreductase  29.84 
 
 
579 aa  118  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1836  putative glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.64 
 
 
529 aa  117  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.399827  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 
578 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 
546 aa  117  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  28.85 
 
 
559 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4339  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.74 
 
 
508 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.50517  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0812  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  27.34 
 
 
502 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3320  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29 
 
 
509 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435615  normal  0.419558 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2774  FAD dependent oxidoreductase  30.82 
 
 
519 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.483661  normal  0.986908 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  27.79 
 
 
530 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2327  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.1 
 
 
516 aa  115  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  28.75 
 
 
576 aa  115  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2574  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.35 
 
 
495 aa  115  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13331  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD2  29.44 
 
 
585 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.819547  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.1 
 
 
514 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0185895 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  30.96 
 
 
543 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0620  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.68 
 
 
507 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  26.74 
 
 
543 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  26.61 
 
 
525 aa  114  5e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5410  FAD dependent oxidoreductase  31.43 
 
 
529 aa  114  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>