108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3099 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3099  hypothetical protein  100 
 
 
335 aa  652    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058306  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1972  hypothetical protein  43.48 
 
 
349 aa  199  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.551311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4061  hypothetical protein  38.92 
 
 
367 aa  188  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0949  hypothetical protein  43.32 
 
 
346 aa  172  9e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.102443 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1651  hypothetical protein  38.6 
 
 
323 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5600  nitroreductase  36.9 
 
 
343 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581442  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0990  hypothetical protein  38.11 
 
 
342 aa  157  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1010  nitroreductase  37.95 
 
 
361 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.869828  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6194  hypothetical protein  37.57 
 
 
335 aa  152  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325627  normal  0.125602 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0762  hypothetical protein  39.45 
 
 
343 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0286  nitroreductase  38.18 
 
 
336 aa  151  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2547  hypothetical protein  37.39 
 
 
330 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1527  hypothetical protein  36.62 
 
 
324 aa  150  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113134  hitchhiker  0.00019128 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4801  hypothetical protein  35.49 
 
 
333 aa  146  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3528  hypothetical protein  34.88 
 
 
330 aa  145  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324396  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1139  hypothetical protein  35.52 
 
 
343 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1906  nitroreductase  35.03 
 
 
349 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5906  hypothetical protein  37.01 
 
 
335 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382454  normal  0.158726 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3639  hypothetical protein  37.12 
 
 
332 aa  143  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0611686  normal  0.0223593 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13152  hypothetical protein  37.54 
 
 
332 aa  142  8e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3213  hypothetical protein  34.62 
 
 
343 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3087  hypothetical protein  34.62 
 
 
343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1576  hypothetical protein  35.99 
 
 
324 aa  139  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.723932 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1426  hypothetical protein  34.62 
 
 
343 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5585  hypothetical protein  37.08 
 
 
343 aa  139  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.582272  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2315  hypothetical protein  35.95 
 
 
343 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1054  hypothetical protein  34.32 
 
 
343 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.624063  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1340  hypothetical protein  34.32 
 
 
343 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2320  hypothetical protein  34.32 
 
 
343 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151899  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0827  hypothetical protein  34.27 
 
 
380 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862979  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1136  hypothetical protein  35.62 
 
 
330 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.772806  normal  0.853595 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3848  hypothetical protein  36.72 
 
 
329 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572013  decreased coverage  0.00997799 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3648  nitroreductase  37.58 
 
 
331 aa  135  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000896643  normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0779  hypothetical protein  34.26 
 
 
375 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00353423  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1107  hypothetical protein  35.29 
 
 
330 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1124  hypothetical protein  35.29 
 
 
330 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1383  hypothetical protein  34.33 
 
 
327 aa  132  6e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684132  normal  0.626977 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4994  hypothetical protein  35.61 
 
 
327 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1530  hypothetical protein  36.58 
 
 
380 aa  132  6.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2723  hypothetical protein  39.23 
 
 
315 aa  132  9e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1917  nitroreductase  34.8 
 
 
328 aa  132  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0831  hypothetical protein  33.64 
 
 
376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.108974  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0827  hypothetical protein  33.64 
 
 
377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1579  hypothetical protein  35.37 
 
 
382 aa  130  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1078  hypothetical protein  35.33 
 
 
330 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1094  hypothetical protein  35.33 
 
 
330 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0508938  normal  0.0740318 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1105  hypothetical protein  35.33 
 
 
330 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645452  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2414  nitroreductase  36.16 
 
 
325 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4124  hypothetical protein  36.1 
 
 
318 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4199  hypothetical protein  36.1 
 
 
318 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0708158  normal  0.45001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4355  hypothetical protein  36.1 
 
 
318 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.734887  normal  0.127472 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3845  hypothetical protein  33.03 
 
 
332 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0731664  normal  0.0221038 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1864  hypothetical protein  32.83 
 
 
343 aa  116  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13147  hypothetical protein  31.61 
 
 
344 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.825621 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3177  hypothetical protein  35.05 
 
 
320 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000373208  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22840  nitroreductase family protein  31.56 
 
 
326 aa  113  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.747416 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3661  hypothetical protein  30.92 
 
 
342 aa  112  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0777265  normal  0.505633 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2549  hypothetical protein  36.39 
 
 
318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0727  hypothetical protein  27.71 
 
 
344 aa  110  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.946422  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2550  hypothetical protein  32.47 
 
 
331 aa  110  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.286311  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19000  nitroreductase family protein  37.62 
 
 
336 aa  107  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0843848 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0316  hypothetical protein  28.79 
 
 
318 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3410  hypothetical protein  30.51 
 
 
335 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3473  hypothetical protein  30.51 
 
 
335 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0159149 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4128  hypothetical protein  34.16 
 
 
325 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.58877  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4203  hypothetical protein  34.16 
 
 
325 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4359  hypothetical protein  34.16 
 
 
325 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3421  hypothetical protein  30.51 
 
 
335 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156919 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12069  hypothetical protein  30.29 
 
 
331 aa  103  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.919596  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1217  hypothetical protein  28.35 
 
 
339 aa  102  8e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1381  putative nitroreductase  32.34 
 
 
355 aa  91.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.940442  normal  0.168367 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1487  hypothetical protein  27.79 
 
 
368 aa  90.9  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1075  hypothetical protein  32.78 
 
 
326 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617578  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1091  hypothetical protein  32.78 
 
 
326 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.202469  normal  0.113609 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1102  hypothetical protein  32.78 
 
 
326 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0127461  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2157  hypothetical protein  24.85 
 
 
375 aa  87.4  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.296122  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4304  hypothetical protein  29.03 
 
 
392 aa  84.3  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2392  hypothetical protein  25.46 
 
 
384 aa  82.8  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3174  hypothetical protein  30.18 
 
 
359 aa  82.4  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1003  hypothetical protein  24.77 
 
 
330 aa  80.1  0.00000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5075  hypothetical protein  31.71 
 
 
364 aa  80.1  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3747  hypothetical protein  27.96 
 
 
359 aa  79.3  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.333712 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2155  twin-arginine translocation pathway signal  30.19 
 
 
378 aa  78.2  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.301738  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1474  hypothetical protein  25.53 
 
 
377 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3197  hypothetical protein  24.79 
 
 
390 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.640272  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2245  hypothetical protein  25.76 
 
 
377 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2579  hypothetical protein  28.83 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2624  hypothetical protein  28.83 
 
 
297 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.130193  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3075  hypothetical protein  34.13 
 
 
989 aa  70.1  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.697159  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2729  hypothetical protein  26.79 
 
 
369 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.918385  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2230  hypothetical protein  24.07 
 
 
679 aa  65.1  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000280585  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3327  hypothetical protein  18.9 
 
 
372 aa  65.1  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000687269  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0884  hypothetical protein  31.09 
 
 
402 aa  63.9  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.159718 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0822  hypothetical protein  29.38 
 
 
1006 aa  63.2  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0692  hypothetical protein  26.9 
 
 
968 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.233309 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0026  hypothetical protein  41.73 
 
 
817 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2045  hypothetical protein  23.89 
 
 
351 aa  54.3  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161905  hitchhiker  0.0000184518 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02470  hypothetical protein  34.86 
 
 
325 aa  53.1  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0168  hypothetical protein  33.1 
 
 
273 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.939861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2618  hypothetical protein  34.27 
 
 
297 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>