More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0928 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  67.37 
 
 
647 aa  892  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
643 aa  1313  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  73.95 
 
 
639 aa  1001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  62.21 
 
 
640 aa  784  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  70.11 
 
 
636 aa  914  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  68.62 
 
 
642 aa  866  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  66.4 
 
 
645 aa  882  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  49.82 
 
 
619 aa  563  1e-159  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  41.25 
 
 
634 aa  486  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  7.85776e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  41.37 
 
 
646 aa  472  1e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  39.82 
 
 
609 aa  437  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  38.49 
 
 
645 aa  435  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  37.87 
 
 
636 aa  430  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  39.2 
 
 
646 aa  422  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3359  penicillin-binding protein 2  39.34 
 
 
597 aa  420  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.20797  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  37.26 
 
 
646 aa  419  1e-115  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  39.28 
 
 
630 aa  409  1e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2823  penicillin-binding protein 2  36.35 
 
 
755 aa  406  1e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.774814 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  35.99 
 
 
658 aa  408  1e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.03 
 
 
618 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  37.04 
 
 
631 aa  402  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  37.81 
 
 
628 aa  402  1e-110  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  35.96 
 
 
643 aa  400  1e-110  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3336  penicillin-binding protein 2  35.64 
 
 
661 aa  400  1e-110  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101534  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  36.62 
 
 
629 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  37.29 
 
 
626 aa  398  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  35.91 
 
 
629 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  37.36 
 
 
801 aa  396  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  36.08 
 
 
629 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  38.59 
 
 
648 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  35.75 
 
 
629 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2219  penicillin-binding protein 2  39.07 
 
 
600 aa  394  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  36.56 
 
 
673 aa  392  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  37.48 
 
 
681 aa  390  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0473  peptidoglycan glycosyltransferase  38.59 
 
 
681 aa  391  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  37.46 
 
 
611 aa  390  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1849  penicillin-binding protein 2  36.27 
 
 
631 aa  389  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0470  peptidoglycan glycosyltransferase  38.83 
 
 
648 aa  390  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3021  penicillin-binding protein 2  36.44 
 
 
631 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00366199  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  36.6 
 
 
640 aa  390  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  37.82 
 
 
630 aa  391  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  37.33 
 
 
631 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  37.65 
 
 
631 aa  391  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  34.43 
 
 
637 aa  390  1e-107  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  38.97 
 
 
648 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  38.97 
 
 
648 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2949  penicillin-binding protein 2  36.44 
 
 
631 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151032  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  37.52 
 
 
610 aa  386  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2065  penicillin-binding protein 2  35.54 
 
 
623 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180725  normal  0.157728 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  35.5 
 
 
610 aa  386  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3060  penicillin-binding protein 2  35.66 
 
 
630 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569181  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2070  penicillin-binding protein 2  35.23 
 
 
623 aa  389  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  5.25085e-06 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1336  penicillin-binding protein 2  35.54 
 
 
623 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.692108  hitchhiker  2.0031e-06 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1465  peptidoglycan glycosyltransferase  36.29 
 
 
691 aa  387  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714694  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  35.45 
 
 
630 aa  388  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2125  penicillin-binding protein 2  35.23 
 
 
623 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  3.81771e-08 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  35.73 
 
 
574 aa  388  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1170  penicillin-binding protein 2  36.72 
 
 
633 aa  387  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.117814  normal  0.171214 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1212  penicillin-binding protein 2  35.54 
 
 
623 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2024  peptidoglycan glycosyltransferase  36.83 
 
 
635 aa  384  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0252806  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01217  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  34.62 
 
 
641 aa  383  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1092  penicillin-binding protein 2  36.33 
 
 
634 aa  384  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3741  penicillin-binding protein 2  36.1 
 
 
631 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1201  penicillin-binding protein 2  36.38 
 
 
631 aa  383  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.621118  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  33.96 
 
 
628 aa  384  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2022  peptidoglycan glycosyltransferase  36.1 
 
 
667 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.238074  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1463  peptidoglycan glycosyltransferase  34.96 
 
 
655 aa  383  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37559  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  36.52 
 
 
619 aa  382  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3687  penicillin-binding protein 2  36.87 
 
 
801 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.955324  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3364  penicillin-binding protein 2  36.7 
 
 
801 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0616  penicillin-binding protein 2  35.76 
 
 
633 aa  382  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  5.4384e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  35.17 
 
 
618 aa  380  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  7.5861e-05  unclonable  1.00578e-10 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0687  penicillin-binding protein 2  35.76 
 
 
633 aa  381  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.14363e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3010  penicillin-binding protein 2  35.76 
 
 
633 aa  381  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  2.10034e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2356  peptidoglycan glycosyltransferase  34.47 
 
 
641 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2165  penicillin-binding protein 2  36.08 
 
 
655 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0495  peptidoglycan glycosyltransferase  38.58 
 
 
662 aa  381  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0682861  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0661  penicillin-binding protein 2  35.76 
 
 
633 aa  382  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  7.49016e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0655  penicillin-binding protein 2  35.76 
 
 
633 aa  381  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  4.71681e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1741  penicillin-binding protein 2  36.01 
 
 
635 aa  380  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0724  penicillin-binding protein 2  35.76 
 
 
633 aa  381  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000167121  normal  0.141878 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2131  peptidoglycan glycosyltransferase  38.05 
 
 
689 aa  380  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  36.21 
 
 
637 aa  380  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  35.03 
 
 
640 aa  382  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00604  transpeptidase involved in peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 2)  35.76 
 
 
633 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0219544  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  37.65 
 
 
646 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  36.18 
 
 
630 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00593  hypothetical protein  35.76 
 
 
633 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0186683  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  34.67 
 
 
618 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  34.67 
 
 
618 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  5.94498e-05  normal  0.0491088 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2991  penicillin-binding protein 2  35.76 
 
 
633 aa  381  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.98209e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  34.06 
 
 
618 aa  378  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  1.24923e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  34.5 
 
 
618 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  1.09983e-07 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0993  peptidoglycan glycosyltransferase  35.2 
 
 
602 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223837  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  34.5 
 
 
618 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  37.76 
 
 
647 aa  378  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  34.61 
 
 
703 aa  376  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1370  peptidoglycan glycosyltransferase  37.04 
 
 
808 aa  379  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0776138  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  34.5 
 
 
618 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  34.5 
 
 
618 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.07443e-07  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>