More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2884 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_13350  serine hydroxymethyltransferase  76.79 
 
 		 423 aa  647    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2884  Glycine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 442 aa  887    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595685  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3596  Glycine hydroxymethyltransferase  79.9 
 
 		 447 aa  641    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3847  Glycine hydroxymethyltransferase  75.89 
 
 		 420 aa  639    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0767  serine hydroxymethyltransferase  76.12 
 
 		 445 aa  654    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0535  Glycine hydroxymethyltransferase  74.29 
 
 		 434 aa  631  1e-180  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18800  serine hydroxymethyltransferase  77 
 
 		 412 aa  625  1e-178  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10070  serine hydroxymethyltransferase  73.63 
 
 		 425 aa  624  1e-178  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.9411  normal  0.116151 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3705  serine hydroxymethyltransferase  74.71 
 
 		 453 aa  626  1e-178  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0424  Glycine hydroxymethyltransferase  74.64 
 
 		 422 aa  621  1e-177  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1663  Glycine hydroxymethyltransferase  70.96 
 
 		 435 aa  620  1e-176  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2501  Glycine hydroxymethyltransferase  72.71 
 
 		 427 aa  619  1e-176  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0657  Glycine hydroxymethyltransferase  71.43 
 
 		 452 aa  616  1e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2353  serine hydroxymethyltransferase  73.99 
 
 		 423 aa  609  1e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0383526  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5659  Glycine hydroxymethyltransferase  78.57 
 
 		 421 aa  599  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1189  serine hydroxymethyltransferase  72.49 
 
 		 432 aa  599  1e-170  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000045975 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1115  serine hydroxymethyltransferase  72.64 
 
 		 435 aa  597  1e-169  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234213  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4629  Glycine hydroxymethyltransferase  70.69 
 
 		 430 aa  595  1e-169  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.162942 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3130  Glycine hydroxymethyltransferase  71.53 
 
 		 432 aa  593  1e-168  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0694  serine hydroxymethyltransferase  69.1 
 
 		 429 aa  592  1e-168  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04680  serine hydroxymethyltransferase  69.88 
 
 		 426 aa  590  1e-167  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27940  serine hydroxymethyltransferase  67.22 
 
 		 430 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.958283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0754  Glycine hydroxymethyltransferase  67.92 
 
 		 428 aa  580  1e-164  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128225  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11114  serine hydroxymethyltransferase  69.3 
 
 		 426 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000666035  normal  0.472146 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3981  Glycine hydroxymethyltransferase  71.53 
 
 		 434 aa  570  1e-161  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.638114 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2989  Glycine hydroxymethyltransferase  69.58 
 
 		 440 aa  563  1.0000000000000001e-159  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21370  serine hydroxymethyltransferase  67.77 
 
 		 422 aa  556  1e-157  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.100651  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0469  serine hydroxymethyltransferase  65.64 
 
 		 474 aa  543  1e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996315  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  60.53 
 
 		 418 aa  513  1e-144  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  59.47 
 
 		 413 aa  503  1e-141  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  60.57 
 
 		 431 aa  501  1e-141  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  59.95 
 
 		 415 aa  502  1e-141  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  61.17 
 
 		 415 aa  499  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  59.22 
 
 		 415 aa  499  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  59.53 
 
 		 429 aa  495  1e-139  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  59.47 
 
 		 415 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  58.21 
 
 		 412 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  58.31 
 
 		 414 aa  489  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  57.07 
 
 		 417 aa  489  1e-137  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  58.31 
 
 		 413 aa  489  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  58.07 
 
 		 413 aa  488  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  58.07 
 
 		 413 aa  487  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  58.07 
 
 		 414 aa  486  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  58.07 
 
 		 414 aa  488  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  59.34 
 
 		 424 aa  488  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3495  serine hydroxymethyltransferase  57.75 
 
 		 434 aa  488  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  57.83 
 
 		 413 aa  487  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2113  serine hydroxymethyltransferase  60.19 
 
 		 424 aa  488  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  58.07 
 
 		 413 aa  485  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  58.89 
 
 		 416 aa  486  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3171  serine hydroxymethyltransferase  57.75 
 
 		 434 aa  488  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3366  serine hydroxymethyltransferase  57.04 
 
 		 434 aa  487  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  56.46 
 
 		 423 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  57.14 
 
 		 412 aa  484  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  57.14 
 
 		 412 aa  484  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3354  serine hydroxymethyltransferase  60.14 
 
 		 432 aa  484  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0554425  normal  0.88347 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  57.73 
 
 		 415 aa  484  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  58.27 
 
 		 416 aa  481  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  57.83 
 
 		 413 aa  484  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  55.85 
 
 		 416 aa  484  1e-135  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  57.49 
 
 		 415 aa  482  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  57.35 
 
 		 413 aa  483  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1871  Glycine hydroxymethyltransferase  59.43 
 
 		 417 aa  481  1e-134  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0163056  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  58.64 
 
 		 417 aa  479  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  56.59 
 
 		 413 aa  481  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  57.11 
 
 		 413 aa  478  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2659  serine hydroxymethyltransferase  57.51 
 
 		 440 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719136  normal  0.877467 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2671  serine hydroxymethyltransferase  57.18 
 
 		 433 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  57.52 
 
 		 413 aa  480  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  55.74 
 
 		 423 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02841  serine hydroxymethyltransferase  55.88 
 
 		 416 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1624  serine hydroxymethyltransferase  55.34 
 
 		 411 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  57.77 
 
 		 411 aa  477  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03361  serine hydroxymethyltransferase  54.85 
 
 		 411 aa  475  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.498926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  55.5 
 
 		 423 aa  477  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  58.51 
 
 		 427 aa  475  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2634  serine hydroxymethyltransferase  57.58 
 
 		 433 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8588  serine hydroxymethyltransferase  59.38 
 
 		 420 aa  477  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  56.9 
 
 		 415 aa  476  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  55.97 
 
 		 439 aa  478  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3004  serine hydroxymethyltransferase  58.28 
 
 		 432 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21133  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  58.68 
 
 		 415 aa  476  1e-133  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  58.51 
 
 		 415 aa  475  1e-133  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  57.25 
 
 		 412 aa  473  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  57.46 
 
 		 412 aa  473  1e-132  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  59.56 
 
 		 412 aa  474  1e-132  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  55.58 
 
 		 438 aa  471  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  55.12 
 
 		 432 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1266  serine hydroxymethyltransferase  54.88 
 
 		 432 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0458809  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1225  serine hydroxymethyltransferase  57.38 
 
 		 433 aa  473  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1579  serine hydroxymethyltransferase  57.04 
 
 		 431 aa  474  1e-132  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  57.93 
 
 		 417 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1551  serine hydroxymethyltransferase  57.14 
 
 		 416 aa  473  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  56.4 
 
 		 417 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  56.64 
 
 		 417 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  56.64 
 
 		 417 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  56.25 
 
 		 417 aa  473  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  56.4 
 
 		 417 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  55.88 
 
 		 414 aa  472  1e-132  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  56.64 
 
 		 417 aa  473  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>