60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4658 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4658  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  556  1e-157  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449109  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3811  protein of unknown function DUF222  98.91 
 
 		 593 aa  548  1e-155  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4191  protein of unknown function DUF222  98.18 
 
 		 533 aa  546  1e-154  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.650463  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0796  protein of unknown function DUF222  96.74 
 
 		 534 aa  508  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4288  protein of unknown function DUF222  44.28 
 
 		 524 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.429378  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3136  hypothetical protein  43.78 
 
 		 387 aa  160  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4824  protein of unknown function DUF222  43.01 
 
 		 553 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2802  protein of unknown function DUF222  40.21 
 
 		 551 aa  141  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0845411  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3803  hypothetical protein  31.49 
 
 		 447 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.866819  normal  0.47715 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4232  hypothetical protein  30.39 
 
 		 448 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815534  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4610  hypothetical protein  30.39 
 
 		 448 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5741  hypothetical protein  27.92 
 
 		 519 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.316715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3547  hypothetical protein  27.75 
 
 		 444 aa  75.5  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0327  hypothetical protein  27.75 
 
 		 490 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1709  hypothetical protein  27.41 
 
 		 507 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4731  hypothetical protein  27.92 
 
 		 507 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1777  hypothetical protein  27.41 
 
 		 507 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1730  hypothetical protein  27.41 
 
 		 507 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5454  hypothetical protein  27.92 
 
 		 519 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.157039  decreased coverage  0.0069948 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2793  hypothetical protein  27.27 
 
 		 473 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.925956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4437  hypothetical protein  27.92 
 
 		 507 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.835135  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2749  hypothetical protein  27.27 
 
 		 473 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.621595  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4351  hypothetical protein  27.92 
 
 		 507 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489972  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0338  hypothetical protein  26.79 
 
 		 492 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2779  hypothetical protein  26.79 
 
 		 473 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5363  hypothetical protein  27.92 
 
 		 355 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0348  hypothetical protein  26.79 
 
 		 492 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0170  hypothetical protein  26.79 
 
 		 442 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523196  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0179  hypothetical protein  26.79 
 
 		 442 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1835  hypothetical protein  26.96 
 
 		 489 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11151  hypothetical protein  29.15 
 
 		 451 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2089  hypothetical protein  28.17 
 
 		 493 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.129503 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  35.04 
 
 		 442 aa  70.5  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3477  hypothetical protein  29.53 
 
 		 506 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.800826  normal  0.648899 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5865  hypothetical protein  26.7 
 
 		 511 aa  68.6  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4912  hypothetical protein  26.56 
 
 		 508 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3542  hypothetical protein  26.32 
 
 		 444 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3615  hypothetical protein  26.32 
 
 		 444 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  28.72 
 
 		 432 aa  67.8  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4397  hypothetical protein  27.46 
 
 		 501 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3745  protein of unknown function DUF222  28.28 
 
 		 531 aa  66.6  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2106  hypothetical protein  30.5 
 
 		 446 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.426457  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2152  hypothetical protein  30.5 
 
 		 492 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.166446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3231  hypothetical protein  26.04 
 
 		 510 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3484  hypothetical protein  26.09 
 
 		 552 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210016  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4827  hypothetical protein  26.56 
 
 		 508 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.79889  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2470  protein of unknown function DUF222  29.1 
 
 		 437 aa  63.5  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4127  protein of unknown function DUF222  27.78 
 
 		 532 aa  63.2  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3050  hypothetical protein  26.4 
 
 		 495 aa  62  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184286 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11717  hypothetical protein  27.72 
 
 		 454 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.12455 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3851  hypothetical protein  25.13 
 
 		 513 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.432378 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4451  hypothetical protein  24.62 
 
 		 518 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2293  protein of unknown function DUF222  24.17 
 
 		 540 aa  51.2  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4014  hypothetical protein  25.37 
 
 		 464 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00728967 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11974  hypothetical protein  25.62 
 
 		 454 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11173  hypothetical protein  25.62 
 
 		 499 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3379  hypothetical protein  23.71 
 
 		 497 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.887374  normal  0.158077 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10095  hypothetical protein  40.98 
 
 		 317 aa  44.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.391031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  25.19 
 
 		 561 aa  43.9  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  25.19 
 
 		 546 aa  43.5  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>