More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3503 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  100 
 
 
294 aa  607  1e-172  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  52.8 
 
 
288 aa  292  4e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  37.62 
 
 
308 aa  212  6e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2167  transcriptional regulator, AraC family  40.65 
 
 
283 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273156  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  37.23 
 
 
289 aa  197  1e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0019  transcriptional regulator, AraC family  38 
 
 
314 aa  197  1e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1956  transcriptional regulator, AraC family  40.43 
 
 
283 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0993473  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3099  AraC family transcriptional regulator  34.27 
 
 
326 aa  174  2e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3161  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
277 aa  172  7e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0946  transcriptional regulator, AraC family  35.94 
 
 
286 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.584518  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0140  AraC family transcriptional regulator  35.76 
 
 
293 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.877598  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1217  transcription activator, effector binding  37.63 
 
 
288 aa  166  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0126  AraC family transcriptional regulator  37.16 
 
 
293 aa  164  1e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436666  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2703  transcription activator, effector binding  32.2 
 
 
326 aa  165  1e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.268178 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2929  AraC family transcriptional regulator  37.16 
 
 
293 aa  164  1e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3425  transcription activator, effector binding  36.97 
 
 
288 aa  164  2e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1474  transcriptional regulator, AraC family  35.74 
 
 
286 aa  163  4e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3431  transcription activator, effector binding  36.62 
 
 
288 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3306  AraC family transcriptional regulator  35.09 
 
 
292 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3356  transcription activator, effector binding  36.27 
 
 
288 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3526  transcription activator, effector binding  35.31 
 
 
288 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7295  AraC family transcriptional regulator  33.1 
 
 
277 aa  149  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158014  normal  0.567517 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3953  AraC family transcriptional regulator  32.62 
 
 
287 aa  148  8e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0509927  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0853  transcriptional regulator, AraC family  32.29 
 
 
284 aa  147  3e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1224  AraC family transcriptional regulator  33.22 
 
 
288 aa  146  5e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0494811  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4046  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 
289 aa  145  8e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  32.65 
 
 
296 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3069  transcriptional regulator, AraC family  31.27 
 
 
296 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3053  transcriptional regulator, AraC family  32.2 
 
 
296 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3088  AraC family transcriptional regulator  31.86 
 
 
296 aa  142  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530109  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2843  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 
296 aa  142  9e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3057  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 
296 aa  142  9e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118978  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4381  transcription activator effector binding  30.93 
 
 
286 aa  141  1e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2193  transcriptional regulator, AraC family  31.19 
 
 
296 aa  140  2e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  4.12725e-06 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2158  AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 
294 aa  139  5e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2816  AraC family transcriptional regulator  30.58 
 
 
296 aa  138  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03191  transcription regulator protein  33.33 
 
 
310 aa  138  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3627  DNA gyrase inhibitor  30.03 
 
 
300 aa  137  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  2.40584e-07  hitchhiker  0.00747313 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0371  AraC family transcriptional regulator  32.19 
 
 
288 aa  137  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2836  AraC family transcriptional regulator  32.09 
 
 
296 aa  137  3e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00254989  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000611  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  31.97 
 
 
289 aa  135  9e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0208776  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001047  transcriptional regulator AraC family  28.77 
 
 
299 aa  134  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0077  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  32.71 
 
 
289 aa  133  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2173  AraC family transcriptional regulator  31.72 
 
 
289 aa  133  4e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.671765  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2776  AraC family transcriptional regulator  29.9 
 
 
296 aa  133  4e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06471  hypothetical protein  31.71 
 
 
289 aa  131  1e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1641  transcription activator effector binding protein  30.14 
 
 
287 aa  131  1e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1774  AraC family transcriptional regulator  32.06 
 
 
289 aa  130  2e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.524324  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3564  AraC family transcriptional regulator  31.36 
 
 
279 aa  130  2e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236142  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3013  transcription activator, effector binding  30.3 
 
 
289 aa  127  2e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0028  transcriptional regulator, AraC family  33.07 
 
 
279 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0132  transcription regulator protein  36.48 
 
 
265 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0034  transcriptional regulator, AraC family  33.98 
 
 
279 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.255751 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5359  transcriptional regulator, AraC family  34.88 
 
 
297 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.6789  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1398  AraC family transcriptional regulator  34.41 
 
 
296 aa  123  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.584508  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0076  transcription activator, effector binding  31.27 
 
 
288 aa  121  2e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  29.14 
 
 
300 aa  121  2e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  29.14 
 
 
300 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  29.14 
 
 
300 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  29.1 
 
 
300 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  29.77 
 
 
300 aa  119  5e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  29.14 
 
 
300 aa  119  5e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  29.8 
 
 
300 aa  118  1e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  29.43 
 
 
300 aa  117  2e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  29.1 
 
 
300 aa  117  2e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1354  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 
293 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.558119  normal  0.215319 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  28.52 
 
 
300 aa  115  8e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3715  transcriptional regulator, AraC family  29.96 
 
 
279 aa  111  1e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.424878 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1576  transcriptional regulator, AraC family  31.49 
 
 
436 aa  109  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12290  Transcriptional regulator, AraC family  29.05 
 
 
325 aa  109  7e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04745  transcriptional regulator  34.8 
 
 
255 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3417  transcriptional regulator, AraC family  29.86 
 
 
279 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.27768  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5265  transcriptional regulator, AraC family  29.63 
 
 
281 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1644  transcriptional regulator, AraC family  32.62 
 
 
293 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0930139  normal  0.386203 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4053  AraC family transcriptional regulator  30.36 
 
 
277 aa  106  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3983  transcriptional regulator, AraC family  25.17 
 
 
291 aa  105  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1952  AraC family transcriptional regulator  32.5 
 
 
271 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598764  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2938  AraC family transcriptional regulator  32.86 
 
 
279 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487848  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0223  transcriptional activator, AraC family  28.76 
 
 
281 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.78737e-05 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0990  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 
281 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2798  transcription activator effector binding  35.06 
 
 
156 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4566  transcriptional regulator, AraC family  30.72 
 
 
293 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7157  transcriptional regulator, AraC family  29.75 
 
 
277 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0205  transcriptional activator, AraC family  29.29 
 
 
281 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  5.24418e-10 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06300  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  28.52 
 
 
302 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0261  AraC family transcriptional regulator  28.77 
 
 
281 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2209  transcription activator, effector binding  34.42 
 
 
156 aa  99.4  6e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.796256 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0621  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 
291 aa  98.6  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6275  AraC family transcriptional regulator  27.96 
 
 
279 aa  92.8  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2116  transcriptional regulator, AraC family  27.34 
 
 
287 aa  92.4  7e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0910  HTH-type transcription regulator, AraC-family  25.26 
 
 
298 aa  92  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.576456  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3564  transcriptional regulator, AraC family  27.59 
 
 
285 aa  91.7  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003322  hypothetical protein  25.57 
 
 
310 aa  91.3  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.757084  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4446  putative DNA gyrase inhibitor  32.53 
 
 
160 aa  90.5  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.823142  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3846  transcriptional regulator, AraC family  26.39 
 
 
287 aa  89.4  7e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0216  transcriptional regulator, AraC family  41.18 
 
 
299 aa  89  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0192  AraC family transcriptional regulator  39.22 
 
 
299 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0179  AraC family transcriptional regulator  39.22 
 
 
299 aa  88.2  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0147136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0211  transcriptional regulator, AraC family  39.22 
 
 
299 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0191  AraC family transcriptional regulator  39.22 
 
 
299 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>