37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1118 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1118  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  176  8e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.448589 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0138  hemolysin-like protein  50 
 
 		 96 aa  77  0.00000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0119341  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5090  hypothetical protein  40 
 
 		 84 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  hitchhiker  0.000638915 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1577  hypothetical protein  44.29 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123124  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2920  protein of unknown function YGGT  37.8 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00113152  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1026  hypothetical protein  39.71 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.249686  decreased coverage  0.00177157 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1080  protein of unknown function YGGT  42.68 
 
 		 98 aa  64.7  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1290  protein of unknown function YGGT  42.86 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.735211  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3056  hypothetical protein  34.15 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0864971  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1578  protein of unknown function YGGT  43.28 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.103365 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3255  protein of unknown function YGGT  40.3 
 
 		 99 aa  62  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.676354  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2877  hypothetical protein  37.8 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336227  normal  0.961037 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0904  protein of unknown function YGGT  36.14 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00960363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1413  hypothetical protein  39.73 
 
 		 95 aa  60.5  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0918909 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2639  protein of unknown function YGGT  35.8 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.225894  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22740  YGGT family protein  34.48 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.584515  normal  0.0326478 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3192  hypothetical protein  37.88 
 
 		 101 aa  58.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6100  protein of unknown function YGGT  35.94 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0776287 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16500  YGGT family protein  34.78 
 
 		 95 aa  57  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.14322  normal  0.0963368 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2404  protein of unknown function YGGT  32.94 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.492904 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1117  hypothetical protein  38.36 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.12614  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1422  hypothetical protein  35.48 
 
 		 88 aa  50.4  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00134439  normal  0.136409 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5756  protein of unknown function YGGT  36.51 
 
 		 94 aa  50.8  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1601  protein of unknown function YGGT  35.48 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.201823  normal  0.632427 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27330  YGGT family protein  31.08 
 
 		 94 aa  47.8  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10870  YGGT family protein  37.74 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0110241  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4005  hypothetical protein  26.32 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3010  protein of unknown function YGGT  30.88 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13530  possible membrane protein  32.81 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.688244  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12176  transmembrane protein  30.56 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.691227 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3516  hypothetical protein  29.17 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393311  normal  0.0621678 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2995  hypothetical protein  32 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.133667 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3433  hypothetical protein  37.21 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.500015  hitchhiker  0.00553581 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3207  hypothetical protein  37.21 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.40439 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3260  hypothetical protein  27.78 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0615606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3311  hypothetical protein  27.78 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0475182 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3249  hypothetical protein  27.78 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>