More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3720 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_3720  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
974 aa  2026    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3806  glycosyl transferase family protein  53.68 
 
 
605 aa  575  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2347  glycosyl transferase family 2  49.09 
 
 
1562 aa  267  7e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3822  glycosyl transferase family 2  45.45 
 
 
271 aa  246  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3739  glycosyl transferase family 2  47.2 
 
 
701 aa  241  5.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1549  glycosyl transferase family 2  48.94 
 
 
285 aa  219  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572491  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0526  glycosyl transferase family protein  48.55 
 
 
297 aa  204  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1541  glycosyl transferase family 2  39.02 
 
 
304 aa  156  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0929  hypothetical protein  48.26 
 
 
172 aa  155  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1853  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  38.43 
 
 
274 aa  152  4e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00329609  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2583  glycosyl transferase family 2  38.7 
 
 
296 aa  149  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0749  hypothetical protein  42.94 
 
 
173 aa  149  4.0000000000000006e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.4749  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3170  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
327 aa  147  8.000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1493  glycosyl transferase family protein  37.7 
 
 
286 aa  147  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.948959 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3037  glycosyl transferase family protein  38.1 
 
 
718 aa  142  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0052  hypothetical protein  45.35 
 
 
172 aa  139  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000148856  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4906  family 2 glycosyl transferase  35.34 
 
 
342 aa  137  8e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1233  glycosyl transferase family protein  39.42 
 
 
278 aa  136  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.784226  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2781  glycosyl transferase family 2  34.13 
 
 
295 aa  134  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.217678 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3050  glycosyl transferase family protein  37.66 
 
 
261 aa  134  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1097  glycosyl transferase family 2  38.2 
 
 
331 aa  134  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3148  glycosyl transferase family 2  39.32 
 
 
261 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0892  glycosyl transferase family protein  39.91 
 
 
279 aa  132  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0398957  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1822  glycosyl transferase family protein  38.83 
 
 
265 aa  130  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3249  glycosyl transferase family 2  37.23 
 
 
261 aa  130  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0399034  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5207  glycosyl transferase family 2  35.87 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3053  glycosyl transferase family protein  42.25 
 
 
310 aa  127  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3252  glycosyl transferase family 2  41.71 
 
 
310 aa  128  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.180036  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0712  glycosyl transferase family 2  34.07 
 
 
307 aa  127  8.000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2879  hypothetical protein  29.9 
 
 
323 aa  126  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0306  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 
268 aa  125  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0713  glycosyl transferase family 2  32.43 
 
 
307 aa  121  7.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3955  glycosyl transferase family protein  32.96 
 
 
288 aa  120  9e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167999  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  35.53 
 
 
1037 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2563  glycosyl transferase family 2  36.02 
 
 
274 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142563  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2574  glycosyl transferase family 2  31.9 
 
 
283 aa  120  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13831  hypothetical protein  33.89 
 
 
302 aa  119  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.906412  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1182  glycosyl transferase family 2  31.68 
 
 
269 aa  119  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0499207  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0852  b-glycosyltransferase  44.88 
 
 
318 aa  119  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0139255  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1152  glycosyl transferase family 2  29.36 
 
 
269 aa  117  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4932  glycosyl transferase family 2  35.45 
 
 
274 aa  116  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.399763 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2099  glycosyl transferase, family 2  30.93 
 
 
267 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3536  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.93 
 
 
851 aa  114  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000936493 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3321  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.93 
 
 
851 aa  114  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3284  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.93 
 
 
851 aa  114  9e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0268448  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3582  group 2 family glycosyl transferase  22.93 
 
 
851 aa  114  9e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3236  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.93 
 
 
851 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0853  b-glycosyltransferase  43.75 
 
 
325 aa  113  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180683  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1235  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 
249 aa  112  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2769  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  50.48 
 
 
329 aa  111  8.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3952  glycosyl transferase family protein  30.31 
 
 
328 aa  106  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3151  glycosyl transferase family 2  31.78 
 
 
286 aa  105  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  31.37 
 
 
235 aa  105  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3380  glycosyl transferase, group 2 family protein  21.91 
 
 
853 aa  104  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  8.74419e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1948  glycosyl transferase, group 2 family protein  21.72 
 
 
853 aa  104  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3798  glycosyl transferase family protein  32.98 
 
 
293 aa  104  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2596  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 
320 aa  103  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3159  glycosyl transferase family 2  28.91 
 
 
293 aa  103  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3185  glycosyl transferase family protein  34.93 
 
 
266 aa  103  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0269954  hitchhiker  0.00391718 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2592  glycosyl transferase family 2  35.83 
 
 
257 aa  102  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2026  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.47 
 
 
853 aa  101  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.739679  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1644  glycosyl transferase family 2  32.69 
 
 
256 aa  100  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2592  glycosyl transferase family 2  32.64 
 
 
256 aa  99.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.232443 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4931  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
244 aa  96.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1581  glycosyl transferase family 2  32.46 
 
 
273 aa  95.9  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.399238  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
299 aa  96.3  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0250  glycosyl transferase family 2  28 
 
 
247 aa  95.5  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  24.53 
 
 
1250 aa  95.5  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2515  glycosyl transferase family protein  34.24 
 
 
273 aa  95.1  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.467917  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0525  glycosyl transferase family protein  32.31 
 
 
285 aa  94  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1200  glycosyl transferase family 2  27.17 
 
 
319 aa  93.6  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0281003  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
857 aa  92.4  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  27.03 
 
 
338 aa  91.7  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3219  glycosyl transferase family protein  43 
 
 
268 aa  91.7  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4596  glycosyl transferase family 2  42.39 
 
 
270 aa  91.7  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 
333 aa  91.3  9e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4274  glycosyl transferase family 2  44.44 
 
 
249 aa  90.1  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467766  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2207  glycosyl transferase family 2  28.17 
 
 
335 aa  90.5  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0779  glycosyl transferase family 2  38.68 
 
 
296 aa  89.7  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.64 
 
 
341 aa  89.4  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1874  hypothetical protein  28.57 
 
 
249 aa  89.4  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.953191 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  30.52 
 
 
320 aa  89.7  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1158  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 
284 aa  89  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2081  glycosyl transferase family 2  29.39 
 
 
258 aa  88.2  7e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.15987 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3180  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 
249 aa  88.2  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.589075  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  26.21 
 
 
379 aa  87.4  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 
376 aa  87  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  26.55 
 
 
597 aa  87.4  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0310  glycosyl transferase family protein  45.45 
 
 
275 aa  87.4  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0112917  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  26.7 
 
 
312 aa  86.7  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 
313 aa  86.7  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4048  glycosyl transferase family 2  34.65 
 
 
252 aa  86.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0709  glycosyl transferase family 2  30.05 
 
 
249 aa  86.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  25.54 
 
 
335 aa  86.3  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4435  glycosyl transferase family 2  32.43 
 
 
284 aa  85.9  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.880972  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2345  glycosyl transferase family protein  28 
 
 
246 aa  86.3  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  26.8 
 
 
347 aa  86.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1316  glycosyl transferase family 2  29.9 
 
 
248 aa  85.5  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3220  glycosyl transferase family 2  35.45 
 
 
294 aa  85.5  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0738  glycosyl transferase family 2  29.56 
 
 
249 aa  84.3  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.751434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>