89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_5022 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_5022  protein of unknown function DUF1330  100 
 
 		 112 aa  221  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0320092  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4583  hypothetical protein  58.88 
 
 		 115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.165656 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1194  hypothetical protein  58.1 
 
 		 107 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2715  hypothetical protein  56.31 
 
 		 106 aa  121  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3403  hypothetical protein  54.37 
 
 		 106 aa  120  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4067  hypothetical protein  55.34 
 
 		 106 aa  120  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4644  protein of unknown function DUF1330  55.34 
 
 		 106 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0263146  normal  0.598238 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3454  hypothetical protein  54.37 
 
 		 106 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.516869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5237  hypothetical protein  53.4 
 
 		 133 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5163  hypothetical protein  53.4 
 
 		 106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.934572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4630  protein of unknown function DUF1330  54.08 
 
 		 109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0176  protein of unknown function DUF1330  43.88 
 
 		 112 aa  93.6  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3722  hypothetical protein  51.72 
 
 		 89 aa  92.8  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104061  normal  0.935166 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1901  hypothetical protein  48.54 
 
 		 106 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00121592  normal  0.870164 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3354  hypothetical protein  49.3 
 
 		 73 aa  70.9  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.10898  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0196  hypothetical protein  40.96 
 
 		 100 aa  63.5  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1707  hypothetical protein  45.36 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1042  hypothetical protein  44.87 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.797208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0334  hypothetical protein  37.5 
 
 		 100 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.255499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0722  protein of unknown function DUF1330  38.27 
 
 		 102 aa  57.4  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2669  hypothetical protein  38.14 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0199077  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2403  hypothetical protein  40 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.79558  normal  0.741886 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1957  hypothetical protein  40 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0569002  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1359  hypothetical protein  43.06 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102563  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2093  hypothetical protein  37.89 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3445  hypothetical protein  38.54 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0386  hypothetical protein  35.42 
 
 		 103 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3229  hypothetical protein  35.42 
 
 		 95 aa  52.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0434  hypothetical protein  38.75 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0341  protein of unknown function DUF1330  38.75 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00521106  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1076  hypothetical protein  40.51 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262747  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0092  protein of unknown function DUF1330  32.89 
 
 		 96 aa  52  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1325  hypothetical protein  35.79 
 
 		 96 aa  52  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1655  protein of unknown function DUF1330  32.89 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1336  hypothetical protein  39.47 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000449884 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6641  protein of unknown function DUF1330  36.84 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2076  hypothetical protein  34.38 
 
 		 95 aa  50.8  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2552  hypothetical protein  37.21 
 
 		 98 aa  50.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.349195 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3239  hypothetical protein  37.11 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2337  protein of unknown function DUF1330  39.24 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1859  hypothetical protein  35 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000278867  normal  0.769812 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2045  hypothetical protein  34.21 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0164673  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0345  hypothetical protein  38.67 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0272597  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0684  hypothetical protein  35.11 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2129  hypothetical protein  34.21 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140278  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1521  hypothetical protein  39.71 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.997326  normal  0.585973 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1800  protein of unknown function DUF1330  39.71 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472957  normal  0.250055 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3708  hypothetical protein  42.65 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.738458 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0939  hypothetical protein  39.71 
 
 		 91 aa  47.8  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2630  hypothetical protein  38.75 
 
 		 114 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.152361 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3703  hypothetical protein  36.47 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12428 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0727  hypothetical protein  32.94 
 
 		 98 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3183  hypothetical protein  34.38 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.614337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1519  protein of unknown function DUF1330  38.24 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.407227 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3445  protein of unknown function DUF1330  33.33 
 
 		 96 aa  47  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1754  hypothetical protein  37.5 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3539  hypothetical protein  34.21 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6432  hypothetical protein  36.84 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.386875 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1268  hypothetical protein  32.61 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253243  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3743  hypothetical protein  27.96 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6612  hypothetical protein  38.46 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4055  hypothetical protein  36.23 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0358  hypothetical protein  38.27 
 
 		 214 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0495198  normal  0.391408 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0823  hypothetical protein  44.44 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.636113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2807  protein of unknown function DUF1330  32.94 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2309  hypothetical protein  32.95 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7348  hypothetical protein  34.04 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1844  hypothetical protein  38.75 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0458  hypothetical protein  35 
 
 		 105 aa  44.3  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.42868  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4815  protein of unknown function DUF1330  35 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353052  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4211  protein of unknown function DUF1330  44.23 
 
 		 95 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1988  hypothetical protein  35.87 
 
 		 95 aa  42.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2285  hypothetical protein  29.87 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0613201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0008  hypothetical protein  33.33 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00922624  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1937  hypothetical protein  37.5 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0325431 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0785  hypothetical protein  32.89 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560924  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5107  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496431 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0358  hypothetical protein  39.39 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1641  hypothetical protein  31.87 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825876  hitchhiker  0.000000345307 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6158  hypothetical protein  34.67 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6638  hypothetical protein  34.67 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2191  protein of unknown function DUF1330  36.11 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5793  hypothetical protein  34.67 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4587  protein of unknown function DUF1330  34.21 
 
 		 95 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3241  protein of unknown function DUF1330  29.79 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0913  protein of unknown function DUF1330  33.77 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4324  protein of unknown function DUF1330  34.21 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5042  hypothetical protein  37.5 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.662041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6118  hypothetical protein  34.33 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133615  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>