98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3811 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0796  protein of unknown function DUF222  97.23 
 
 		 534 aa  890    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4191  protein of unknown function DUF222  98.08 
 
 		 533 aa  931    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.650463  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3811  protein of unknown function DUF222  100 
 
 		 593 aa  1206    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4658  hypothetical protein  98.91 
 
 		 275 aa  548  1e-155  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449109  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4288  protein of unknown function DUF222  46.92 
 
 		 524 aa  397  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.429378  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4824  protein of unknown function DUF222  43.82 
 
 		 553 aa  385  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2802  protein of unknown function DUF222  43.87 
 
 		 551 aa  370  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0845411  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3136  hypothetical protein  45.28 
 
 		 387 aa  255  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4665  hypothetical protein  96.83 
 
 		 149 aa  251  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4232  hypothetical protein  36.17 
 
 		 448 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815534  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3803  hypothetical protein  36.64 
 
 		 447 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.866819  normal  0.47715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4610  hypothetical protein  36.01 
 
 		 448 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2779  hypothetical protein  33.92 
 
 		 473 aa  226  6e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2089  hypothetical protein  35.44 
 
 		 493 aa  226  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.129503 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0348  hypothetical protein  34.4 
 
 		 492 aa  226  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0338  hypothetical protein  34.4 
 
 		 492 aa  226  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3547  hypothetical protein  33.92 
 
 		 444 aa  225  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0179  hypothetical protein  33.7 
 
 		 442 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0170  hypothetical protein  33.7 
 
 		 442 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523196  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3542  hypothetical protein  33.48 
 
 		 444 aa  219  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2749  hypothetical protein  33.49 
 
 		 473 aa  219  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.621595  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2793  hypothetical protein  33.49 
 
 		 473 aa  219  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.925956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3615  hypothetical protein  33.48 
 
 		 444 aa  219  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0327  hypothetical protein  33.26 
 
 		 490 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1835  hypothetical protein  34.28 
 
 		 489 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2293  protein of unknown function DUF222  31.83 
 
 		 540 aa  215  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3745  protein of unknown function DUF222  34.61 
 
 		 531 aa  213  4.9999999999999996e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2106  hypothetical protein  36.66 
 
 		 446 aa  214  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.426457  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2152  hypothetical protein  36.66 
 
 		 492 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.166446 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4437  hypothetical protein  35 
 
 		 507 aa  209  8e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.835135  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4351  hypothetical protein  35 
 
 		 507 aa  209  8e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489972  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4127  protein of unknown function DUF222  33.64 
 
 		 532 aa  209  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4731  hypothetical protein  34.76 
 
 		 507 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5741  hypothetical protein  34.76 
 
 		 519 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.316715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1709  hypothetical protein  34.29 
 
 		 507 aa  205  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5454  hypothetical protein  34.76 
 
 		 519 aa  205  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.157039  decreased coverage  0.0069948 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1730  hypothetical protein  34.29 
 
 		 507 aa  205  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1777  hypothetical protein  34.29 
 
 		 507 aa  205  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11151  hypothetical protein  36.72 
 
 		 451 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3477  hypothetical protein  35.15 
 
 		 506 aa  196  7e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.800826  normal  0.648899 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11173  hypothetical protein  35.61 
 
 		 499 aa  196  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3484  hypothetical protein  33.82 
 
 		 552 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210016  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4014  hypothetical protein  35.45 
 
 		 464 aa  194  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00728967 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4397  hypothetical protein  34.28 
 
 		 501 aa  194  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2470  protein of unknown function DUF222  34.07 
 
 		 437 aa  193  7e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11717  hypothetical protein  35.7 
 
 		 454 aa  187  5e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.12455 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4912  hypothetical protein  32.94 
 
 		 508 aa  186  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5865  hypothetical protein  32.78 
 
 		 511 aa  184  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11974  hypothetical protein  35.37 
 
 		 454 aa  184  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3231  hypothetical protein  32.7 
 
 		 510 aa  184  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3050  hypothetical protein  31.58 
 
 		 495 aa  183  7e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184286 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3379  hypothetical protein  31.94 
 
 		 497 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.887374  normal  0.158077 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4827  hypothetical protein  32.7 
 
 		 508 aa  179  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.79889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4451  hypothetical protein  30.44 
 
 		 518 aa  169  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10095  hypothetical protein  43.48 
 
 		 317 aa  167  4e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.391031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3851  hypothetical protein  30.53 
 
 		 513 aa  167  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.432378 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4192  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  166  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0797  hypothetical protein  96.3 
 
 		 81 aa  158  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.734327  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5363  hypothetical protein  32.48 
 
 		 355 aa  140  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11604  REP13E12 repeat-containing protein  43.22 
 
 		 240 aa  118  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.81222e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13504  hypothetical protein  43.22 
 
 		 239 aa  118  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  28.12 
 
 		 432 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  29.14 
 
 		 442 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  36.54 
 
 		 469 aa  88.2  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  28.25 
 
 		 485 aa  85.1  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  25.28 
 
 		 561 aa  77  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  24.93 
 
 		 546 aa  75.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  29.91 
 
 		 494 aa  68.6  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00000378313  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  22.8 
 
 		 572 aa  63.9  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2460  HNH endonuclease  29.69 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1508  HNH endonuclease  29.38 
 
 		 436 aa  61.2  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000388947  hitchhiker  0.00249472 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2505  HNH endonuclease  28 
 
 		 433 aa  60.8  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2278  HNH endonuclease  29.69 
 
 		 440 aa  60.1  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384645  normal  0.214719 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3947  HNH endonuclease  33.96 
 
 		 433 aa  58.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4589  HNH endonuclease  34.18 
 
 		 428 aa  58.2  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3201  HNH endonuclease  34.38 
 
 		 428 aa  58.2  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5365  hypothetical protein  45.9 
 
 		 158 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0359  HNH endonuclease  32.12 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1463  HNH nuclease  26.13 
 
 		 414 aa  57  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1199  hypothetical protein  25.83 
 
 		 505 aa  55.5  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  29.84 
 
 		 469 aa  55.1  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7882  HNH endonuclease  31.25 
 
 		 391 aa  54.7  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00294777  hitchhiker  0.00944768 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  30.32 
 
 		 661 aa  53.5  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09510  HNH endonuclease  27.31 
 
 		 464 aa  53.5  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531982  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0347  HNH endonuclease  28.36 
 
 		 627 aa  51.2  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3314  hypothetical protein  25 
 
 		 526 aa  49.3  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0608226  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0067  HNH endonuclease  36.71 
 
 		 458 aa  47.8  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2332  HNH endonuclease  27.62 
 
 		 620 aa  47.8  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.934407  normal  0.611085 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  27.71 
 
 		 408 aa  47.4  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4933  HNH nuclease  29.11 
 
 		 407 aa  47.4  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1741  HNH nuclease  24.44 
 
 		 414 aa  47  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.206853  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3157  HNH endonuclease  28.43 
 
 		 441 aa  47  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000184807  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  28.48 
 
 		 413 aa  44.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23120  hypothetical protein  30.16 
 
 		 522 aa  45.1  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0151991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3744  hypothetical protein  31.96 
 
 		 436 aa  44.3  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3732  hypothetical protein  31.96 
 
 		 438 aa  44.3  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3805  hypothetical protein  31.96 
 
 		 438 aa  44.3  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.482154  normal  0.0784296 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 605 aa  43.9  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>