87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1476 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3886  hypothetical protein  75.34 
 
 		 554 aa  811    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00540166  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1476  HNH endonuclease  100 
 
 		 586 aa  1192    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266278  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3616  hypothetical protein  94.05 
 
 		 204 aa  343  5e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0266  hypothetical protein  35.4 
 
 		 602 aa  263  8.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1666  hypothetical protein  35.58 
 
 		 557 aa  261  3e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0062  hypothetical protein  34.39 
 
 		 572 aa  150  4e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161525  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  41.86 
 
 		 567 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  41.86 
 
 		 484 aa  71.6  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0179  hypothetical protein  29.82 
 
 		 524 aa  67.8  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4917  hypothetical protein  28.4 
 
 		 508 aa  67.8  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.150474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5006  hypothetical protein  28.4 
 
 		 508 aa  67.8  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3935  hypothetical protein  28 
 
 		 514 aa  67  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0910355 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1291  hypothetical protein  31.52 
 
 		 582 aa  67  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322843  normal  0.107817 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4099  hypothetical protein  30.05 
 
 		 517 aa  65.5  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165873  normal  0.595439 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3422  hypothetical protein  35.71 
 
 		 620 aa  64.3  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.023087  normal  0.778813 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1180  hypothetical protein  29.82 
 
 		 519 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  35.54 
 
 		 553 aa  60.8  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0728  hypothetical protein  29.06 
 
 		 535 aa  60.5  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5188  hypothetical protein  30.36 
 
 		 586 aa  60.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0262711 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5065  hypothetical protein  30 
 
 		 506 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2144  hypothetical protein  30.36 
 
 		 593 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2714  hypothetical protein  30.36 
 
 		 601 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.707807  normal  0.117401 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5546  hypothetical protein  27.09 
 
 		 571 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3176  hypothetical protein  28.85 
 
 		 601 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436761  normal  0.0313411 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  24.71 
 
 		 539 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29150  hypothetical protein  33.33 
 
 		 502 aa  53.5  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15770  HNH endonuclease  32.79 
 
 		 360 aa  52.8  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3994  hypothetical protein  26.4 
 
 		 508 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00383359  normal  0.960587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3920  hypothetical protein  26.4 
 
 		 508 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  35.79 
 
 		 480 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4927  hypothetical protein  28.98 
 
 		 546 aa  52  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.929076 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  35.79 
 
 		 480 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  35.79 
 
 		 480 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00460  HNH endonuclease  34.55 
 
 		 565 aa  51.6  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.711457 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  31.52 
 
 		 464 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3819  HNH endonuclease  29.82 
 
 		 620 aa  51.2  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  35.06 
 
 		 519 aa  50.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  29.45 
 
 		 488 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  34.48 
 
 		 403 aa  49.7  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0807  HNH endonuclease  30.68 
 
 		 566 aa  48.5  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  32.48 
 
 		 578 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  34.48 
 
 		 405 aa  48.1  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  29.45 
 
 		 511 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  33.68 
 
 		 441 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  39.29 
 
 		 748 aa  48.1  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  35 
 
 		 566 aa  48.1  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4183  HNH endonuclease  32.93 
 
 		 434 aa  47.8  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5299  hypothetical protein  26.8 
 
 		 516 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0159919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0740  hypothetical protein  37.93 
 
 		 618 aa  47.4  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31690  hypothetical protein  36.71 
 
 		 577 aa  47  0.0009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4350  hypothetical protein  30.65 
 
 		 579 aa  47  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000306151  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11880  HNH endonuclease  35.21 
 
 		 594 aa  46.6  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  32.43 
 
 		 426 aa  47  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4097  hypothetical protein  31.62 
 
 		 578 aa  47  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.481016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  33.33 
 
 		 581 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3219  HNH endonuclease  32.93 
 
 		 427 aa  47  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125237  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3968  HNH nuclease  35.42 
 
 		 457 aa  46.6  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.737066  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4022  hypothetical protein  31.62 
 
 		 578 aa  47  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  33.33 
 
 		 581 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18410  hypothetical protein  34.18 
 
 		 521 aa  45.8  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.867748  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  38.03 
 
 		 551 aa  46.2  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0621  hypothetical protein  26.8 
 
 		 491 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06130  HNH endonuclease  35.44 
 
 		 561 aa  46.2  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02410  HNH endonuclease  31.58 
 
 		 198 aa  46.2  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2756  HNH nuclease  32.46 
 
 		 550 aa  46.2  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1272  HNH endonuclease  29.81 
 
 		 532 aa  45.8  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.250117 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0634  hypothetical protein  26.8 
 
 		 491 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  31.43 
 
 		 637 aa  45.4  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  35.53 
 
 		 628 aa  45.4  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  30 
 
 		 567 aa  45.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  31.62 
 
 		 578 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0612  hypothetical protein  26.8 
 
 		 491 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  34.48 
 
 		 605 aa  45.4  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02590  HNH endonuclease  34.09 
 
 		 169 aa  44.7  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  29.89 
 
 		 443 aa  44.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07870  hypothetical protein  35.21 
 
 		 555 aa  44.7  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  34.48 
 
 		 580 aa  44.7  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3187  HNH nuclease  36.92 
 
 		 404 aa  44.3  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  35.21 
 
 		 530 aa  43.9  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  29.09 
 
 		 443 aa  44.3  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  30.67 
 
 		 473 aa  43.9  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3127  HNH nuclease  30.46 
 
 		 474 aa  43.9  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0215087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1056  hypothetical protein  30.77 
 
 		 593 aa  43.9  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1274  HNH endonuclease  39.06 
 
 		 479 aa  43.9  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1040  hypothetical protein  30.77 
 
 		 593 aa  43.9  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35797  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 580 aa  43.9  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0314  hypothetical protein  25.42 
 
 		 512 aa  43.9  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.189609 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>