85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0295 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0295  protein of unknown function YGGT  100 
 
 
78 aa  150  8e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315255  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4037  hypothetical protein  50.75 
 
 
87 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000926366  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3912  ylmG protein  50.75 
 
 
87 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000638636 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3950  ylmG protein  50.75 
 
 
87 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361919  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3657  hypothetical protein  50.75 
 
 
87 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.516535  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3640  hypothetical protein  50.75 
 
 
87 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138235  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3749  ylmG protein  50.75 
 
 
87 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0442014  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1242  ylmG protein  45.83 
 
 
87 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000199997  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3943  ylmG protein  49.25 
 
 
87 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00794391  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3999  ylmG protein  52.46 
 
 
87 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3725  protein of unknown function YGGT  51.72 
 
 
87 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00556578  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0477  hypothetical protein  40.98 
 
 
99 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0755  ylmG protein  35.14 
 
 
96 aa  54.3  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.298424  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2547  protein of unknown function YGGT  44.26 
 
 
87 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167983  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0493  protein of unknown function YGGT  37.88 
 
 
92 aa  53.5  0.0000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.197871  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36034  predicted protein  40 
 
 
237 aa  52.4  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.119025  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1199  cell division membrane protein  31.88 
 
 
98 aa  51.2  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1906  protein of unknown function YGGT  44.26 
 
 
90 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1036  protein of unknown function YGGT  40 
 
 
89 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000119033  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3109  hypothetical protein  37.5 
 
 
92 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264306  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3527  hypothetical protein  40.79 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3520  protein of unknown function YGGT  36.9 
 
 
104 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2189  protein of unknown function YGGT  37.88 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.318304  normal  0.111036 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0508  protein of unknown function YGGT  39.47 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.842199  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0994  hypothetical protein  42.11 
 
 
92 aa  48.1  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0252519  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  34.25 
 
 
85 aa  47.4  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  35.14 
 
 
104 aa  47  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0014  hypothetical protein  28.57 
 
 
98 aa  47  0.00008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  32.89 
 
 
105 aa  47  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15401  hypothetical protein  34.29 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0261  YGGT family protein  35.06 
 
 
92 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.634053  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0438  protein of unknown function YGGT  35.06 
 
 
92 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0595  protein of unknown function YGGT  27.54 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102021  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0714  protein of unknown function YGGT  34.78 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.674624  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0057  protein of unknown function YGGT  38.16 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0297  hypothetical protein  39.13 
 
 
100 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.475908  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1085  protein of unknown function YGGT  31.58 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000150484  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3329  protein of unknown function YGGT  33.77 
 
 
98 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0271  hypothetical protein  38.16 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09691  hypothetical protein  39.13 
 
 
100 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0755134  normal  0.205345 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  32.89 
 
 
105 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1027  protein of unknown function YGGT  37.97 
 
 
98 aa  44.7  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1093  protein of unknown function YGGT  37.97 
 
 
98 aa  44.7  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.869762  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3030  protein of unknown function YGGT  38.18 
 
 
95 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09491  hypothetical protein  32.86 
 
 
92 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.291422  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1411  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 
84 aa  43.9  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000759704  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  33.77 
 
 
199 aa  43.9  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09420  YGGT family protein  30.3 
 
 
86 aa  43.9  0.0008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0374287  normal  0.111305 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0607  protein of unknown function YGGT  38.16 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1481  protein of unknown function YGGT  31.48 
 
 
94 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1490  cell division membrane protein  37.68 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0989  protein of unknown function YGGT  31.71 
 
 
114 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2188  integral membrane protein  35.48 
 
 
193 aa  42.7  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.199645  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2214  hypothetical protein  35.48 
 
 
192 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107485  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1433  hypothetical protein  32.35 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.116879 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0478  hypothetical protein  38.16 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09511  hypothetical protein  31.43 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.545335  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09931  hypothetical protein  31.43 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0890  hypothetical protein  31.43 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2684  protein of unknown function YGGT  46.81 
 
 
184 aa  41.6  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000426882  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0415  protein of unknown function YGGT  35.62 
 
 
107 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000337721  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0861  hypothetical protein  37.66 
 
 
88 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00343102  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3629  protein of unknown function YGGT  34.33 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0517  hypothetical protein  36.36 
 
 
97 aa  41.2  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0567252  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3708  protein of unknown function YGGT  38.18 
 
 
94 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0028  protein of unknown function YGGT  38.3 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.242413  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1118  hypothetical protein  37.66 
 
 
92 aa  40.8  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.448589 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1360  hypothetical protein  38.3 
 
 
101 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2437  protein of unknown function YGGT  33.96 
 
 
189 aa  40.8  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2724  protein of unknown function YGGT  34.21 
 
 
109 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0018  protein of unknown function YGGT  38.3 
 
 
95 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292831  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0615  hypothetical protein  34.21 
 
 
93 aa  40.4  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.8017800000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1492  protein of unknown function YGGT  34.21 
 
 
109 aa  40.8  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290091  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3938  protein of unknown function YGGT  35.82 
 
 
95 aa  40.8  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1274  hypothetical protein  36.36 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000722021  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1237  protein of unknown function YGGT  34.25 
 
 
89 aa  40.4  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.371486  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4497  protein of unknown function YGGT  34.55 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1249  hypothetical protein  36.36 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000234986  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4433  protein of unknown function YGGT  34.55 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3054  protein of unknown function YGGT  35.14 
 
 
99 aa  40.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.649035  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4335  protein of unknown function YGGT  30.77 
 
 
97 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.680603  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0758  protein of unknown function YGGT  38.71 
 
 
184 aa  40  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  36.76 
 
 
196 aa  40  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3706  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 
103 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.535312  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2479  protein of unknown function YGGT  40.43 
 
 
182 aa  40  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.619107  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>