More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0469 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  100 
 
 
201 aa  413  1e-115  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  71.14 
 
 
200 aa  302  3e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  69.15 
 
 
217 aa  289  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  59.2 
 
 
200 aa  262  3e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  61.69 
 
 
202 aa  256  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3895  alpha-ribazole phosphatase  57.21 
 
 
198 aa  238  5e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0234787 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  57.21 
 
 
198 aa  235  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  55.05 
 
 
213 aa  232  3e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  40.21 
 
 
197 aa  150  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.05722e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  41.4 
 
 
591 aa  145  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  37.63 
 
 
200 aa  135  4e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  39.69 
 
 
223 aa  133  2e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  38.95 
 
 
256 aa  133  2e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  35.9 
 
 
214 aa  130  2e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  37.57 
 
 
241 aa  129  4e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  34 
 
 
208 aa  123  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  36.07 
 
 
213 aa  122  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.63977e-06  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  33.87 
 
 
201 aa  118  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  34.52 
 
 
235 aa  115  4e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  34.67 
 
 
205 aa  111  9e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2288  phosphoglycerate mutase  36.24 
 
 
155 aa  108  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  32.42 
 
 
198 aa  107  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  30.05 
 
 
196 aa  106  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  1.5335e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  39.88 
 
 
198 aa  106  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.33 
 
 
427 aa  104  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  37.87 
 
 
209 aa  103  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  35.18 
 
 
402 aa  103  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0998  Phosphoglycerate mutase  34.57 
 
 
201 aa  102  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.64 
 
 
201 aa  102  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  32.32 
 
 
202 aa  100  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  5.9372e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  29.47 
 
 
233 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  28.5 
 
 
200 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  6.81703e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  31.66 
 
 
411 aa  99.4  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  29.02 
 
 
200 aa  98.6  5e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  2.1297e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  38.6 
 
 
224 aa  98.2  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  33.67 
 
 
412 aa  98.2  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  37.87 
 
 
218 aa  97.8  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  28.93 
 
 
228 aa  97.1  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  35.64 
 
 
189 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  36.96 
 
 
209 aa  95.9  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  30.1 
 
 
200 aa  95.9  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  35.47 
 
 
227 aa  96.3  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1649  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.64 
 
 
191 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  hitchhiker  0.00512316 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  27.98 
 
 
200 aa  95.9  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  27.98 
 
 
200 aa  95.9  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
212 aa  94.7  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  31.12 
 
 
209 aa  95.1  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  30.48 
 
 
240 aa  94.7  8e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
209 aa  94.7  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  38.01 
 
 
229 aa  94  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.41 
 
 
442 aa  93.2  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  34.52 
 
 
221 aa  93.2  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  34.21 
 
 
188 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  34.34 
 
 
207 aa  93.2  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 
378 aa  93.2  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  32.65 
 
 
440 aa  92  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.66 
 
 
382 aa  92  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  33.68 
 
 
188 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  33.68 
 
 
188 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.14 
 
 
190 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
208 aa  90.1  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  31.96 
 
 
213 aa  90.1  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  28.72 
 
 
203 aa  89.4  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  35.75 
 
 
224 aa  89.4  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  29.17 
 
 
203 aa  89.4  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.51 
 
 
442 aa  89.7  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.17 
 
 
442 aa  89  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  34.85 
 
 
210 aa  89.4  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  30.98 
 
 
216 aa  88.6  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  30.98 
 
 
216 aa  89  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1249  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  30.77 
 
 
207 aa  88.6  6e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.29402  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  34.46 
 
 
217 aa  88.6  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  31 
 
 
223 aa  88.6  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  30.39 
 
 
223 aa  88.2  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  28.21 
 
 
203 aa  88.2  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  33.51 
 
 
229 aa  88.2  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0928  Phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 
201 aa  88.2  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.3 
 
 
442 aa  88.2  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  25.49 
 
 
448 aa  88.2  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  28.72 
 
 
203 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  25.49 
 
 
448 aa  88.2  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0703  Fis family transcriptional regulator  33.16 
 
 
217 aa  87.8  9e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.123579  normal  0.22759 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  31.28 
 
 
200 aa  87.8  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  32.99 
 
 
220 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  32.99 
 
 
220 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0464  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  36.22 
 
 
197 aa  87.4  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  26.77 
 
 
203 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  26.77 
 
 
203 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1758  phosphoglycerate mutase  32.62 
 
 
190 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0909512  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  33.33 
 
 
190 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.46 
 
 
444 aa  86.7  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  28.07 
 
 
205 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.72 
 
 
442 aa  85.5  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  29.59 
 
 
213 aa  85.5  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1379  Phosphoglycerate mutase  32.6 
 
 
197 aa  85.5  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  26.88 
 
 
203 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  32.47 
 
 
208 aa  85.5  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  32.47 
 
 
229 aa  85.1  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.38 
 
 
442 aa  85.1  7e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  31.02 
 
 
215 aa  85.1  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>