More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2858 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  68.85 
 
 		 639 aa  910    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  62.26 
 
 		 640 aa  784    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 636 aa  1300    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  70.11 
 
 		 643 aa  935    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  73.2 
 
 		 645 aa  954    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  66.28 
 
 		 642 aa  850    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  74.87 
 
 		 647 aa  974    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  48.22 
 
 		 619 aa  558  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  41.39 
 
 		 634 aa  489  1e-137  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  42.37 
 
 		 646 aa  483  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  41.58 
 
 		 609 aa  459  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3359  penicillin-binding protein 2  40.21 
 
 		 597 aa  445  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.20797  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  35.62 
 
 		 645 aa  429  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  36.96 
 
 		 636 aa  417  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  38.49 
 
 		 646 aa  418  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0473  peptidoglycan glycosyltransferase  38.36 
 
 		 681 aa  412  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  37.31 
 
 		 631 aa  412  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2219  penicillin-binding protein 2  38.22 
 
 		 600 aa  409  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  36.69 
 
 		 658 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2014  peptidoglycan glycosyltransferase  38.15 
 
 		 624 aa  407  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.327783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  35.8 
 
 		 630 aa  402  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  37.33 
 
 		 631 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  35.53 
 
 		 646 aa  402  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1465  peptidoglycan glycosyltransferase  37.97 
 
 		 691 aa  402  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  38.27 
 
 		 630 aa  401  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2823  penicillin-binding protein 2  35.69 
 
 		 755 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.774814 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  36.12 
 
 		 629 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  37.5 
 
 		 631 aa  399  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  38.17 
 
 		 646 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  36.41 
 
 		 630 aa  398  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.1 
 
 		 618 aa  398  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  37.1 
 
 		 673 aa  394  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  36.27 
 
 		 628 aa  395  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  38.24 
 
 		 646 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  35.57 
 
 		 629 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  35.63 
 
 		 629 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  37.62 
 
 		 648 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  37.62 
 
 		 648 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  36.16 
 
 		 626 aa  392  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  37.32 
 
 		 619 aa  390  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  35.63 
 
 		 629 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3336  penicillin-binding protein 2  35.59 
 
 		 661 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  37.33 
 
 		 633 aa  389  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3060  penicillin-binding protein 2  35.27 
 
 		 630 aa  389  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  37.02 
 
 		 648 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  36.78 
 
 		 681 aa  387  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3741  penicillin-binding protein 2  35.05 
 
 		 631 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2165  penicillin-binding protein 2  34.72 
 
 		 655 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  35.87 
 
 		 801 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  36.19 
 
 		 640 aa  385  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  35.57 
 
 		 630 aa  385  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  36.1 
 
 		 627 aa  384  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2022  peptidoglycan glycosyltransferase  35.05 
 
 		 667 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.238074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.77 
 
 		 671 aa  383  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  35 
 
 		 629 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1326  penicillin-binding protein 2  34.94 
 
 		 617 aa  381  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  36.42 
 
 		 703 aa  381  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  37.41 
 
 		 647 aa  379  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0470  peptidoglycan glycosyltransferase  37.29 
 
 		 648 aa  380  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  34.99 
 
 		 643 aa  382  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  34.95 
 
 		 640 aa  379  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  36.4 
 
 		 611 aa  376  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1329  penicillin-binding protein 2  34.6 
 
 		 617 aa  378  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  34.67 
 
 		 629 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1370  peptidoglycan glycosyltransferase  37.04 
 
 		 808 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0776138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0993  peptidoglycan glycosyltransferase  34.46 
 
 		 602 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223837  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0580  penicillin-binding protein 2  36.12 
 
 		 634 aa  373  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.39479  hitchhiker  0.00000000000028844 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1463  peptidoglycan glycosyltransferase  35.08 
 
 		 655 aa  374  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37559  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  36.13 
 
 		 574 aa  374  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08390  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.84 
 
 		 640 aa  373  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.630549  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  37.94 
 
 		 586 aa  372  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  35.91 
 
 		 610 aa  374  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3364  penicillin-binding protein 2  36.23 
 
 		 801 aa  371  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  36.36 
 
 		 803 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1454  penicillin-binding protein 2  35.8 
 
 		 684 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1607  peptidoglycan glycosyltransferase  36.18 
 
 		 650 aa  372  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.188503  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2498  peptidoglycan glycosyltransferase  35.96 
 
 		 682 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3687  penicillin-binding protein 2  36.39 
 
 		 801 aa  372  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.955324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  35.7 
 
 		 800 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  36.36 
 
 		 809 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  34.98 
 
 		 637 aa  372  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  35.91 
 
 		 632 aa  371  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0378  penicillin-binding protein 2  36.89 
 
 		 586 aa  370  1e-101  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  36.26 
 
 		 802 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  34.51 
 
 		 766 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  36.26 
 
 		 802 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  36.36 
 
 		 803 aa  369  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1008  peptidoglycan glycosyltransferase  34.02 
 
 		 640 aa  369  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3129  penicillin-binding protein 2  36.2 
 
 		 760 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4401  peptidoglycan glycosyltransferase  35.9 
 
 		 767 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2499  peptidoglycan glycosyltransferase  36.2 
 
 		 765 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1357  penicillin-binding protein 2  35.8 
 
 		 684 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.723027  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0495  peptidoglycan glycosyltransferase  35.91 
 
 		 662 aa  366  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0682861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  36.26 
 
 		 802 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3113  peptidoglycan glycosyltransferase  36.2 
 
 		 765 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.527872  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2187  peptidoglycan glycosyltransferase  36.56 
 
 		 595 aa  368  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  36.26 
 
 		 802 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2131  peptidoglycan glycosyltransferase  37.21 
 
 		 689 aa  365  1e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3168  peptidoglycan glycosyltransferase  36.2 
 
 		 764 aa  365  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00456215  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3051  penicillin-binding protein 2  36.2 
 
 		 756 aa  365  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0136763  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>