More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3782 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3782  aminotransferase class V  100 
 
 
384 aa  784    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5365  aminotransferase class V  34.57 
 
 
379 aa  218  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262525  normal  0.71759 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2945  aminotransferase, class V  36.91 
 
 
381 aa  204  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119234  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4777  aminotransferase, class V  33.6 
 
 
391 aa  199  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  33.6 
 
 
387 aa  170  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0484  aminotransferase class V  32.08 
 
 
384 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  29.95 
 
 
378 aa  162  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  31.27 
 
 
411 aa  159  7e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2765  aminotransferase class V  30.42 
 
 
379 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  33.16 
 
 
381 aa  152  8.999999999999999e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0295  aminotransferase, class V  29.86 
 
 
373 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000286273 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  29.97 
 
 
377 aa  147  5e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  29.03 
 
 
376 aa  145  9e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3724  aminotransferase, class V  29.51 
 
 
374 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00735712 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  33.33 
 
 
377 aa  143  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  26.4 
 
 
376 aa  142  7e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0309  aminotransferase class V  27.68 
 
 
373 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0295  aminotransferase, class V  29.23 
 
 
374 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00361608 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0300  aminotransferase class V  27.68 
 
 
373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0304  aminotransferase class V  27.38 
 
 
373 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0305  aminotransferase class V  27.68 
 
 
373 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15030  cysteine desulfurase protein  31.82 
 
 
377 aa  140  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  27.91 
 
 
379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  31.04 
 
 
377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1720  hypothetical protein  30.36 
 
 
401 aa  133  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0138813  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4413  kynureninase  28.85 
 
 
378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3417  kynureninase  27.67 
 
 
371 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.746937 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2100  kynureninase  30.61 
 
 
422 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3556  aminotransferase, class V  26.92 
 
 
370 aa  127  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3452  aminotransferase, class V  27.16 
 
 
381 aa  127  5e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.237823  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3922  aminotransferase class V  25.14 
 
 
371 aa  126  7e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0407  aminotransferase, class V  26.19 
 
 
373 aa  126  7e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482772  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25790  hypothetical protein  31.32 
 
 
377 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.226944 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2203  hypothetical protein  30.56 
 
 
377 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  27.81 
 
 
368 aa  121  1.9999999999999998e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4022  aminotransferase class V  28.29 
 
 
372 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1353  kynureninase  31.01 
 
 
423 aa  119  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.529156 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0805  aminotransferase class V  25.71 
 
 
395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  25.71 
 
 
395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  29.07 
 
 
372 aa  117  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  26.49 
 
 
401 aa  116  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2025  aminotransferase class V  30.52 
 
 
418 aa  116  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3208  kynureninase  29.87 
 
 
416 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  28.5 
 
 
387 aa  115  8.999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  27.25 
 
 
415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2118  kynureninase  29.27 
 
 
409 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.489178 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  26.05 
 
 
392 aa  114  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  29.84 
 
 
367 aa  114  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  26.28 
 
 
404 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3511  kynureninase  27.18 
 
 
427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  26.49 
 
 
393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0411  aminotransferase, class V  26.93 
 
 
357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0822  kynureninase  30.88 
 
 
416 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.632925  hitchhiker  0.00000920194 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2523  kynureninase  25.61 
 
 
428 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000799329  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2761  kynureninase  25.34 
 
 
428 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000186702 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2766  kynureninase  26.76 
 
 
428 aa  110  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.368535  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37610  kynureninase  29.66 
 
 
416 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.88589  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  26.18 
 
 
401 aa  109  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2526  kynureninase  25.34 
 
 
428 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239961 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5082  aminotransferase class V  31.6 
 
 
402 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000086974  normal  0.0923906 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1389  kynureninase  27.13 
 
 
413 aa  108  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0130616  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  26.04 
 
 
430 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2394  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  28.64 
 
 
406 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0201879  hitchhiker  0.000057861 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1542  kynureninase  31.3 
 
 
423 aa  107  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0917927  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2488  kynureninase  25.07 
 
 
428 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.819206  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5290  aminotransferase class V  32.24 
 
 
380 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00731204  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  28.1 
 
 
414 aa  107  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0185  aminotransferase, class V  26.56 
 
 
392 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.119153 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.64 
 
 
406 aa  107  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  30.42 
 
 
374 aa  107  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  27.18 
 
 
412 aa  106  7e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  28.64 
 
 
406 aa  106  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  27.99 
 
 
394 aa  105  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.34 
 
 
413 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3789  aminotransferase, class V  30.04 
 
 
456 aa  105  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2567  kynureninase  24.8 
 
 
428 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1896  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  28.4 
 
 
406 aa  104  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554851  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2753  kynureninase  24.8 
 
 
428 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.385452  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  27.3 
 
 
393 aa  105  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.8 
 
 
427 aa  104  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2559  kynureninase  24.62 
 
 
428 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0488118  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  25.74 
 
 
408 aa  104  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  31.38 
 
 
394 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1534  kynureninase  27.99 
 
 
393 aa  104  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.213107  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1881  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  28.36 
 
 
406 aa  103  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000647321  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2304  aminotransferase class V  30.24 
 
 
379 aa  103  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00866664  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2808  kynureninase  25.27 
 
 
428 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.212385  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.14 
 
 
409 aa  103  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1471  kynureninase  27.81 
 
 
409 aa  103  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0396616  normal  0.0356277 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1951  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  28.36 
 
 
406 aa  103  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00128399  unclonable  0.0000000107568 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  29.93 
 
 
419 aa  103  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  27.03 
 
 
420 aa  103  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2787  kynureninase  25 
 
 
428 aa  102  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00906384  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01649  selenocysteine lyase  28.36 
 
 
406 aa  102  9e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000238093  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1761  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  28.36 
 
 
406 aa  102  9e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00014755  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01639  hypothetical protein  28.36 
 
 
406 aa  102  9e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000164024  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1250  aminotransferase class V  28.46 
 
 
372 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.04 
 
 
662 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6950  kynureninase  27.61 
 
 
403 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  24.08 
 
 
425 aa  101  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>