More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3423 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3423  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  100 
 
 		 253 aa  492  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0528  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  53.49 
 
 		 253 aa  230  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17860  dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)  54.67 
 
 		 244 aa  224  1e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.622772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6125  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  47.64 
 
 		 263 aa  216  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.426538  hitchhiker  0.00598372 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3669  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  40.08 
 
 		 265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4045  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  39.24 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344042  normal  0.123945 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0389  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  35.27 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317116  normal  0.0391405 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0880  dimethyladenosine transferase  33.03 
 
 		 261 aa  105  6e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000357619  decreased coverage  0.00867661 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  26.24 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0873  dimethyladenosine transferase  31.74 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0456  dimethyladenosine transferase  27.49 
 
 		 261 aa  102  8e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.45275  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0131  dimethyladenosine transferase  26.62 
 
 		 296 aa  100  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.273731  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2596  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  35.08 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0374666  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2264  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  34.39 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.627162 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3490  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  35.85 
 
 		 278 aa  98.2  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf007  dimethyladenosine transferase  30.1 
 
 		 258 aa  96.3  4e-19  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  28.79 
 
 		 275 aa  94.7  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1509  dimethyladenosine transferase  25.88 
 
 		 280 aa  94.7  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000452453  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl005  dimethyladenosine transferase  26.81 
 
 		 267 aa  94  2e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2047  dimethyladenosine transferase  25.28 
 
 		 276 aa  94.4  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0004  dimethyladenosine transferase  25.56 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.50922  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  26.15 
 
 		 284 aa  92.8  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  27.51 
 
 		 297 aa  92  7e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1672  dimethyladenosine transferase  28.02 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1169  dimethyladenosine transferase  27.56 
 
 		 269 aa  91.3  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.013755  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  30.5 
 
 		 276 aa  90.5  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  27.97 
 
 		 290 aa  90.5  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0708  dimethyladenosine transferase  26.97 
 
 		 281 aa  90.9  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4886  dimethyladenosine transferase  29.32 
 
 		 271 aa  90.1  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00215913  hitchhiker  0.00477797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4551  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  35.62 
 
 		 275 aa  89.7  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254194  normal  0.357985 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0858  dimethyladenosine transferase  24.8 
 
 		 258 aa  89.7  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2464  dimethyladenosine transferase  30.53 
 
 		 280 aa  89.4  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000579309  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  30.56 
 
 		 267 aa  89.4  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  28.74 
 
 		 290 aa  89  7e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_347  dimethyladenosine transferase  27.52 
 
 		 291 aa  88.6  8e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2603  dimethyladenosine transferase  34.25 
 
 		 266 aa  88.2  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0228  dimethyladenosine transferase  27.05 
 
 		 263 aa  87.8  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1187  dimethyladenosine transferase  31.34 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1172  dimethyladenosine transferase  30.22 
 
 		 262 aa  87.8  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000173217  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0508  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  34.12 
 
 		 313 aa  88.2  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  26.44 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4416  dimethyladenosine transferase  28.63 
 
 		 272 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3810  dimethyladenosine transferase  28.52 
 
 		 277 aa  87  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0278  dimethyladenosine transferase  27.07 
 
 		 291 aa  86.3  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.525697  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1220  Tn554, rRNA adenine N-6-methyltransferase  27.08 
 
 		 243 aa  85.9  5e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00652696  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1343  Tn554, rRNA adenine N-6-methyltransferase  27.08 
 
 		 243 aa  85.9  5e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2510  rRNA adenine N-6-methyltransferase  27.08 
 
 		 243 aa  85.9  5e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.728204  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0039  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  27.08 
 
 		 243 aa  85.9  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0039  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  27.08 
 
 		 243 aa  85.9  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1287  dimethyladenosine transferase  28.97 
 
 		 273 aa  85.9  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.652271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1747  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  27.08 
 
 		 243 aa  85.9  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0257214  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1713  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  27.08 
 
 		 243 aa  85.9  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3507  dimethyladenosine transferase  28.46 
 
 		 276 aa  85.9  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4480  dimethyladenosine transferase  28.63 
 
 		 272 aa  85.9  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2288  dimethyladenosine transferase  29.92 
 
 		 275 aa  85.5  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.311251  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2995  dimethyladenosine transferase  29.81 
 
 		 256 aa  85.1  9e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1177  dimethyladenosine transferase  25.69 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.0114034 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09471  dimethyladenosine transferase  26.69 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0967055 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  27.68 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1126  dimethyladenosine transferase  28.4 
 
 		 459 aa  84  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0870793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3234  dimethyladenosine transferase  30.73 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0690544  normal  0.0840348 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0806  dimethyladenosine transferase  26.57 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68016  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0514  dimethyladenosine transferase  26.87 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00510308  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3348  dimethyladenosine transferase  25.36 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.908407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0171  dimethyladenosine transferase  29.28 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0527  dimethyladenosine transferase  26.87 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0439475  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0404  dimethyladenosine transferase  26.27 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1628  dimethyladenosine transferase  29.09 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0961527  hitchhiker  0.00711372 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  27.4 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0313  dimethyladenosine transferase  26.57 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0383  dimethyladenosine transferase  32.6 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1492  dimethyladenosine transferase  23.85 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1023  dimethyladenosine transferase  34.38 
 
 		 265 aa  83.2  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.867687  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1193  dimethyladenosine transferase  31 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03760  dimethyladenosine transferase  25.09 
 
 		 269 aa  82  0.000000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.472323  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2855  dimethyladenosine transferase  29.43 
 
 		 256 aa  82  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0961  dimethyladenosine transferase  29.17 
 
 		 287 aa  82  0.000000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1980  dimethyladenosine transferase  32.06 
 
 		 263 aa  82  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2292  dimethyladenosine transferase  28.25 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.777325  normal  0.694283 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1456  dimethyladenosine transferase  29.55 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  31.42 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1935  dimethyladenosine transferase  29.39 
 
 		 275 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16171  dimethyladenosine transferase  29.74 
 
 		 280 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.216071 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0251  dimethyladenosine transferase  29.85 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136998 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  29.28 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04645  dimethyladenosine transferase  30.42 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0575079  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1867  dimethyladenosine transferase  30.19 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1613  dimethyladenosine transferase  30.16 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1382  dimethyladenosine transferase  30.33 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.462909  normal  0.033279 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3351  predicted protein  28.21 
 
 		 281 aa  79.7  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07111  dimethyladenosine transferase  29.67 
 
 		 282 aa  79.3  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.139914 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  29.44 
 
 		 292 aa  79  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0464  dimethyladenosine transferase  31.11 
 
 		 282 aa  79  0.00000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00568188  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  27.7 
 
 		 292 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  29.73 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  29.44 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  29.44 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  29.44 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  29.44 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  29.73 
 
 		 271 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>