89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3344 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3344  hypothetical protein  100 
 
 		 464 aa  956    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3141  hypothetical protein  71.34 
 
 		 460 aa  704    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2474  hypothetical protein  56.47 
 
 		 447 aa  538  9.999999999999999e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3551  hypothetical protein  59.89 
 
 		 371 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2993  hypothetical protein  50.82 
 
 		 368 aa  389  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1661  hypothetical protein  35.92 
 
 		 384 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0600  hypothetical protein  35.92 
 
 		 392 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2313  GfdT protein  35.92 
 
 		 392 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1924  hypothetical protein  35.92 
 
 		 392 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1717  hypothetical protein  35.92 
 
 		 392 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2230  hypothetical protein  35.92 
 
 		 392 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0710  hypothetical protein  35.92 
 
 		 384 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.251408  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0732  hypothetical protein  35.39 
 
 		 386 aa  203  6e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6102  domain of unknown function DUF1745  31.27 
 
 		 386 aa  174  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2724  domain of unknown function DUF1745  32.96 
 
 		 374 aa  172  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.43445  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1883  hypothetical protein  31.3 
 
 		 382 aa  171  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1939  hypothetical protein  30.77 
 
 		 384 aa  168  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2479  hypothetical protein  33.87 
 
 		 379 aa  165  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.492023 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3140  hypothetical protein  29.35 
 
 		 387 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2538  hypothetical protein  29.97 
 
 		 382 aa  162  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1816  protein of unknown function DUF1745  30.77 
 
 		 389 aa  159  8e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.988519 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2171  hypothetical protein  28.53 
 
 		 387 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2663  hypothetical protein  28.53 
 
 		 387 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2339  domain of unknown function DUF1745  30.68 
 
 		 383 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4193  domain of unknown function DUF1745  31.76 
 
 		 386 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351241  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3320  hypothetical protein  30.59 
 
 		 387 aa  156  8e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0466  domain of unknown function DUF1745  29.63 
 
 		 385 aa  155  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3518  hypothetical protein  30.68 
 
 		 400 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.49503  normal  0.689004 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1925  hypothetical protein  30.23 
 
 		 398 aa  155  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.795435 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2247  hypothetical protein  30.52 
 
 		 382 aa  155  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00169518  normal  0.316904 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2201  domain of unknown function DUF1745  30.23 
 
 		 398 aa  155  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1872  hypothetical protein  28.96 
 
 		 381 aa  153  7e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38990  hypothetical protein  29.77 
 
 		 387 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.880326  normal  0.566256 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0700  hypothetical protein  30.65 
 
 		 380 aa  150  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155862  normal  0.0832434 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3953  hypothetical protein  30.81 
 
 		 389 aa  150  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3617  hypothetical protein  28.99 
 
 		 378 aa  149  8e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0308687  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2940  hypothetical protein  30.79 
 
 		 402 aa  146  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00513133 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4045  hypothetical protein  28.78 
 
 		 378 aa  143  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4519  domain of unknown function DUF1745  29.74 
 
 		 387 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317884  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3668  hypothetical protein  30 
 
 		 385 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432885  hitchhiker  0.00253652 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1139  hypothetical protein  26.79 
 
 		 392 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1527  hypothetical protein  29.28 
 
 		 390 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.039182 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1931  hypothetical protein  30.53 
 
 		 385 aa  126  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.429127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2881  hypothetical protein  28.99 
 
 		 390 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2675  hypothetical protein  28.49 
 
 		 399 aa  124  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0296571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1250  hypothetical protein  30.22 
 
 		 386 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.7579 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2592  hypothetical protein  30.22 
 
 		 386 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2353  hypothetical protein  27.2 
 
 		 393 aa  119  7.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.18015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0982  domain of unknown function DUF1745  29.1 
 
 		 666 aa  113  8.000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.505903  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0690  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 		 1186 aa  105  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2590  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.35 
 
 		 675 aa  105  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182127  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5004  chemotaxis sensory transducer  25.26 
 
 		 672 aa  92  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.71371 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2083  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.17 
 
 		 647 aa  90.9  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0223967  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2918  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.61 
 
 		 669 aa  90.1  8e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1269  hypothetical protein  24.22 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1909  domain of unknown function DUF1745  25.47 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1866  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.1 
 
 		 650 aa  71.6  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3657  domain of unknown function DUF1745  25.38 
 
 		 416 aa  70.9  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2665  domain of unknown function DUF1745  24.82 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2992  hypothetical protein  46.55 
 
 		 63 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.427001  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3552  hypothetical protein  50.82 
 
 		 67 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0690  hypothetical protein  25.64 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2153  hypothetical protein  25.69 
 
 		 400 aa  67  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3322  domain of unknown function DUF1745  25.27 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2151  hypothetical protein  23.26 
 
 		 383 aa  64.3  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1561  hypothetical protein  24.78 
 
 		 394 aa  62.8  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0408772  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2305  domain of unknown function DUF1745  22.28 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2079  domain of unknown function DUF1745  27.5 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00286991  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0824  hypothetical protein  22.66 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02305  hypothetical protein  25.56 
 
 		 395 aa  55.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2107  domain of unknown function DUF1745  27.97 
 
 		 401 aa  54.7  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2954  hypothetical protein  25.86 
 
 		 395 aa  54.7  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3184  hypothetical protein  25.62 
 
 		 377 aa  54.3  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0294  hypothetical protein  23.9 
 
 		 375 aa  53.9  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1899  hypothetical protein  23.43 
 
 		 395 aa  52.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.598311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1241  hypothetical protein  24.55 
 
 		 381 aa  52.4  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8558  hypothetical protein  24.36 
 
 		 398 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0012  hypothetical protein  24.32 
 
 		 379 aa  50.4  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0572769  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3884  domain of unknown function DUF1745  26.53 
 
 		 1852 aa  50.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3113  hypothetical protein  25 
 
 		 397 aa  50.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.680527  hitchhiker  0.0000208643 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2542  hypothetical protein  24.79 
 
 		 395 aa  49.7  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0354  hypothetical protein  31.21 
 
 		 387 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1054  hypothetical protein  21.66 
 
 		 405 aa  48.9  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0331  hypothetical protein  32.28 
 
 		 387 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0296  hypothetical protein  30.39 
 
 		 160 aa  47.8  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2864  domain of unknown function DUF1745  23.04 
 
 		 396 aa  47.4  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.965957  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4141  hypothetical protein  25.84 
 
 		 365 aa  45.8  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2052  domain of unknown function DUF1745  22.02 
 
 		 379 aa  44.3  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1203  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  23.64 
 
 		 932 aa  44.3  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00343755  normal  0.259486 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>