More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0009 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0009  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 257 aa  525  1e-148  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.247011  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.9 
 
 		 260 aa  218  6e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.278227  normal  0.338656 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0765  hypothetical protein  38.21 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0747  hypothetical protein  38.21 
 
 		 253 aa  165  6.9999999999999995e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46579  predicted protein  33.92 
 
 		 308 aa  151  8.999999999999999e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3341  short chain dehydrogenase  35.02 
 
 		 249 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3306  short chain dehydrogenase  35.02 
 
 		 249 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3602  short chain dehydrogenase  35.02 
 
 		 249 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0750697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3555  short chain dehydrogenase  35.02 
 
 		 249 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000931047 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2223  short chain dehydrogenase  34.3 
 
 		 249 aa  125  5e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.637126  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3256  short chain dehydrogenase  34.32 
 
 		 249 aa  123  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3565  short chain dehydrogenase  34.6 
 
 		 249 aa  121  9e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.578221  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1662  short chain dehydrogenase  34.18 
 
 		 249 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.637972  hitchhiker  0.000000702398 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3561  short chain dehydrogenase  34.18 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3655  short chain dehydrogenase  34.18 
 
 		 249 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4245  short chain dehydrogenase  36.48 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3250  short chain dehydrogenase  33.9 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0558976  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5440  short chain dehydrogenase  35.96 
 
 		 254 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0792659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3230  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 		 254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.272744 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4890  short chain dehydrogenase  36.44 
 
 		 254 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0080  short chain dehydrogenase  36.4 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0219  short chain dehydrogenase  35.34 
 
 		 246 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1931  short chain dehydrogenase  35.93 
 
 		 246 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1673  short chain dehydrogenase  35.93 
 
 		 246 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2209  short chain dehydrogenase  35.93 
 
 		 246 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0309  short chain dehydrogenase  35.93 
 
 		 246 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0946  short chain dehydrogenase  35.93 
 
 		 253 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1234  short chain dehydrogenase  35.93 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.446635  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0120  hypothetical protein  31.91 
 
 		 265 aa  106  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  28.45 
 
 		 705 aa  106  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 		 251 aa  102  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 		 258 aa  102  8e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61312  predicted protein  32.43 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.243713  normal  0.492851 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3005  short chain dehydrogenase  35.75 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.702214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3544  short chain dehydrogenase  37.17 
 
 		 246 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16365  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01740  cytoplasm protein, putative  28.86 
 
 		 261 aa  99  6e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.672483  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 		 243 aa  98.6  8e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000379715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0225  short chain dehydrogenase  38.93 
 
 		 311 aa  97.8  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4617  short chain dehydrogenase  34.93 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.891469  hitchhiker  0.00163121 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6980  short chain dehydrogenase  36.49 
 
 		 252 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5248  short chain dehydrogenase  35.37 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 		 235 aa  97.4  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5611  short chain dehydrogenase  35.37 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.637794  normal  0.281069 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.54 
 
 		 260 aa  96.7  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.125802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2989  short-chain alcohol dehydrogenase/reductase  32.87 
 
 		 243 aa  95.9  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2637  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.73 
 
 		 249 aa  95.5  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.08 
 
 		 253 aa  95.9  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1071  short chain dehydrogenase  32.05 
 
 		 272 aa  95.5  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12720  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  34.72 
 
 		 262 aa  95.5  8e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1735  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 		 260 aa  95.1  9e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.355166  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0422  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.89 
 
 		 259 aa  94.7  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1035  short chain dehydrogenase  33.76 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 		 258 aa  94.7  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2637  short chain dehydrogenase  31.62 
 
 		 249 aa  94  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.880192  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1440  short chain dehydrogenase  26.42 
 
 		 250 aa  93.2  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.16 
 
 		 261 aa  93.2  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0587036  normal  0.882414 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.29 
 
 		 254 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.29 
 
 		 254 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0959  short chain dehydrogenase  33.04 
 
 		 246 aa  92  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0597094 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.38 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.03 
 
 		 240 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008135 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.45 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.317025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3040  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.17 
 
 		 247 aa  90.5  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0850209 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4205  short chain dehydrogenase  35.45 
 
 		 249 aa  90.1  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3860  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.76 
 
 		 249 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.840744  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.74 
 
 		 258 aa  89.7  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0532431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.02 
 
 		 253 aa  89.7  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  0.414505 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0489  sorbitol dehydrogenase  34.18 
 
 		 260 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000937678  hitchhiker  0.00159634 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0692  sorbitol dehydrogenase  34.01 
 
 		 258 aa  89.7  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.76 
 
 		 251 aa  89.7  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000130997  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.85 
 
 		 244 aa  89.7  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123251 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.14 
 
 		 230 aa  89.7  5e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.49 
 
 		 249 aa  89.4  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.863639  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.61 
 
 		 266 aa  89  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6803  hypothetical protein  30.49 
 
 		 259 aa  89  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 		 248 aa  88.6  9e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9206  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  27.49 
 
 		 246 aa  88.6  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341088  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1276  short chain dehydrogenase  35.38 
 
 		 245 aa  88.6  9e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.127244 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.45 
 
 		 244 aa  88.2  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.46 
 
 		 252 aa  88.2  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.84 
 
 		 250 aa  88.2  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2039  short chain dehydrogenase  27.95 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0111409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1907  short chain dehydrogenase  31.62 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000106494 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0330  sorbitol dehydrogenase  33.5 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.264194  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1611  short chain dehydrogenase  31.62 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000230658 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.4 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0628  sorbitol dehydrogenase  33.5 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2462  sorbitol dehydrogenase  33.5 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0076  sorbitol dehydrogenase  33.5 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1429  short chain dehydrogenase  31.62 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.281885  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2549  short chain dehydrogenase  26.98 
 
 		 272 aa  87.8  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2499  short chain dehydrogenase  26.98 
 
 		 272 aa  87.8  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.496805  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.78 
 
 		 231 aa  87.4  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.459049  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.78 
 
 		 231 aa  87.4  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1844  short chain dehydrogenase  31.62 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000457135 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3151  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.79 
 
 		 270 aa  87.4  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1849  short chain dehydrogenase  31.62 
 
 		 253 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714478  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1753  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.53 
 
 		 248 aa  87  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>