More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3158 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3158  protein of unknown function UPF0054  100 
 
 		 188 aa  382  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0124232  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3466  putative metalloprotease  62.07 
 
 		 177 aa  228  6e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3455  putative metalloprotease  62.07 
 
 		 177 aa  228  6e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3518  putative metalloprotease  62.07 
 
 		 177 aa  228  6e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3831  putative metalloprotease  58.7 
 
 		 184 aa  224  7e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2707  putative metalloprotease  57.87 
 
 		 178 aa  217  8.999999999999998e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12393  putative metalloprotease  60.92 
 
 		 182 aa  211  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2761  protein of unknown function UPF0054  65.91 
 
 		 179 aa  211  7e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.273254  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1250  putative metalloprotease  58.19 
 
 		 187 aa  197  9e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13590  putative metalloprotease  57.95 
 
 		 183 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.85661  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0845  putative metalloprotease  53.75 
 
 		 155 aa  170  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.673437  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1577  protein of unknown function UPF0054  57.24 
 
 		 186 aa  170  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15724  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2296  protein of unknown function UPF0054  55.41 
 
 		 160 aa  169  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2205  protein of unknown function UPF0054  56.58 
 
 		 150 aa  169  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.852425  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0790  putative metalloprotease  55.48 
 
 		 164 aa  168  4e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.118605 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2187  protein of unknown function UPF0054  57.96 
 
 		 153 aa  166  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.838874  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1659  protein of unknown function UPF0054  54 
 
 		 167 aa  164  5.9999999999999996e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0708  protein of unknown function UPF0054  52.12 
 
 		 162 aa  164  6.9999999999999995e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3246  protein of unknown function UPF0054  51.61 
 
 		 156 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00843166  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4626  hypothetical protein  53.25 
 
 		 156 aa  160  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1157  hypothetical protein  50.97 
 
 		 156 aa  160  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7048  protein of unknown function UPF0054  52.6 
 
 		 159 aa  158  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3452  putative metalloprotease  54.78 
 
 		 157 aa  158  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.113177 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3831  putative metalloprotease  55.48 
 
 		 170 aa  158  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1751  protein of unknown function UPF0054  57.24 
 
 		 150 aa  155  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0992531  normal  0.35985 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13480  conserved hypothetical protein TIGR00043  52.63 
 
 		 153 aa  155  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0978082 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1545  protein of unknown function UPF0054  51.97 
 
 		 151 aa  152  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3386  putative metalloprotease  50.63 
 
 		 173 aa  149  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.581061 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11740  conserved hypothetical protein TIGR00043  53.21 
 
 		 166 aa  149  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.372273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1913  putative metalloprotease  50 
 
 		 149 aa  147  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665718  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2231  putative metalloprotease  50 
 
 		 157 aa  146  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0010051  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17240  conserved hypothetical protein TIGR00043  52.63 
 
 		 153 aa  144  7.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17416  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1968  putative metalloprotease  47.4 
 
 		 157 aa  144  9e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000419167 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1268  putative metalloprotease  49.33 
 
 		 201 aa  142  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0863  metalloprotein, YbeY family  45.39 
 
 		 186 aa  141  6e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2113  putative metalloprotease  48 
 
 		 159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0595  putative metalloprotease  46.41 
 
 		 182 aa  135  4e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12330  conserved hypothetical protein TIGR00043  50.34 
 
 		 157 aa  121  8e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.37516  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  35.48 
 
 		 155 aa  99.8  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  36 
 
 		 155 aa  94  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  36 
 
 		 155 aa  94  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  38.51 
 
 		 156 aa  89  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  42.31 
 
 		 157 aa  89.4  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  41.18 
 
 		 156 aa  88.2  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  37.93 
 
 		 156 aa  87.8  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  37.93 
 
 		 156 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  37.93 
 
 		 156 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  36.67 
 
 		 156 aa  87  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  37.93 
 
 		 156 aa  87.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  37.93 
 
 		 156 aa  87.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  37.93 
 
 		 156 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  37.93 
 
 		 156 aa  87.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  38.93 
 
 		 156 aa  87  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  35.25 
 
 		 162 aa  83.6  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  31.69 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1270  protein of unknown function UPF0054  35.04 
 
 		 181 aa  82.4  0.000000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  41.18 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  39.82 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0023  hypothetical protein  35.71 
 
 		 190 aa  81.3  0.000000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1245  hypothetical protein  41.28 
 
 		 158 aa  80.9  0.00000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1186  putative metalloprotease  33.75 
 
 		 162 aa  80.5  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.685127  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  30.97 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  33.79 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  38.53 
 
 		 446 aa  79  0.00000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0016  hypothetical protein  38.74 
 
 		 190 aa  77.8  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0297149 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  36.77 
 
 		 156 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3619  hypothetical protein  36.36 
 
 		 185 aa  77.8  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  32.62 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  34.21 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0470  hypothetical protein  38.53 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  33.33 
 
 		 168 aa  74.3  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2444  hypothetical protein  42.06 
 
 		 166 aa  74.3  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0017  protein of unknown function UPF0054  36.7 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.276542 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  27.66 
 
 		 152 aa  72.8  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  34.78 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1501  putative metalloprotease  30.71 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.236796  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  36.7 
 
 		 171 aa  72  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0666  putative metalloprotease  29.63 
 
 		 165 aa  72  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0592  hypothetical protein  33.87 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1015  protein of unknown function UPF0054  33.12 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00876846  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  36.61 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2208  hypothetical protein  34.82 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  36.61 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0048  hypothetical protein  38.89 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02111  metal-dependent hydrolase  35.24 
 
 		 135 aa  70.5  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  34.11 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  40.98 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  31.9 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  36.89 
 
 		 157 aa  70.5  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  36.28 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  31.85 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1058  protein of unknown function UPF0054  38.61 
 
 		 131 aa  70.1  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1106  putative metalloprotease  28.48 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0793  protein of unknown function UPF0054  31.54 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000213383  normal  0.532433 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2126  hypothetical protein  37.29 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  35.4 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0774  putative metalloprotease  32.26 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0778  metal-dependent hydrolase  35.77 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0231681  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2911  hypothetical protein  30.2 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0822  putative metalloprotease  32.26 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>