More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1761 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 419 aa  863    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  69.25 
 
 		 414 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  66.27 
 
 		 416 aa  592  1e-168  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  66.99 
 
 		 415 aa  589  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  66.02 
 
 		 416 aa  585  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  68.13 
 
 		 413 aa  584  1e-166  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  67.96 
 
 		 413 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  59.61 
 
 		 419 aa  521  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  52.9 
 
 		 417 aa  435  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  52.2 
 
 		 421 aa  436  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0013  histidyl-tRNA synthetase  53.94 
 
 		 419 aa  433  1e-120  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  53.09 
 
 		 423 aa  421  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0027  histidyl-tRNA synthetase  53.12 
 
 		 417 aa  423  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2838  histidyl-tRNA synthetase  51.74 
 
 		 417 aa  422  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 424 aa  422  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  50.86 
 
 		 419 aa  422  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 		 419 aa  416  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2037  histidyl-tRNA synthetase  53.27 
 
 		 426 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  53.28 
 
 		 400 aa  417  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  50.74 
 
 		 420 aa  402  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  47.77 
 
 		 423 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  49.01 
 
 		 423 aa  399  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 		 425 aa  396  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  46.1 
 
 		 419 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02980  histidyl-tRNA synthetase  51.34 
 
 		 427 aa  395  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.651371  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  52.06 
 
 		 426 aa  396  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1128  histidyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 		 424 aa  393  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  45.43 
 
 		 421 aa  393  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  49.51 
 
 		 424 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2984  histidyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 		 429 aa  392  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 		 423 aa  392  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 		 424 aa  392  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 		 424 aa  394  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  48.22 
 
 		 424 aa  392  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 		 424 aa  392  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 		 417 aa  393  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  48.77 
 
 		 424 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1294  histidyl-tRNA synthetase  48.44 
 
 		 424 aa  391  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  48.4 
 
 		 425 aa  390  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0417  histidyl-tRNA synthetase  48.44 
 
 		 424 aa  391  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143012 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1187  histidyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 		 424 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557803  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 		 414 aa  388  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  48.77 
 
 		 424 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2855  histidyl-tRNA synthetase  49.51 
 
 		 428 aa  389  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.983012  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1788  histidyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 		 423 aa  389  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1419  histidyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 		 446 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.022633 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 		 414 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1230  histidyl-tRNA synthetase  48.4 
 
 		 425 aa  389  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 424 aa  386  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 424 aa  386  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 424 aa  386  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 424 aa  386  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3389  histidyl-tRNA synthetase  48.41 
 
 		 431 aa  387  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 424 aa  386  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 424 aa  386  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 		 415 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  48.53 
 
 		 424 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  48.28 
 
 		 424 aa  386  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  48.53 
 
 		 424 aa  388  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1229  histidyl-tRNA synthetase  48.4 
 
 		 425 aa  388  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.322745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1300  histidyl-tRNA synthetase  48.4 
 
 		 425 aa  388  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 424 aa  386  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  48.53 
 
 		 424 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  48.53 
 
 		 424 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  46.4 
 
 		 418 aa  387  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  49.63 
 
 		 424 aa  388  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2889  histidyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 422 aa  382  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0063  histidyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 446 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00160741  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 423 aa  383  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3004  histidyl-tRNA synthetase  47.41 
 
 		 426 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0149184  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1344  histidyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 446 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1464  histidyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 446 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.49092  normal  0.444006 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1106  histidyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 446 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2540  histidyl-tRNA synthetase  47.41 
 
 		 446 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0401041  hitchhiker  0.00166777 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2353  histidyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 446 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  46.28 
 
 		 429 aa  384  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2189  histidyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 		 446 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3147  histidyl-tRNA synthetase  47.41 
 
 		 426 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1834  histidyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 446 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283546  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 		 422 aa  383  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2235  histidyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 446 aa  383  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  47.3 
 
 		 424 aa  382  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1374  histidyl-tRNA synthetase  47.41 
 
 		 426 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0595731  normal  0.400844 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2989  histidyl-tRNA synthetase  47.41 
 
 		 426 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2227  histidyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 446 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 		 422 aa  384  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0854  histidyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 		 429 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0897  histidyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 		 429 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475429  hitchhiker  0.000000578873 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4324  histidyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 		 429 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439284  hitchhiker  0.0000000761597 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 		 422 aa  379  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0622  histidyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 		 426 aa  381  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 		 424 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1595  histidyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 		 446 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0413234  normal  0.116448 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0884  histidyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 		 429 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265271  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0735  histidyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 		 427 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 		 421 aa  381  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4251  histidyl-tRNA synthetase  47.62 
 
 		 426 aa  376  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1357  histidyl-tRNA synthetase  47.45 
 
 		 424 aa  376  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000835199 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1510  histidyl-tRNA synthetase  46.89 
 
 		 426 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.707902  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1060  histidyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 		 450 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.110203  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>